MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009381	TCCAG	2	10	8838	8847	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009381	GAACC	2	10	8994	9003	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009381	ATTTT	2	10	11123	11132	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009381	ATTTT	2	10	17910	17919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009381	GAAAA	2	10	20780	20789	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009381	CCATT	2	10	25511	25520	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009381	AATAC	2	10	35094	35103	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009381	AAAGA	2	10	35930	35939	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009381	TATTT	2	10	52457	52466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009381	TTAGT	2	10	55274	55283	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009381	TCCAG	2	10	56829	56838	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009381	GAACC	2	10	56985	56994	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009381	CTAAA	2	10	79384	79393	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009381	CTAGC	2	10	83459	83468	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009381	GGCGG	2	10	93941	93950	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009381	AATGA	2	10	109136	109145	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009381	AGCTG	2	10	113162	113171	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009381	CCATA	2	10	113469	113478	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009381	TAATT	2	10	122439	122448	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009381	AATTA	2	10	147910	147919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009381	AGGCT	2	10	176300	176309	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009381	CTTCC	2	10	179990	179999	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_009381	CTTTT	2	10	190755	190764	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009381	TTTAC	2	10	193346	193355	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009381	ATTTT	2	10	193601	193610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009381	TGAAT	2	10	193730	193739	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009381	AAGTT	2	10	204070	204079	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009381	AATCC	2	10	205439	205448	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009381	TCCCC	2	10	205811	205820	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
30	NC_009381	AAAGA	2	10	211674	211683	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009381	TCCAG	2	10	216621	216630	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009381	GAACC	2	10	216777	216786	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009381	AATGA	2	10	240587	240596	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009381	CTGCC	2	10	256435	256444	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_009381	GCTTG	2	10	262404	262413	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009381	CCGTT	2	10	269050	269059	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009381	CAGTA	2	10	270144	270153	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009381	TTAAC	2	10	288309	288318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009381	AGAAA	2	10	293868	293877	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009381	CAATT	2	10	294803	294812	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009381	ATTTT	2	10	303069	303078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009381	TATAA	2	10	333415	333424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009381	ATTCA	2	10	334698	334707	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009381	TGATA	2	10	342883	342892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009381	CTAAC	2	10	343879	343888	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009381	CAATT	2	10	344940	344949	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009381	AAGAA	2	10	345041	345050	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009381	AATGA	2	10	345236	345245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009381	TGGTT	2	10	350013	350022	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009381	GTTTT	2	10	386751	386760	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009381	GGAGG	2	10	393120	393129	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009381	TTTGC	2	10	393699	393708	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009381	TTTGC	2	10	393812	393821	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009381	GTGCT	2	10	403362	403371	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009381	AAAGC	2	10	404452	404461	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009381	ATTTA	2	10	412347	412356	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009381	TAAAA	2	10	413565	413574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009381	TTAAG	2	10	414307	414316	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009381	AAATT	2	10	422153	422162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009381	ATTTT	2	10	429062	429071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009381	TAATT	2	10	429186	429195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009381	CGTAA	2	10	429487	429496	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009381	CTCTG	2	10	447069	447078	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_009381	TTGTA	2	10	467727	467736	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009381	TATTT	2	10	468011	468020	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009381	TTAAA	2	10	469351	469360	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009381	CCACG	2	10	471835	471844	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_009381	AGTTT	2	10	473762	473771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009381	GAGAG	2	10	481091	481100	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009381	ACGCA	2	10	491321	491330	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_009381	TATTT	2	10	498966	498975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009381	ATGCC	2	10	500848	500857	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_009381	TCACT	2	10	503956	503965	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009381	TCGGT	2	10	517273	517282	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009381	ATTTA	2	10	535463	535472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009381	TTTAT	2	10	545235	545244	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009381	ATTTA	2	10	554310	554319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009381	ACTTA	2	10	562218	562227	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009381	TAACT	2	10	562235	562244	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009381	TAATT	2	10	574949	574958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009381	TAATT	2	10	575320	575329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009381	GGTTC	2	10	578585	578594	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009381	CTGGA	2	10	578741	578750	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009381	GCTGC	2	10	591382	591391	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_009381	AGGGA	2	10	592599	592608	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009381	ATTGT	2	10	596113	596122	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009381	TTGCT	2	10	597494	597503	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009381	GTTTA	2	10	597995	598004	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009381	TGCTC	2	10	600801	600810	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_009381	CTTTA	2	10	600888	600897	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_009381	TTCCC	2	10	600987	600996	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
