MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCD1

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005813	GC	3	6	5105	5110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005813	AC	3	6	6411	6416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_005813	AT	3	6	6682	6687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005813	AT	3	6	9428	9433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005813	TA	4	8	9512	9519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005813	TA	3	6	12179	12184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005813	GT	3	6	14241	14246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005813	TA	3	6	15311	15316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005813	TC	3	6	15654	15659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_005813	AT	4	8	15830	15837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005813	AT	3	6	16396	16401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005813	TA	4	8	23561	23568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005813	TA	3	6	24797	24802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005813	CA	3	6	25303	25308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_005813	TA	3	6	25650	25655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005813	AT	3	6	25673	25678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005813	TA	3	6	41640	41645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005813	TA	3	6	43209	43214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005813	AT	3	6	43216	43221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005813	TA	3	6	45160	45165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005813	AT	3	6	45259	45264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005813	AT	3	6	48174	48179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005813	AT	3	6	48429	48434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005813	CA	3	6	50266	50271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_005813	TA	3	6	52128	52133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005813	TA	3	6	52326	52331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005813	GT	3	6	55401	55406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005813	AC	3	6	55487	55492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_005813	AT	3	6	55718	55723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005813	TA	3	6	57194	57199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005813	GA	3	6	60426	60431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005813	GT	3	6	62586	62591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005813	GT	3	6	63839	63844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005813	CA	3	6	66373	66378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_005813	TA	3	6	66732	66737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005813	GT	3	6	66865	66870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005813	AT	3	6	67020	67025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005813	AT	3	6	67142	67147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005813	GA	3	6	67857	67862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005813	TC	3	6	68682	68687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.