MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 16049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008149	GAG	2	6	1023641	1023646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_008149	TGAA	2	8	1023697	1023704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_008149	ATC	2	6	1023732	1023737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_008149	A	6	6	1023812	1023817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_008149	ATAA	2	8	1023825	1023832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_008149	ACA	2	6	1023843	1023848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_008149	G	6	6	1023854	1023859	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_008149	TCA	2	6	1023926	1023931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_008149	TAAT	2	8	1023978	1023985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_008149	GAG	2	6	1024051	1024056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_008149	TAT	2	6	1024695	1024700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_008149	ACT	2	6	1024727	1024732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_008149	GCG	2	6	1024759	1024764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_008149	GTA	2	6	1024774	1024779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_008149	AAT	2	6	1024797	1024802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_008149	CGGT	2	8	1024805	1024812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3517	NC_008149	T	6	6	1024812	1024817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_008149	GAA	2	6	1025392	1025397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_008149	G	6	6	1025400	1025405	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_008149	ATGT	2	8	1025416	1025423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_008149	TG	3	6	1025426	1025431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_008149	TAAT	2	8	1025452	1025459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_008149	ATT	2	6	1025489	1025494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_008149	T	6	6	1025505	1025510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_008149	ATT	2	6	1025571	1025576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_008149	T	6	6	1025649	1025654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_008149	GCC	2	6	1025678	1025683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_008149	T	6	6	1025691	1025696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_008149	ATC	2	6	1025703	1025708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_008149	ATA	2	6	1025803	1025808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_008149	CT	3	6	1026198	1026203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_008149	ATC	2	6	1026223	1026228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_008149	TACT	2	8	1026238	1026245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_008149	GCTG	2	8	1026318	1026325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3535	NC_008149	GATGT	2	10	1026330	1026339	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_008149	GC	3	6	1027334	1027339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_008149	GC	3	6	1027345	1027350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_008149	GGC	2	6	1027367	1027372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_008149	GC	3	6	1027387	1027392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_008149	A	8	8	1027404	1027411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_008149	A	6	6	1027416	1027421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_008149	TAT	2	6	1027434	1027439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_008149	TTG	2	6	1027440	1027445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_008149	ATA	2	6	1027543	1027548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_008149	TCAC	2	8	1028585	1028592	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_008149	TGC	2	6	1028635	1028640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_008149	TCAC	2	8	1028709	1028716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_008149	AATA	2	8	1028746	1028753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_008149	TGC	2	6	1028776	1028781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_008149	TCAC	2	8	1028850	1028857	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_008149	AATA	2	8	1028887	1028894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_008149	TCAC	2	8	1028983	1028990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_008149	AATA	2	8	1029020	1029027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_008149	TCA	2	6	1029031	1029036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_008149	TGT	2	6	1029085	1029090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_008149	CCGA	2	8	1029103	1029110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_008149	TGC	2	6	1029124	1029129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_008149	GAT	2	6	1034112	1034117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_008149	AAAT	2	8	1034184	1034191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_008149	A	8	8	1034230	1034237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_008149	CAAC	2	8	1037521	1037528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_008149	AAT	2	6	1037532	1037537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_008149	TGC	2	6	1037576	1037581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_008149	ATA	2	6	1037639	1037644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_008149	CAT	2	6	1037678	1037683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_008149	GAT	2	6	1037711	1037716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_008149	GTT	2	6	1037773	1037778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_008149	T	6	6	1037911	1037916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_008149	A	6	6	1039325	1039330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_008149	T	6	6	1040806	1040811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_008149	AAT	2	6	1040834	1040839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_008149	TCT	2	6	1040858	1040863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_008149	CT	3	6	1040871	1040876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_008149	GTGA	2	8	1040931	1040938	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_008149	TTC	2	6	1040964	1040969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_008149	TG	3	6	1040978	1040983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_008149	CGA	2	6	1041025	1041030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_008149	CGG	2	6	1041043	1041048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_008149	ATT	2	6	1041084	1041089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_008149	TATC	2	8	1041097	1041104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_008149	AATA	2	8	1041119	1041126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_008149	TAA	2	6	1041135	1041140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_008149	AGC	2	6	1043162	1043167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_008149	T	7	7	1043200	1043206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_008149	ATA	2	6	1043218	1043223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_008149	ATA	2	6	1044029	1044034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_008149	CGC	2	6	1044048	1044053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_008149	TTAA	2	8	1044103	1044110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_008149	CTTAAT	2	12	1044121	1044132	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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3591	NC_008149	GATT	2	8	1044145	1044152	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_008149	AGT	2	6	1044153	1044158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_008149	CCTG	2	8	1045954	1045961	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_008149	TCA	2	6	1045977	1045982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_008149	GCA	2	6	1045990	1045995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_008149	GCT	2	6	1046004	1046009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_008149	A	6	6	1046025	1046030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_008149	AC	3	6	1046067	1046072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_008149	AAT	3	9	1046074	1046082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_008149	ATT	3	9	1046093	1046101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_008149	T	6	6	1046118	1046123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_008149	ATG	2	6	1046219	1046224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_008149	A	7	7	1046253	1046259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_008149	ACTG	2	8	1046274	1046281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3605	NC_008149	TGA	2	6	1047001	1047006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_008149	AATA	2	8	1047014	1047021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_008149	CAGC	2	8	1047853	1047860	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_008149	GCC	2	6	1047880	1047885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_008149	GCA	2	6	1047956	1047961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_008149	T	6	6	1049101	1049106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_008149	ACA	2	6	1049136	1049141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_008149	ATT	2	6	1050304	1050309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_008149	AG	4	8	1050324	1050331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_008149	ACT	2	6	1050374	1050379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_008149	ATC	2	6	1053608	1053613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_008149	T	6	6	1053655	1053660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_008149	CAA	2	6	1053778	1053783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_008149	GGA	2	6	1054357	1054362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_008149	TATT	2	8	1054363	1054370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_008149	CAA	2	6	1054489	1054494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_008149	GGA	2	6	1055068	1055073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_008149	TATT	2	8	1055074	1055081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_008149	AATT	2	8	1055135	1055142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_008149	CCA	2	6	1055157	1055162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_008149	TTC	2	6	1055165	1055170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_008149	TAT	2	6	1055185	1055190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_008149	TAA	2	6	1055203	1055208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_008149	TAAA	2	8	1055235	1055242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_008149	A	7	7	1055973	1055979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_008149	TAA	2	6	1055989	1055994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_008149	TGT	2	6	1056601	1056606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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