MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 265

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	CTG	2	6	198	203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014017	ACA	2	6	281	286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014017	TAA	2	6	1029	1034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014017	CAA	2	6	1037	1042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014017	ATA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014017	AAC	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014017	CAG	2	6	1561	1566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014017	TAA	2	6	1629	1634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014017	ATC	2	6	1649	1654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014017	AGC	2	6	1701	1706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014017	TAC	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014017	GCA	2	6	2487	2492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014017	TCA	2	6	2711	2716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014017	GCA	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014017	TGC	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014017	CGC	2	6	3098	3103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014017	CAG	2	6	3119	3124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014017	CAC	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_014017	TCA	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014017	CAT	2	6	3572	3577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014017	TGA	2	6	3620	3625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014017	CCG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014017	GTT	2	6	3663	3668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014017	ATT	2	6	3748	3753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014017	AAG	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014017	TCT	2	6	4150	4155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014017	TAT	2	6	6369	6374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014017	AAC	2	6	6422	6427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014017	CGC	2	6	6467	6472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014017	GAC	2	6	6549	6554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014017	CTG	2	6	6590	6595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014017	TCG	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014017	CAG	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014017	CAC	2	6	6813	6818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014017	CGC	2	6	6931	6936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014017	CAT	2	6	6958	6963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014017	TTA	2	6	7070	7075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014017	CCA	2	6	7180	7185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014017	TGT	2	6	7203	7208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014017	ATG	2	6	7246	7251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014017	AGC	2	6	7274	7279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014017	TCC	2	6	7368	7373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014017	CAG	2	6	7429	7434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014017	CAC	2	6	9043	9048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014017	ATC	2	6	9116	9121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014017	TGA	2	6	9187	9192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014017	ATC	2	6	9249	9254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014017	GTT	2	6	9385	9390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014017	GCG	2	6	9398	9403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014017	AGG	2	6	9417	9422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014017	GAT	2	6	9515	9520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014017	TAC	2	6	10156	10161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014017	TAA	2	6	10192	10197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014017	TCC	2	6	10295	10300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014017	ATT	2	6	10309	10314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014017	ATT	2	6	10348	10353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014017	TAT	2	6	10381	10386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014017	TAA	2	6	10453	10458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014017	ACA	2	6	10500	10505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014017	AAT	2	6	10622	10627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014017	TTG	2	6	12390	12395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014017	AAG	2	6	12424	12429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014017	TGC	2	6	12444	12449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014017	AGC	2	6	12452	12457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014017	AAT	2	6	12475	12480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014017	CGA	2	6	12586	12591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014017	GTT	2	6	12691	12696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014017	ATT	2	6	12705	12710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014017	TAA	2	6	13310	13315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014017	TAA	2	6	13377	13382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014017	ACA	2	6	13552	13557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014017	ATG	2	6	13582	13587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014017	TGC	2	6	13620	13625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014017	AAT	2	6	13627	13632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014017	AAT	2	6	13665	13670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014017	AAC	2	6	13679	13684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014017	GTC	2	6	13783	13788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014017	CAA	2	6	14024	14029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014017	AGA	2	6	15783	15788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014017	AGT	2	6	15870	15875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014017	TTC	2	6	15903	15908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014017	ATT	2	6	15981	15986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014017	TAT	2	6	16012	16017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014017	CTG	2	6	16050	16055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014017	TTG	2	6	16167	16172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014017	CTT	2	6	16213	16218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014017	GTT	2	6	16914	16919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014017	ATT	2	6	16928	16933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014017	ATT	2	6	16967	16972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014017	CAA	2	6	17100	17105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014017	CTA	2	6	17133	17138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014017	TTA	2	6	17181	17186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014017	TAA	2	6	17196	17201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014017	TCA	2	6	17326	17331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014017	TCC	2	6	18263	18268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_014017	GTG	2	6	19315	19320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014017	TTG	2	6	19382	19387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014017	AAT	2	6	20962	20967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014017	CAT	2	6	20977	20982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014017	TCA	2	6	21050	21055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014017	CGG	2	6	21087	21092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014017	AAT	2	6	21158	21163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014017	TCA	2	6	21224	21229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014017	CCT	2	6	21253	21258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014017	TTC	2	6	24908	24913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014017	CTC	2	6	24977	24982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014017	ACT	2	6	26032	26037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014017	TGC	2	6	26127	26132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014017	TCA	2	6	26251	26256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014017	GCC	2	6	31012	31017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014017	GGT	2	6	31033	31038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014017	TGG	2	6	31119	31124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014017	ATG	2	6	31187	31192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014017	TTG	2	6	33105	33110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014017	CAA	2	6	33213	33218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014017	ATA	2	6	33363	33368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014017	GTG	2	6	33505	33510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014017	GTT	2	6	33536	33541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014017	AAT	2	6	33549	33554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014017	CAC	2	6	33561	33566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014017	ATC	2	6	33590	33595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014017	TCT	2	6	33602	33607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014017	TAT	2	6	34037	34042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014017	TAA	2	6	34086	34091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014017	CGC	2	6	35087	35092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014017	AAT	2	6	35101	35106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014017	TGT	2	6	35108	35113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014017	TAA	2	6	35115	35120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014017	TTA	2	6	35140	35145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014017	ATC	2	6	35212	35217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014017	GGT	2	6	35230	35235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014017	ATG	2	6	38960	38965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014017	GGT	2	6	38969	38974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014017	ATT	2	6	39035	39040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014017	AAG	2	6	39137	39142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014017	CAG	2	6	39144	39149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014017	AGC	2	6	39181	39186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014017	ACA	2	6	39229	39234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014017	TAA	2	6	39241	39246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014017	TAT	2	6	42535	42540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014017	AGT	2	6	42664	42669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.