MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 21932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010159	GCA	2	6	640956	640961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_010159	TGAG	2	8	643946	643953	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_010159	CTG	2	6	643991	643996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_010159	TC	3	6	644119	644124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_010159	TTA	2	6	644159	644164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_010159	TA	3	6	644163	644168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_010159	ATT	2	6	644203	644208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_010159	GCTT	2	8	644225	644232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_010159	TAT	2	6	646799	646804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010159	TTTA	2	8	646811	646818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_010159	TAC	2	6	646824	646829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_010159	T	6	6	646859	646864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_010159	TAAAA	2	10	646928	646937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_010159	GAAT	2	8	648260	648267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_010159	TAA	2	6	648274	648279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_010159	AGGT	2	8	648281	648288	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_010159	T	6	6	649585	649590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_010159	TAAT	2	8	653290	653297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_010159	T	7	7	653301	653307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010159	ATGA	2	8	653365	653372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_010159	T	7	7	653385	653391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_010159	T	8	8	655446	655453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_010159	GCTG	2	8	655474	655481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_010159	TCAT	2	8	655518	655525	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3025	NC_010159	TA	3	6	655545	655550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_010159	CAA	2	6	655755	655760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_010159	AAC	2	6	655770	655775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3029	NC_010159	ATA	2	6	658348	658353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_010159	CCCA	2	8	658595	658602	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3031	NC_010159	TCT	2	6	659518	659523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_010159	TG	3	6	659525	659530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_010159	TTAA	2	8	659543	659550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_010159	AAT	2	6	659561	659566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3036	NC_010159	TTG	2	6	659585	659590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_010159	TCG	2	6	659606	659611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_010159	GTT	2	6	659709	659714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_010159	AGG	2	6	659795	659800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3042	NC_010159	ATT	2	6	660483	660488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3045	NC_010159	ATGA	2	8	665803	665810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010159	ATTT	2	8	665859	665866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3048	NC_010159	ATA	2	6	665928	665933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_010159	ATG	3	9	665949	665957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_010159	ATGAT	2	10	665963	665972	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_010159	GGA	2	6	667827	667832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_010159	AAT	2	6	668300	668305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_010159	TGA	2	6	669372	669377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_010159	ACT	2	6	669399	669404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3056	NC_010159	AT	3	6	670123	670128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_010159	CTG	2	6	670778	670783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_010159	T	8	8	670795	670802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_010159	GGA	2	6	671499	671504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_010159	TATT	2	8	671505	671512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_010159	AC	3	6	671578	671583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_010159	ATG	2	6	671598	671603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_010159	CGG	2	6	671612	671617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_010159	AGA	2	6	671620	671625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_010159	GA	3	6	671624	671629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3067	NC_010159	GAAT	2	8	671698	671705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_010159	TA	3	6	671708	671713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_010159	TG	3	6	671727	671732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_010159	TGA	2	6	671787	671792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_010159	ACTT	2	8	671826	671833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3072	NC_010159	T	6	6	671832	671837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_010159	ATT	2	6	671844	671849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_010159	AAT	2	6	671913	671918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_010159	ATTTT	2	10	672125	672134	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_010159	AT	3	6	672159	672164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_010159	ATT	2	6	672860	672865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_010159	T	6	6	672864	672869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_010159	TTC	2	6	672890	672895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_010159	TTA	3	9	672896	672904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_010159	T	6	6	672945	672950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_010159	TTTA	2	8	672978	672985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_010159	TAA	2	6	673039	673044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_010159	AGT	2	6	676314	676319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3098	NC_010159	TCACA	2	10	676596	676605	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3099	NC_010159	TA	3	6	676645	676650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3104	NC_010159	TTA	2	6	676911	676916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_010159	ATC	2	6	676943	676948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_010159	T	7	7	677010	677016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_010159	TTAG	2	8	677163	677170	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_010159	ATT	2	6	677289	677294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3114	NC_010159	TGG	2	6	677375	677380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3116	NC_010159	TGAT	2	8	677641	677648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_010159	GGA	2	6	677705	677710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3120	NC_010159	A	6	6	679150	679155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_010159	AT	3	6	679255	679260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_010159	CTT	2	6	679266	679271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_010159	T	7	7	679270	679276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_010159	A	6	6	679295	679300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_010159	TTA	2	6	679349	679354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3130	NC_010159	ATT	2	6	679611	679616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_010159	T	6	6	679757	679762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_010159	AAT	2	6	679811	679816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_010159	GCC	2	6	679859	679864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3134	NC_010159	ATT	2	6	679879	679884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_010159	AAT	2	6	679903	679908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_010159	A	8	8	679966	679973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_010159	GCT	2	6	679982	679987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3263	NC_010159	CAG	3	9	700018	700026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3269	NC_010159	T	7	7	700825	700831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_010159	ACCAT	2	10	700858	700867	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3271	NC_010159	ATG	2	6	701005	701010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3272	NC_010159	A	6	6	702356	702361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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