MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 17625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009381	ATC	2	6	691718	691723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_009381	ATA	2	6	691750	691755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_009381	GTT	2	6	691768	691773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_009381	CTAC	2	8	691780	691787	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_009381	ATT	2	6	691790	691795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_009381	ATAAA	2	10	691814	691823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_009381	TGA	2	6	691996	692001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_009381	ATGG	2	8	692021	692028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_009381	ATT	2	6	692081	692086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_009381	TGG	2	6	692113	692118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_009381	GGT	2	6	692231	692236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_009381	CGA	2	6	692313	692318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_009381	TCTACC	2	12	692324	692335	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_009381	GCA	2	6	692519	692524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_009381	G	6	6	692527	692532	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_009381	CGCAG	2	10	692590	692599	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2517	NC_009381	CCAG	2	8	692643	692650	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2518	NC_009381	GCT	2	6	692672	692677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_009381	CTG	2	6	692844	692849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_009381	GCA	2	6	692863	692868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_009381	ACC	2	6	692906	692911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2522	NC_009381	TGG	2	6	692941	692946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_009381	TGC	2	6	693046	693051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_009381	TGC	2	6	693091	693096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_009381	GGCGT	2	10	693147	693156	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2526	NC_009381	TGC	2	6	693313	693318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_009381	TCG	4	12	693324	693335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_009381	AAC	2	6	693338	693343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_009381	AAT	2	6	693386	693391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_009381	TGG	2	6	693439	693444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_009381	TAGC	2	8	693747	693754	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2532	NC_009381	T	6	6	695243	695248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_009381	ATA	2	6	695341	695346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_009381	CTG	2	6	696235	696240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_009381	TGTTT	2	10	696261	696270	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_009381	ACTC	2	8	696275	696282	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2537	NC_009381	GC	3	6	696283	696288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2538	NC_009381	GTAGA	2	10	696881	696890	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_009381	GCC	2	6	698009	698014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2540	NC_009381	A	7	7	698044	698050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_009381	GTTA	2	8	698108	698115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_009381	CTG	2	6	698162	698167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_009381	GAG	2	6	698191	698196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_009381	TTCAC	2	10	701044	701053	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2545	NC_009381	CTAGA	2	10	702610	702619	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2546	NC_009381	GGA	2	6	702683	702688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_009381	TCAA	2	8	703292	703299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2548	NC_009381	AG	4	8	703300	703307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_009381	CTT	2	6	706722	706727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_009381	GAA	2	6	706760	706765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_009381	A	6	6	706899	706904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_009381	ATG	2	6	706959	706964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_009381	AAGA	2	8	706967	706974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_009381	GAA	2	6	706982	706987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_009381	TAATC	2	10	709609	709618	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2556	NC_009381	TC	3	6	709780	709785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2557	NC_009381	TA	3	6	709849	709854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_009381	G	6	6	709885	709890	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_009381	TA	3	6	709891	709896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_009381	GGGA	2	8	711152	711159	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_009381	CGG	2	6	711429	711434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_009381	GGC	2	6	711441	711446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_009381	GAA	2	6	711464	711469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_009381	GTC	2	6	711493	711498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_009381	ATG	2	6	711505	711510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_009381	GCT	2	6	711717	711722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_009381	ATT	2	6	711875	711880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_009381	TAA	2	6	711890	711895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_009381	TAA	3	9	711923	711931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_009381	ACTCT	2	10	711961	711970	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2571	NC_009381	CTG	2	6	712122	712127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_009381	TAAT	2	8	712750	712757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_009381	CAAA	2	8	712777	712784	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2574	NC_009381	CTA	2	6	712816	712821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_009381	TATT	2	8	712827	712834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_009381	CAA	2	6	713571	713576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_009381	T	6	6	713594	713599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_009381	GGGATA	2	12	713609	713620	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_009381	T	6	6	713631	713636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_009381	CG	3	6	713640	713645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2581	NC_009381	C	7	7	713725	713731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2582	NC_009381	CCAT	2	8	713822	713829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2583	NC_009381	ACTG	2	8	713852	713859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2584	NC_009381	TTA	2	6	713865	713870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_009381	TCAG	2	8	713880	713887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2586	NC_009381	AATT	2	8	713906	713913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_009381	CGG	2	6	716277	716282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_009381	AGT	2	6	716388	716393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_009381	GTG	2	6	716450	716455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_009381	GGA	2	6	716516	716521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_009381	T	6	6	716539	716544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_009381	ACC	2	6	716886	716891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2593	NC_009381	CAT	2	6	716982	716987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_009381	TGA	2	6	716988	716993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_009381	AAT	2	6	717017	717022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_009381	TC	3	6	717252	717257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2597	NC_009381	AATT	2	8	717269	717276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_009381	AAAT	2	8	717311	717318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_009381	GCG	2	6	717387	717392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_009381	AGT	2	6	718438	718443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_009381	T	6	6	718582	718587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_009381	GAT	2	6	719810	719815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_009381	TAA	2	6	719919	719924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_009381	CT	3	6	720039	720044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2605	NC_009381	CAA	2	6	720178	720183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_009381	TCA	2	6	720216	720221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_009381	ATAA	2	8	720271	720278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_009381	GAT	2	6	720281	720286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_009381	ATC	2	6	722142	722147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_009381	T	6	6	722159	722164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_009381	TGG	2	6	722194	722199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_009381	ATA	2	6	722263	722268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_009381	GGC	2	6	722274	722279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_009381	TA	3	6	722318	722323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_009381	AAT	2	6	722436	722441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_009381	TGA	3	9	722442	722450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_009381	GTT	2	6	722473	722478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_009381	G	6	6	722499	722504	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_009381	AGA	2	6	722547	722552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_009381	AGC	2	6	722607	722612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_009381	TTA	2	6	722673	722678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_009381	GGA	2	6	722727	722732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_009381	TTTG	2	8	722799	722806	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_009381	CAGA	2	8	722829	722836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2625	NC_009381	TCA	2	6	722886	722891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_009381	TAAA	2	8	722913	722920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_009381	ATT	2	6	722961	722966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_009381	GAA	2	6	723019	723024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_009381	GCT	2	6	723076	723081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2630	NC_009381	CAT	2	6	723150	723155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2632	NC_009381	CGT	2	6	726243	726248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_009381	TTG	2	6	726294	726299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_009381	GA	3	6	726317	726322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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