MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid new_pCD

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010157	TC	3	6	2149	2154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010157	AT	3	6	2776	2781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010157	GT	3	6	3007	3012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010157	AC	3	6	3093	3098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010157	AT	3	6	6167	6172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010157	AT	3	6	6365	6370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010157	AC	3	6	7204	7209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010157	AT	3	6	7319	7324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010157	CA	3	6	7331	7336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010157	TG	3	6	8228	8233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010157	AT	3	6	10065	10070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010157	AT	3	6	10320	10325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010157	AT	3	6	13333	13338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010157	TA	3	6	15277	15282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010157	TA	3	6	15285	15290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010157	TA	3	6	16854	16859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010157	AT	3	6	32837	32842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010157	AT	3	6	32859	32864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010157	TG	3	6	33206	33211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010157	AT	3	6	33711	33716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010157	TA	4	8	34946	34953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010157	AT	3	6	42113	42118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010157	TA	3	6	42678	42683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010157	GA	3	6	42855	42860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010157	AT	3	6	43197	43202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010157	AT	3	6	46329	46334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010157	TA	4	8	48995	49002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010157	AT	3	6	49081	49086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010157	AT	3	6	51818	51823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010157	GT	3	6	52089	52094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010157	GC	3	6	53379	53384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010157	GT	3	6	55810	55815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010157	GT	3	6	55967	55972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010157	CG	3	6	57448	57453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010157	TC	3	6	58827	58832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010157	AT	3	6	59542	59547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010157	AT	3	6	59664	59669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010157	TA	3	6	59952	59957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010157	AC	3	6	62845	62850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010157	TG	3	6	62866	62871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010157	AC	3	6	64098	64103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010157	TC	3	6	66258	66263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010157	CT	3	6	68146	68151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.