MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pCD

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008122	TA	3	6	2191	2196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008122	TC	3	6	2534	2539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008122	AT	4	8	2710	2717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008122	AT	3	6	3276	3281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008122	TA	4	8	10441	10448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008122	TA	3	6	11677	11682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008122	AG	3	6	11887	11892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008122	TG	3	6	12039	12044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008122	CA	3	6	12183	12188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008122	TA	3	6	12530	12535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008122	AT	3	6	12553	12558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008122	TA	3	6	28536	28541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008122	TA	3	6	30105	30110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008122	AT	3	6	30112	30117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008122	TA	3	6	32182	32187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008122	AT	3	6	32281	32286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008122	TA	4	8	33468	33475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008122	TA	3	6	33686	33691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008122	AT	3	6	35196	35201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008122	AT	3	6	35451	35456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008122	CT	3	6	36049	36054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008122	TA	3	6	39150	39155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008122	TA	3	6	39348	39353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008122	GT	3	6	42423	42428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008122	AC	3	6	42509	42514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008122	AT	3	6	42740	42745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008122	GA	3	6	43367	43372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008122	TA	3	6	44216	44221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008122	GA	3	6	47446	47451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008122	GT	3	6	49606	49611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008122	TA	3	6	49975	49980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008122	AC	3	6	50837	50842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008122	GT	3	6	50859	50864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008122	TA	3	6	53752	53757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008122	GT	3	6	53885	53890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008122	AT	3	6	54040	54045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008122	AT	3	6	54162	54167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008122	AC	3	6	57737	57742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008122	GC	3	6	60325	60330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008122	AT	3	6	61902	61907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008122	AT	3	6	64648	64653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008122	TA	4	8	64732	64739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008122	TA	3	6	67399	67404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008122	GT	3	6	69461	69466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.