MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 chromosome

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008800	AACTAT	2	12	26840	26851	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008800	ACGAAA	2	12	36531	36542	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008800	TGCAGT	2	12	136266	136277	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008800	CTTGGC	2	12	145899	145910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008800	TACAAA	2	12	185795	185806	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008800	GTCTTG	2	12	258549	258560	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008800	CAGTGA	2	12	285458	285469	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008800	TGTATT	2	12	289071	289082	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008800	CATTTG	2	12	373650	373661	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008800	CATTGG	2	12	396523	396534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008800	TTTTTA	2	12	437973	437984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008800	GGGAAT	2	12	459491	459502	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008800	AAATAA	2	12	513355	513366	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008800	AAACAA	2	12	513511	513522	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008800	ATCTTT	2	12	521457	521468	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008800	GATCCA	2	12	536505	536516	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008800	TTGTTT	2	12	544475	544486	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008800	TGAAAA	2	12	561084	561095	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008800	AAAGCG	2	12	579975	579986	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008800	TGGTAT	2	12	584287	584298	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008800	CTGCTC	2	12	601766	601777	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008800	CTCTTT	2	12	604480	604491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008800	TTATCA	2	12	643477	643488	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008800	GATATT	2	12	643837	643848	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008800	AAAAAT	2	12	703364	703375	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008800	TTAACC	2	12	706557	706568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008800	ATCATA	2	12	713523	713534	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008800	ATGCTG	2	12	718559	718570	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008800	GGGTTT	2	12	752199	752210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008800	ATTTTT	2	12	765945	765956	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008800	GGTAAT	2	12	808312	808323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008800	TTCACT	2	12	847453	847464	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008800	ATATTG	2	12	869981	869992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008800	ATAAGA	2	12	908930	908941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008800	TATCGG	4	24	943166	943189	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008800	CGGCAG	2	12	955460	955471	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008800	AATGTG	2	12	962272	962283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008800	AGATTC	2	12	1011983	1011994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008800	TAAATA	2	12	1026798	1026809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008800	GTGGTC	2	12	1068202	1068213	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008800	TCACTT	2	12	1075546	1075557	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008800	ATTGGT	2	12	1080049	1080060	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008800	TTTAAT	2	12	1097280	1097291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008800	CCATTT	2	12	1124223	1124234	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008800	TTATTT	2	12	1155629	1155640	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008800	TGATTA	2	12	1196955	1196966	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008800	GTAGCT	2	12	1199173	1199184	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008800	TAAATA	2	12	1213467	1213478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008800	CATCTT	2	12	1215584	1215595	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008800	AGTAAC	2	12	1229315	1229326	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008800	TCAAAA	2	12	1250050	1250061	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008800	TATAAA	2	12	1263307	1263318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008800	TATTGA	2	12	1304956	1304967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008800	ATTTTA	2	12	1308760	1308771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008800	ATAAAT	2	12	1330493	1330504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008800	ATGCAA	2	12	1348348	1348359	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008800	AAATAT	2	12	1375835	1375846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008800	TATTTT	2	12	1402858	1402869	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008800	ATTAAT	2	12	1404624	1404635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008800	CGTTAT	2	12	1421901	1421912	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008800	CTTTGT	2	12	1454790	1454801	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008800	TTTTCT	2	12	1461168	1461179	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_008800	TTGGGT	2	12	1492667	1492678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008800	CTCCTG	3	18	1514631	1514648	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008800	TCAAAA	2	12	1514813	1514824	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008800	TAAAAA	2	12	1545279	1545290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008800	CTTAGA	2	12	1545463	1545474	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008800	AGAAAT	2	12	1565471	1565482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008800	TTAATC	2	12	1571813	1571824	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008800	TATTTT	2	12	1591772	1591783	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008800	ATGTTA	2	12	1609638	1609649	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008800	GTTTGG	2	12	1627983	1627994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008800	TTCCTG	2	12	1666390	1666401	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008800	ATTTTG	2	12	1669789	1669800	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008800	CTTTTT	2	12	1714733	1714744	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008800	GTATTT	2	12	1737760	1737771	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008800	ACAAAA	2	12	1756440	1756451	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008800	AAAGGG	2	12	1781258	1781269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008800	GAGCTT	2	12	1790441	1790452	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008800	ATTTAT	2	12	1843124	1843135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008800	GATTTT	2	12	1844035	1844046	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008800	TGGCGC	2	12	1853793	1853804	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008800	ATCACA	2	12	1856290	1856301	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008800	AAAGGG	2	12	1858323	1858334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008800	CAGCAT	2	12	1884969	1884980	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008800	GTTTAT	2	12	1885080	1885091	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008800	GGCTTC	2	12	1925168	1925179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008800	ATTTTT	2	12	1942140	1942151	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008800	ATTTAT	2	12	1942177	1942188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008800	AGCCAT	2	12	1995107	1995118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008800	TCGACC	2	12	1995204	1995215	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008800	TATCCA	2	12	2005253	2005264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008800	ATTTAT	2	12	2010296	2010307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008800	CATACT	2	12	2013410	2013421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008800	CTCTGG	2	12	2019436	2019447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008800	TTAACA	2	12	2023935	2023946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_008800	TAAACT	2	12	2025682	2025693	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008800	ATTGTC	2	12	2026226	2026237	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_008800	CGGCTA	2	12	2030807	2030818	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008800	ATTCTA	2	12	2062731	2062742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_008800	GGTTAT	2	12	2064530	2064541	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008800	AAATGA	2	12	2086897	2086908	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008800	ACGGAA	2	12	2090526	2090537	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008800	TCTTTA	2	12	2099546	2099557	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_008800	AAAGGG	2	12	2102668	2102679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008800	TTTTGC	2	12	2134225	2134236	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_008800	AATGTT	2	12	2143614	2143625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008800	TATTAA	2	12	2154821	2154832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008800	TGATAA	2	12	2156183	2156194	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008800	GGGGCT	2	12	2192830	2192841	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008800	CTTTAA	2	12	2222004	2222015	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008800	TGTACA	2	12	2223549	2223560	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_008800	TCTACC	2	12	2230252	2230263	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008800	GAAAAA	2	12	2237386	2237397	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008800	AACAGC	2	12	2245674	2245685	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008800	TTATAA	2	12	2264973	2264984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008800	CTTTCA	2	12	2271660	2271671	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008800	ATCATT	2	12	2325392	2325403	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_008800	AATCAC	2	12	2341836	2341847	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008800	CTTCAT	2	12	2355808	2355819	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008800	TTACCT	2	12	2411854	2411865	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008800	CAAAAA	2	12	2436286	2436297	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_008800	GATGCT	2	12	2436377	2436388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_008800	AAAAAT	2	12	2446396	2446407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008800	ATTTTC	2	12	2468572	2468583	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008800	TATTTT	2	12	2563539	2563550	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008800	TGACAT	2	12	2567168	2567179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_008800	GAAACC	2	12	2639032	2639043	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008800	ATCACC	2	12	2661298	2661309	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008800	ATTAAC	2	12	2690477	2690488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_008800	GTAAAA	2	12	2705683	2705694	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008800	ATTGTT	2	12	2722527	2722538	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008800	GATTTA	2	12	2728163	2728174	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_008800	GCGATC	2	12	2784233	2784244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_008800	TTAATT	2	12	2963402	2963413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_008800	CTATTA	2	12	3142237	3142248	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.