MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 21932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010159	TCA	2	6	316352	316357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_010159	CA	3	6	316384	316389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_010159	GCG	2	6	316390	316395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_010159	AAG	2	6	316406	316411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_010159	ACA	2	6	316449	316454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_010159	TGCC	2	8	316880	316887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_010159	TAT	2	6	316914	316919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_010159	ATT	2	6	316946	316951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_010159	ACAGCC	2	12	317650	317661	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_010159	A	6	6	317728	317733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_010159	CAT	2	6	318831	318836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_010159	TGT	2	6	318938	318943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_010159	TG	3	6	318987	318992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_010159	A	7	7	318993	318999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010159	TA	3	6	319032	319037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010159	T	7	7	319068	319074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010159	AGC	2	6	319136	319141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_010159	CAG	2	6	319191	319196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_010159	TTC	2	6	319443	319448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_010159	T	6	6	319470	319475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010159	GAA	2	6	319482	319487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_010159	AGT	2	6	319499	319504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_010159	GCG	2	6	321395	321400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_010159	A	7	7	321403	321409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010159	TTG	2	6	321424	321429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_010159	CCGA	2	8	321439	321446	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_010159	TAA	2	6	323336	323341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_010159	ATT	2	6	323354	323359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_010159	T	8	8	323370	323377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_010159	ACCA	2	8	323385	323392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_010159	CTCTC	2	10	323401	323410	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1532	NC_010159	A	6	6	323426	323431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_010159	ATGA	2	8	323459	323466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_010159	CCA	2	6	323589	323594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_010159	TAC	2	6	323726	323731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_010159	ATC	2	6	323733	323738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_010159	CTT	2	6	323752	323757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_010159	GCC	3	9	323813	323821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_010159	CAT	2	6	323846	323851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_010159	CGG	2	6	323866	323871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_010159	TTC	2	6	323934	323939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_010159	CCAG	2	8	323961	323968	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_010159	ATCA	2	8	324177	324184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_010159	ATG	2	6	324217	324222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010159	GGA	2	6	324254	324259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_010159	CTGG	2	8	324288	324295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_010159	AGC	2	6	324370	324375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_010159	TTC	2	6	324429	324434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_010159	AAAT	2	8	324930	324937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_010159	GTC	2	6	326864	326869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_010159	AAAG	2	8	326904	326911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_010159	AAT	2	6	326930	326935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_010159	GCG	2	6	326974	326979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_010159	TTCT	2	8	326992	326999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_010159	CTT	2	6	327049	327054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_010159	GTT	2	6	327153	327158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_010159	C	6	6	327218	327223	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1558	NC_010159	GTT	2	6	327276	327281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_010159	CATG	2	8	327326	327333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_010159	GCC	2	6	327416	327421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_010159	TCC	2	6	327478	327483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_010159	TAA	2	6	327562	327567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_010159	AAC	2	6	327707	327712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_010159	AAAT	2	8	328080	328087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_010159	TAAC	2	8	328109	328116	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_010159	CGAG	2	8	328154	328161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_010159	CTC	2	6	328419	328424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_010159	GTT	2	6	328483	328488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_010159	TGC	2	6	328493	328498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_010159	AGATGT	2	12	328570	328581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_010159	GAAA	2	8	328610	328617	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_010159	TTG	2	6	328690	328695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_010159	GAC	2	6	328703	328708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_010159	TAAAC	2	10	328770	328779	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1575	NC_010159	CAT	2	6	328896	328901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_010159	ATAA	2	8	328959	328966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_010159	GGGC	2	8	328975	328982	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_010159	ATC	2	6	329106	329111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_010159	CTC	2	6	329124	329129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_010159	CAG	2	6	329249	329254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_010159	GGC	2	6	329271	329276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_010159	GC	3	6	329307	329312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_010159	CTGG	2	8	329316	329323	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_010159	ACC	2	6	329337	329342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_010159	C	6	6	329395	329400	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1586	NC_010159	C	6	6	329518	329523	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1587	NC_010159	TCG	2	6	329542	329547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_010159	CGT	2	6	329616	329621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_010159	CCA	2	6	329732	329737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_010159	ATT	2	6	329806	329811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_010159	AT	4	8	329816	329823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_010159	AATTAA	2	12	329839	329850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_010159	CTT	2	6	329851	329856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_010159	TCA	2	6	332390	332395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_010159	TCA	2	6	332864	332869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_010159	CGTT	2	8	332882	332889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_010159	TCT	2	6	332892	332897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_010159	AGT	2	6	332941	332946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_010159	GGT	2	6	333054	333059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_010159	ATT	2	6	333107	333112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_010159	GCT	2	6	333152	333157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_010159	GCA	2	6	333190	333195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_010159	AGA	2	6	333282	333287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_010159	GCA	2	6	333310	333315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_010159	TGTT	2	8	333336	333343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_010159	TGT	2	6	333398	333403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_010159	A	6	6	333408	333413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_010159	ACA	2	6	333423	333428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_010159	AGAATC	2	12	333432	333443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1610	NC_010159	CAGT	2	8	333501	333508	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_010159	TA	3	6	333520	333525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_010159	ACT	2	6	333569	333574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_010159	AC	3	6	333587	333592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_010159	TTA	3	9	333764	333772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_010159	TAT	2	6	333785	333790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_010159	TCA	2	6	333793	333798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_010159	GAT	2	6	333803	333808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_010159	T	6	6	333818	333823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_010159	G	6	6	333896	333901	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_010159	TC	3	6	334045	334050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_010159	TCGC	2	8	334061	334068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_010159	A	6	6	334913	334918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_010159	TAT	2	6	334977	334982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_010159	GC	3	6	334984	334989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_010159	TGC	2	6	334998	335003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_010159	GCAAAT	2	12	335038	335049	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1627	NC_010159	TA	3	6	335062	335067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_010159	TG	3	6	335078	335083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_010159	ATC	2	6	335110	335115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_010159	GTA	2	6	335154	335159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_010159	GTG	2	6	335479	335484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_010159	TTA	2	6	335505	335510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_010159	TGCC	2	8	335582	335589	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_010159	CTG	2	6	335630	335635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1636	NC_010159	ATG	2	6	335670	335675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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