MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 17625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009381	TCA	2	6	262158	262163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_009381	GAA	2	6	262190	262195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_009381	CAC	2	6	262231	262236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_009381	T	8	8	262287	262294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_009381	GCTTG	2	10	262404	262413	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_009381	AC	3	6	262432	262437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_009381	TGG	2	6	263834	263839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009381	TGG	2	6	263866	263871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_009381	TCA	2	6	263879	263884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_009381	TAA	2	6	263943	263948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_009381	G	7	7	263967	263973	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009381	TCC	2	6	263978	263983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_009381	TA	3	6	264002	264007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009381	CTTT	2	8	264014	264021	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_009381	T	6	6	264023	264028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009381	A	6	6	264063	264068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009381	CTA	2	6	264074	264079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_009381	CGGG	2	8	264106	264113	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_009381	ACGG	2	8	265811	265818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_009381	TTA	2	6	265931	265936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009381	G	6	6	265939	265944	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009381	A	6	6	267225	267230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009381	ATAA	2	8	267347	267354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_009381	TCT	2	6	268352	268357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_009381	ATC	2	6	268372	268377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_009381	GGC	2	6	268471	268476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_009381	ATG	2	6	268500	268505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009381	TTAT	2	8	268566	268573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009381	GAT	2	6	268622	268627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009381	TG	3	6	268642	268647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009381	A	6	6	268660	268665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009381	GTT	2	6	268824	268829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009381	TATT	2	8	268835	268842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_009381	TATT	2	8	268849	268856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_009381	TTA	2	6	268869	268874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_009381	CAAA	2	8	268888	268895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_009381	CCG	2	6	268942	268947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_009381	AGC	2	6	268948	268953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_009381	T	7	7	268962	268968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_009381	ATA	2	6	269026	269031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009381	CCGTT	2	10	269050	269059	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1042	NC_009381	GAAA	2	8	269064	269071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009381	AAG	2	6	269074	269079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009381	CAG	2	6	270123	270128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_009381	CAGTA	2	10	270144	270153	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_009381	TCT	2	6	270212	270217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_009381	CG	3	6	276023	276028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_009381	T	7	7	276032	276038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009381	ATC	2	6	276058	276063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_009381	T	6	6	276088	276093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009381	TTA	2	6	276145	276150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_009381	GAAT	2	8	277033	277040	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_009381	TC	3	6	277089	277094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_009381	GCC	2	6	277099	277104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_009381	ATA	2	6	277142	277147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009381	ATCA	2	8	277164	277171	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_009381	ATA	2	6	277187	277192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009381	T	6	6	278683	278688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009381	AAC	2	6	279941	279946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_009381	ATGA	2	8	279965	279972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_009381	TTC	2	6	280038	280043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_009381	GAT	2	6	280052	280057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009381	T	6	6	280095	280100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_009381	A	7	7	280126	280132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009381	CAA	2	6	280274	280279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_009381	GGA	2	6	280853	280858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009381	TATT	2	8	280859	280866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009381	ATT	2	6	280930	280935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009381	CTTC	2	8	281161	281168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_009381	AAT	2	6	281169	281174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009381	GCC	2	6	281183	281188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_009381	TCTG	2	8	281257	281264	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_009381	CTC	2	6	281394	281399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_009381	ATT	2	6	281642	281647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_009381	GTCT	2	8	281673	281680	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_009381	AGG	2	6	281708	281713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_009381	C	6	6	282141	282146	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1078	NC_009381	ATTC	2	8	282656	282663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_009381	TA	3	6	282668	282673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_009381	ATT	2	6	282724	282729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009381	TAA	2	6	282748	282753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009381	AC	3	6	282866	282871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_009381	GAA	2	6	282879	282884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_009381	C	7	7	282910	282916	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1085	NC_009381	TAT	2	6	282955	282960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_009381	T	6	6	282986	282991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_009381	GGCA	2	8	283065	283072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_009381	CGT	2	6	284869	284874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_009381	AGG	2	6	284877	284882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009381	A	6	6	284935	284940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_009381	TGT	2	6	284991	284996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009381	GGGT	2	8	285014	285021	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009381	AGG	2	6	285034	285039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_009381	GAAA	2	8	285556	285563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_009381	AAG	2	6	285577	285582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009381	AG	3	6	288291	288296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009381	TTAAC	2	10	288309	288318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_009381	AAGG	2	8	288330	288337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009381	TCT	2	6	288342	288347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_009381	CGGG	2	8	288370	288377	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_009381	AG	3	6	288393	288398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009381	TTTG	2	8	288479	288486	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009381	CAGA	2	8	288509	288516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_009381	TCA	2	6	288566	288571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_009381	TAAA	2	8	288593	288600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009381	ATT	2	6	288641	288646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_009381	GCT	2	6	288758	288763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_009381	AGCC	2	8	288836	288843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_009381	TCC	2	6	288874	288879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_009381	ATT	2	6	288938	288943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_009381	A	6	6	288946	288951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_009381	ACA	2	6	288985	288990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_009381	T	6	6	289318	289323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009381	TGA	2	6	290379	290384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009381	A	6	6	290384	290389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009381	AAT	2	6	290398	290403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009381	ACA	2	6	290495	290500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_009381	TCA	2	6	290552	290557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_009381	AT	3	6	290579	290584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_009381	CA	3	6	290589	290594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_009381	GGC	2	6	290628	290633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_009381	TTG	2	6	290757	290762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_009381	ATG	2	6	290763	290768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_009381	TTG	2	6	290774	290779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009381	ATG	2	6	290780	290785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009381	TGGC	2	8	290791	290798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_009381	GTT	2	6	293540	293545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_009381	CACT	2	8	293551	293558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_009381	ATTC	2	8	293593	293600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_009381	TGC	2	6	293604	293609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_009381	GTT	2	6	293664	293669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_009381	CACT	2	8	293675	293682	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_009381	ATTC	2	8	293717	293724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_009381	TGC	2	6	293728	293733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_009381	GTT	2	6	293788	293793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_009381	CACC	2	8	293803	293810	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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1138	NC_009381	A	6	6	293875	293880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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