92	NC_009381	ACTTA	2	10	616822	616831	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009381	CGGAT	2	10	650995	651004	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009381	ACACC	2	10	654303	654312	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_009381	GGGTT	2	10	657662	657671	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009381	CAGAG	2	10	659025	659034	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009381	TCAGT	2	10	672137	672146	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009381	TCATA	2	10	675130	675139	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009381	TAGTT	2	10	691124	691133	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009381	TTCTA	2	10	691434	691443	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009381	AATTA	2	10	691457	691466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009381	ATAAA	2	10	691814	691823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009381	CGCAG	2	10	692590	692599	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_009381	GGCGT	2	10	693147	693156	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009381	TGTTT	2	10	696261	696270	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009381	GTAGA	2	10	696881	696890	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009381	TTCAC	2	10	701044	701053	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009381	CTAGA	2	10	702610	702619	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009381	TAATC	2	10	709609	709618	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009381	ACTCT	2	10	711961	711970	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009381	TATTT	2	10	726379	726388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009381	ATTAA	2	10	731589	731598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009381	GAATG	2	10	731873	731882	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009381	ATCTG	2	10	736367	736376	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009381	AGCGT	2	10	738073	738082	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_009381	ATGTC	2	10	743162	743171	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009381	GCCAA	2	10	743976	743985	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009381	AAGTA	2	10	744233	744242	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009381	ATCAG	2	10	751263	751272	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009381	ATTTC	2	10	755835	755844	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009381	AATAA	2	10	770119	770128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009381	ATTAA	2	10	782793	782802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009381	TAAAT	2	10	784118	784127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009381	TAATT	2	10	784461	784470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009381	TTTAC	2	10	791664	791673	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009381	AAATA	2	10	792050	792059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009381	GGGAG	2	10	796500	796509	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009381	GTATC	2	10	796608	796617	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009381	CATAT	2	10	798230	798239	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009381	TAATA	2	10	799092	799101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009381	TAGGT	2	10	806655	806664	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009381	GTTGA	2	10	808332	808341	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009381	TTTTC	2	10	815817	815826	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009381	AATAT	2	10	837323	837332	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009381	GGATG	2	10	843775	843784	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009381	GCCCG	2	10	850906	850915	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_009381	GAAAT	2	10	854273	854282	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009381	AAATA	2	10	856438	856447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009381	TGGTT	2	10	856547	856556	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009381	TTTAG	2	10	858701	858710	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009381	GGGAT	2	10	865070	865079	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009381	AATTA	2	10	867180	867189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009381	ATTAT	2	10	875864	875873	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009381	ATTAT	2	10	875912	875921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009381	AACAA	2	10	876901	876910	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_009381	TTATT	2	10	877998	878007	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009381	CATAT	2	10	884795	884804	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_009381	AAAAT	2	10	1811254	1811263	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_009381	CTTTA	2	10	1812232	1812241	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_009381	AAGAC	2	10	1812521	1812530	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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412	NC_009381	TAAAA	2	10	2758341	2758350	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_009381	TGAAG	2	10	2808237	2808246	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
423	NC_009381	TGGGC	2	10	2811873	2811882	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
424	NC_009381	AAACA	2	10	2821636	2821645	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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487	NC_009381	TATTT	2	10	3195331	3195340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_009381	CAATA	2	10	3289971	3289980	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

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