MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 16049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008149	T	6	6	1554399	1554404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_008149	CGA	2	6	1554454	1554459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_008149	T	8	8	1554466	1554473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_008149	T	7	7	1554479	1554485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_008149	AGC	2	6	1554542	1554547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_008149	TA	3	6	1554594	1554599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_008149	AATG	2	8	1554665	1554672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_008149	TCT	2	6	1558545	1558550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_008149	T	6	6	1558550	1558555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_008149	TTG	3	9	1558581	1558589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_008149	GTCA	2	8	1558632	1558639	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5512	NC_008149	TCC	2	6	1559605	1559610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_008149	TCAA	2	8	1559651	1559658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5514	NC_008149	TAA	2	6	1559711	1559716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_008149	TTA	2	6	1559719	1559724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_008149	TAA	3	9	1559725	1559733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_008149	ATC	2	6	1559800	1559805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_008149	ATT	2	6	1559820	1559825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_008149	CTA	2	6	1561083	1561088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_008149	TAT	2	6	1561113	1561118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_008149	CTT	2	6	1561181	1561186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_008149	GGCAG	2	10	1561241	1561250	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5523	NC_008149	TAA	2	6	1561267	1561272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_008149	G	7	7	1561371	1561377	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_008149	TTA	2	6	1561386	1561391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_008149	CTG	2	6	1563756	1563761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_008149	TC	3	6	1563884	1563889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_008149	AGT	2	6	1565371	1565376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_008149	ATT	2	6	1565383	1565388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_008149	GAAT	2	8	1565501	1565508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_008149	G	6	6	1565526	1565531	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_008149	AAAT	2	8	1565542	1565549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_008149	A	7	7	1565564	1565570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_008149	GTT	2	6	1565587	1565592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_008149	T	6	6	1565619	1565624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_008149	AT	3	6	1565638	1565643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_008149	T	6	6	1565649	1565654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_008149	CTT	2	6	1565671	1565676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_008149	TTA	2	6	1565681	1565686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_008149	TAAA	2	8	1565691	1565698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_008149	TAA	2	6	1565702	1565707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_008149	T	6	6	1565722	1565727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_008149	TAA	2	6	1565773	1565778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_008149	ATTA	2	8	1565783	1565790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_008149	AT	3	6	1565806	1565811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_008149	ATTTA	2	10	1565815	1565824	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_008149	ATT	2	6	1565841	1565846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_008149	AAT	2	6	1565856	1565861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_008149	GC	3	6	1565888	1565893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5550	NC_008149	GA	3	6	1565897	1565902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_008149	A	7	7	1565958	1565964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_008149	CCA	2	6	1565965	1565970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_008149	GAGGC	2	10	1568533	1568542	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5554	NC_008149	TAA	2	6	1568559	1568564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_008149	TC	3	6	1568643	1568648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_008149	TAT	2	6	1568662	1568667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_008149	TAAG	2	8	1568806	1568813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_008149	AAT	2	6	1572024	1572029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_008149	ATG	2	6	1572102	1572107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_008149	A	6	6	1572112	1572117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_008149	T	6	6	1572145	1572150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_008149	TGA	2	6	1572229	1572234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_008149	TAA	2	6	1575530	1575535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_008149	GA	3	6	1577773	1577778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_008149	CAT	2	6	1577816	1577821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_008149	GCA	2	6	1577827	1577832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_008149	T	7	7	1577854	1577860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_008149	CAA	2	6	1577978	1577983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_008149	GGA	2	6	1578557	1578562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_008149	TATT	2	8	1578563	1578570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_008149	TGTT	2	8	1578589	1578596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_008149	TCT	2	6	1579117	1579122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5574	NC_008149	TGT	2	6	1581223	1581228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_008149	CT	3	6	1581449	1581454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5576	NC_008149	TGT	2	6	1581496	1581501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_008149	AAT	2	6	1581568	1581573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5579	NC_008149	GTA	2	6	1581617	1581622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5581	NC_008149	T	7	7	1581666	1581672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_008149	AAGT	2	8	1582731	1582738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5588	NC_008149	T	6	6	1584795	1584800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_008149	TAA	2	6	1584818	1584823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_008149	T	6	6	1584857	1584862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_008149	TGA	2	6	1584871	1584876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5593	NC_008149	GTA	2	6	1587207	1587212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5595	NC_008149	ATC	2	6	1588336	1588341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5598	NC_008149	GTG	2	6	1588506	1588511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5601	NC_008149	AATT	2	8	1588622	1588629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_008149	TCAA	2	8	1588641	1588648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_008149	TGG	2	6	1588660	1588665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_008149	CATGC	2	10	1588697	1588706	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5605	NC_008149	ATA	2	6	1588745	1588750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_008149	ATA	2	6	1588860	1588865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_008149	ATG	2	6	1588872	1588877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5609	NC_008149	GCT	2	6	1588900	1588905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_008149	ATA	2	6	1588916	1588921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_008149	TCC	2	6	1588926	1588931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_008149	TTG	2	6	1589505	1589510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_008149	A	6	6	1589628	1589633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_008149	GCC	2	6	1589647	1589652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5615	NC_008149	TTA	2	6	1591106	1591111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5618	NC_008149	ACG	2	6	1591195	1591200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5621	NC_008149	GCG	2	6	1591287	1591292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_008149	GTT	2	6	1591297	1591302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5626	NC_008149	TGT	2	6	1591452	1591457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5629	NC_008149	TC	3	6	1591559	1591564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5630	NC_008149	TAG	2	6	1591576	1591581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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