MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 16049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008149	ATG	2	6	114045	114050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008149	ATTC	2	8	114092	114099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_008149	GGA	2	6	114107	114112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008149	AT	3	6	114383	114388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008149	TGG	2	6	114405	114410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008149	TTAA	2	8	114493	114500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008149	ATT	2	6	114589	114594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008149	A	6	6	114608	114613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008149	ATA	2	6	114615	114620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008149	TG	3	6	114634	114639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008149	TAA	2	6	114676	114681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008149	GTAG	2	8	114723	114730	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008149	GCA	2	6	114731	114736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_008149	TGC	2	6	114779	114784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_008149	CAG	2	6	115000	115005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008149	ACC	2	6	120606	120611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_008149	TAA	2	6	120615	120620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008149	TAA	2	6	121212	121217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008149	TTGA	2	8	121234	121241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008149	AT	4	8	121246	121253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008149	TAT	2	6	121272	121277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008149	T	8	8	121318	121325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008149	ATT	3	9	121333	121341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008149	TTA	2	6	121426	121431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008149	AAT	2	6	121432	121437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008149	T	6	6	121449	121454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008149	TTA	2	6	121460	121465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008149	AG	3	6	121466	121471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008149	TAT	2	6	121522	121527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008149	AT	3	6	121534	121539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008149	T	6	6	121551	121556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008149	TAAA	2	8	121580	121587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008149	CTAAA	2	10	121681	121690	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
534	NC_008149	ATG	2	6	121694	121699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008149	TTA	2	6	121730	121735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008149	T	6	6	121744	121749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008149	GCGT	2	8	121754	121761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
538	NC_008149	A	6	6	121817	121822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008149	GATG	2	8	121865	121872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008149	GAC	2	6	121918	121923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_008149	GTT	2	6	123194	123199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_008149	ATAA	2	8	124079	124086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008149	ATTTT	2	10	124091	124100	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008149	TAAC	2	8	124171	124178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_008149	TAA	2	6	124194	124199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008149	AGC	2	6	124222	124227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_008149	ATT	2	6	124605	124610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008149	TGCG	2	8	124690	124697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
549	NC_008149	A	6	6	124709	124714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008149	GCAG	2	8	124715	124722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
551	NC_008149	T	8	8	124723	124730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008149	AGC	2	6	126842	126847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_008149	AGT	2	6	126854	126859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008149	ATA	2	6	126864	126869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008149	AC	3	6	126973	126978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_008149	AAG	2	6	130338	130343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008149	T	7	7	130480	130486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008149	GGT	2	6	130594	130599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008149	CCA	2	6	130681	130686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_008149	TG	3	6	131985	131990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008149	TAGC	2	8	131991	131998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_008149	TA	3	6	132039	132044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008149	TA	3	6	132055	132060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008149	ACGCC	2	10	132099	132108	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
565	NC_008149	T	6	6	132119	132124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008149	AAT	2	6	132212	132217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008149	GGC	2	6	132232	132237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_008149	TGAA	2	8	132282	132289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008149	TACA	2	8	132301	132308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
570	NC_008149	ATC	2	6	132385	132390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_008149	TGT	2	6	132452	132457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008149	AG	3	6	132468	132473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008149	TGA	2	6	133599	133604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008149	AGT	2	6	134755	134760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008149	TGTA	2	8	134761	134768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008149	TA	3	6	134797	134802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008149	TCA	2	6	134839	134844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_008149	CTTG	2	8	138495	138502	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
579	NC_008149	GA	3	6	138553	138558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008149	ATC	2	6	138574	138579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_008149	ATG	2	6	138605	138610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008149	CTT	2	6	145933	145938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_008149	CGC	2	6	145946	145951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_008149	GCG	2	6	145960	145965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_008149	CTAA	2	8	146006	146013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_008149	TAGTGG	2	12	146140	146151	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008149	CTG	2	6	146188	146193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_008149	TTCA	2	8	146275	146282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_008149	AAT	2	6	146305	146310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_008149	AT	3	6	146331	146336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008149	CAT	2	6	146370	146375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_008149	ATA	2	6	146380	146385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008149	CAGT	2	8	146413	146420	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
594	NC_008149	TAT	2	6	147853	147858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008149	CAT	2	6	147901	147906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_008149	TTC	2	6	147907	147912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_008149	A	6	6	147914	147919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008149	GTA	2	6	147946	147951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008149	TG	3	6	148058	148063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008149	GGT	2	6	148074	148079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008149	ACG	2	6	148093	148098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_008149	AAG	2	6	148123	148128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008149	TGG	2	6	148132	148137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008149	TGG	2	6	148230	148235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008149	TCCC	2	8	148296	148303	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
606	NC_008149	CAC	2	6	148308	148313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_008149	TTA	2	6	148330	148335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_008149	GA	3	6	148357	148362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008149	AGC	2	6	148375	148380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_008149	CT	3	6	148450	148455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_008149	AGA	2	6	148470	148475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008149	T	8	8	148493	148500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008149	GACC	2	8	148538	148545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
614	NC_008149	C	6	6	148555	148560	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
615	NC_008149	TCC	2	6	148574	148579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_008149	ATT	2	6	148609	148614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008149	CTG	2	6	148634	148639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_008149	AT	3	6	148748	148753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_008149	CGT	2	6	148777	148782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_008149	ATGA	2	8	148838	148845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008149	A	7	7	148855	148861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008149	TTA	2	6	148867	148872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008149	TTA	2	6	148882	148887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008149	CTG	2	6	148925	148930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_008149	TTA	2	6	148982	148987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008149	TCA	2	6	149090	149095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_008149	TGAG	2	8	149113	149120	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008149	TTG	2	6	149130	149135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008149	T	7	7	149181	149187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_008149	CAA	2	6	149305	149310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_008149	GGA	2	6	149884	149889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008149	TATT	2	8	149890	149897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008149	AGC	2	6	149919	149924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_008149	A	7	7	154142	154148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008149	CAA	2	6	154193	154198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_008149	ATGT	2	8	154199	154206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_008149	TGA	2	6	154238	154243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008149	T	6	6	154505	154510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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