MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 16049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008149	CCTT	2	8	262410	262417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_008149	TGA	2	6	262500	262505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008149	TC	3	6	262625	262630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_008149	TTTC	2	8	262641	262648	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_008149	AGCA	2	8	262663	262670	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_008149	ACC	2	6	262693	262698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_008149	CAT	2	6	263938	263943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_008149	T	7	7	263992	263998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008149	GTG	2	6	264061	264066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008149	AG	3	6	264073	264078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008149	TTTGC	2	10	264103	264112	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1012	NC_008149	GTT	2	6	264126	264131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008149	GGTT	2	8	264152	264159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008149	CAG	2	6	265101	265106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_008149	GTCTT	2	10	265121	265130	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1016	NC_008149	TAC	2	6	265256	265261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_008149	CAA	2	6	266514	266519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_008149	GT	3	6	266571	266576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008149	TCTT	2	8	266630	266637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_008149	ATT	2	6	266750	266755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008149	T	6	6	267286	267291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008149	TCA	2	6	267772	267777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_008149	GAC	2	6	267855	267860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_008149	ATA	2	6	267984	267989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008149	TTC	2	6	272087	272092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_008149	TGG	2	6	272127	272132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008149	CTA	2	6	276445	276450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_008149	AAAT	2	8	276453	276460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008149	TCC	2	6	276462	276467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_008149	TTG	2	6	277041	277046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008149	CAA	2	6	277163	277168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_008149	GA	3	6	277198	277203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008149	T	8	8	277226	277233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008149	T	8	8	277255	277262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008149	GTTTT	2	10	277268	277277	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008149	TGTT	2	8	277293	277300	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008149	GTC	2	6	277313	277318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_008149	C	6	6	277318	277323	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1039	NC_008149	AAAC	2	8	277362	277369	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_008149	GCCA	2	8	277385	277392	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_008149	GTG	2	6	277393	277398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008149	GTG	2	6	283132	283137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008149	A	6	6	283322	283327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008149	TGCT	2	8	283412	283419	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_008149	CTG	2	6	283443	283448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_008149	GGC	2	6	283465	283470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_008149	A	6	6	284002	284007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008149	CAA	2	6	284069	284074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_008149	GAAA	2	8	284894	284901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008149	G	6	6	284902	284907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008149	CTTT	2	8	284921	284928	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_008149	A	6	6	284948	284953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008149	AAT	2	6	287724	287729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008149	CTGT	2	8	288391	288398	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_008149	G	6	6	288408	288413	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008149	ATA	2	6	288809	288814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008149	G	8	8	288819	288826	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008149	GCT	2	6	289536	289541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_008149	CAT	2	6	290956	290961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_008149	TA	3	6	290976	290981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008149	TTC	2	6	292613	292618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_008149	TTC	2	6	292635	292640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_008149	GCA	2	6	292822	292827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_008149	CATC	2	8	292886	292893	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_008149	CA	3	6	292901	292906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_008149	AGT	2	6	292961	292966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008149	ACCA	2	8	293008	293015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_008149	TG	3	6	293059	293064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008149	GGCA	2	8	293097	293104	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_008149	ATA	2	6	293108	293113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008149	GCT	2	6	293197	293202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_008149	CAAA	2	8	293228	293235	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_008149	GGC	2	6	293277	293282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_008149	AGT	2	6	293317	293322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008149	TAC	2	6	293324	293329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_008149	GCG	2	6	293341	293346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_008149	ACT	2	6	293391	293396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_008149	TAG	2	6	293488	293493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008149	CGA	2	6	293516	293521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_008149	GCA	2	6	293590	293595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_008149	GT	3	6	293643	293648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008149	GAA	2	6	293649	293654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008149	GAG	2	6	293683	293688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_008149	AGA	2	6	293732	293737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_008149	CAG	2	6	293758	293763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_008149	G	6	6	293905	293910	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008149	GGA	2	6	293949	293954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008149	GGC	2	6	293969	293974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_008149	GAA	2	6	294212	294217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008149	TGC	2	6	294288	294293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_008149	GTC	2	6	294300	294305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_008149	TTG	2	6	294361	294366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008149	TGG	2	6	294378	294383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_008149	GGA	2	6	294414	294419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008149	TCA	2	6	294439	294444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_008149	AC	3	6	294465	294470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_008149	AC	3	6	294634	294639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_008149	GTAG	2	8	294675	294682	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008149	CCT	2	6	294775	294780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_008149	CA	3	6	294809	294814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_008149	TGA	2	6	294822	294827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008149	CCG	2	6	295142	295147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_008149	TC	3	6	295184	295189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_008149	AAT	2	6	295191	295196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_008149	CGA	2	6	295352	295357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_008149	GCG	2	6	295491	295496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_008149	GAG	2	6	295507	295512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008149	TG	3	6	295532	295537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_008149	G	6	6	295652	295657	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008149	TCC	2	6	295662	295667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_008149	CTGA	2	8	295682	295689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_008149	GTAC	2	8	295766	295773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_008149	GTG	2	6	295793	295798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008149	GGA	2	6	295970	295975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008149	GAA	2	6	296168	296173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008149	AC	3	6	296188	296193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_008149	CGTC	2	8	296206	296213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_008149	AAC	2	6	296225	296230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_008149	AGC	2	6	296315	296320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_008149	CAT	2	6	296321	296326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_008149	AAAG	2	8	296329	296336	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008149	GTT	2	6	296424	296429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008149	G	6	6	296666	296671	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008149	AGGCT	2	10	296679	296688	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1125	NC_008149	TGA	2	6	296768	296773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008149	CAC	2	6	296779	296784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_008149	GGT	2	6	296867	296872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008149	GA	3	6	296897	296902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008149	GCTG	2	8	297010	297017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_008149	TAA	2	6	297026	297031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008149	CGG	2	6	297151	297156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_008149	ATG	2	6	297227	297232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008149	ACC	2	6	297422	297427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_008149	TGG	2	6	297482	297487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_008149	TCC	2	6	297508	297513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_008149	GGA	2	6	297525	297530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008149	AGCT	2	8	297585	297592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1271	NC_008149	T	6	6	333928	333933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_008149	ATC	2	6	333934	333939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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