MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYV

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006153	GGGC	2	8	4449	4456	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_006153	TTAT	3	12	4495	4506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006153	CACT	2	8	5956	5963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006153	CAGT	2	8	6406	6413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_006153	ATCC	2	8	6633	6640	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006153	GCCA	3	12	7274	7285	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006153	CCTC	2	8	10837	10844	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_006153	GCGG	2	8	11203	11210	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_006153	CCTG	2	8	13711	13718	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006153	GAAA	2	8	14726	14733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006153	ATAA	2	8	14905	14912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006153	ATTT	2	8	15069	15076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006153	ACAA	2	8	15371	15378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006153	GGGA	2	8	16588	16595	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006153	AGCC	2	8	21873	21880	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006153	TAAA	2	8	23074	23081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006153	CTTT	2	8	25490	25497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006153	TCAG	2	8	25602	25609	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006153	CCCT	2	8	26294	26301	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_006153	CCGG	2	8	27313	27320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006153	TGTT	2	8	27381	27388	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006153	ATAA	2	8	32131	32138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006153	TTAT	2	8	32299	32306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006153	TTAT	2	8	34932	34939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006153	ATAA	2	8	34987	34994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006153	TTAA	2	8	36523	36530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006153	TGTT	2	8	52608	52615	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006153	CTTT	2	8	52643	52650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_006153	GAAA	2	8	52653	52660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006153	AGGG	2	8	52836	52843	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006153	CGCA	2	8	53293	53300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006153	TTAT	2	8	54535	54542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006153	ATAA	2	8	61894	61901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006153	TTTA	2	8	64336	64343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006153	AATA	2	8	64352	64359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006153	TTAA	2	8	65783	65790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006153	CGGA	2	8	66082	66089	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_006153	CTTT	2	8	67040	67047	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_006153	CAGG	2	8	67183	67190	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_006153	AGAA	2	8	67225	67232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.