MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 chromosome

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005810	ACGAAA	2	12	32783	32794	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_005810	TCTCCC	2	12	36972	36983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_005810	AGGGTG	2	12	72742	72753	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005810	CGCCTG	2	12	135604	135615	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_005810	ATCTTT	2	12	136825	136836	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_005810	AACACC	2	12	183743	183754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_005810	CCTCAG	2	12	187683	187694	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_005810	CCATAT	2	12	264858	264869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_005810	AATTTA	2	12	267003	267014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005810	TGGTTA	2	12	275059	275070	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005810	ATCGGT	2	12	284483	284494	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_005810	TTTTGA	2	12	289049	289060	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005810	AGCCTT	2	12	308776	308787	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_005810	GCTGGT	2	12	333103	333114	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_005810	TTATAA	2	12	359751	359762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005810	AAACTC	2	12	378810	378821	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_005810	TCAGTA	2	12	411685	411696	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_005810	AATTAT	2	12	420361	420372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005810	TGAAAT	2	12	420582	420593	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005810	AATTAA	2	12	432742	432753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005810	GAAAGT	2	12	521836	521847	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005810	TTAATC	2	12	542226	542237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_005810	ATTTTT	2	12	560071	560082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005810	GAGTGA	2	12	587105	587116	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005810	TTTCTT	2	12	588143	588154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_005810	CAGTGT	2	12	677276	677287	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_005810	CAGGTA	2	12	694247	694258	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_005810	TGGCCC	2	12	758974	758985	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_005810	CTTAAT	2	12	796717	796728	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_005810	TACAAA	2	12	823004	823015	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_005810	ACTGAA	2	12	846808	846819	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_005810	AAAAAG	2	12	854353	854364	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005810	GGATAT	2	12	895509	895520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005810	ATAAAG	2	12	896050	896061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005810	AAAGGG	2	12	941921	941932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005810	AACCAA	2	12	972237	972248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_005810	ATTACT	7	42	1012920	1012961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_005810	TATTTA	2	12	1016101	1016112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005810	TTAGGC	2	12	1036727	1036738	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_005810	GATTGA	2	12	1046836	1046847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005810	CTTCAT	2	12	1046860	1046871	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_005810	CCTGGC	2	12	1055756	1055767	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_005810	GTTATT	2	12	1078335	1078346	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005810	GCTAAA	2	12	1109438	1109449	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_005810	AGAATC	2	12	1152146	1152157	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_005810	GCAAAT	2	12	1153752	1153763	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_005810	GCCACG	2	12	1169523	1169534	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_005810	AGCTGT	2	12	1172615	1172626	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_005810	TGGCTC	2	12	1191411	1191422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_005810	TAACCG	2	12	1195780	1195791	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_005810	ACGCTA	2	12	1201623	1201634	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_005810	TGCAAA	2	12	1202890	1202901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_005810	CGCTAA	2	12	1212496	1212507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005810	GCTCCT	2	12	1218396	1218407	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_005810	CCCAGA	2	12	1271771	1271782	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_005810	ACCGCA	2	12	1323572	1323583	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_005810	ATTTTG	2	12	1356983	1356994	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005810	TAAATT	2	12	1370699	1370710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005810	TAAAAA	2	12	1386303	1386314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005810	GATCAC	2	12	1386565	1386576	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_005810	ATCTAT	2	12	1394090	1394101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_005810	CAAATG	2	12	1580170	1580181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_005810	AATTTT	2	12	1592480	1592491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005810	ACCGGC	2	12	1595924	1595935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_005810	TTATTG	2	12	1644333	1644344	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005810	TTATTG	2	12	1663485	1663496	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005810	AAAAAT	2	12	1673790	1673801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005810	CACAAA	2	12	1680110	1680121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_005810	TATCCC	2	12	1710479	1710490	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_005810	AATAAA	2	12	1756407	1756418	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005810	ACCACG	2	12	1781252	1781263	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_005810	GCCACT	2	12	1791639	1791650	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_005810	AAAAAT	2	12	1828394	1828405	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005810	TGTTAG	2	12	1849725	1849736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005810	ATCAAC	5	30	1885869	1885898	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_005810	ATAATG	2	12	1893326	1893337	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005810	AATCGA	2	12	1916790	1916801	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_005810	AAAAAG	2	12	1924626	1924637	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005810	GCATTA	2	12	1942893	1942904	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_005810	TGATCA	2	12	1951974	1951985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_005810	GACCGC	2	12	1980964	1980975	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_005810	AGCGTC	2	12	1995013	1995024	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_005810	TCATAT	2	12	2015533	2015544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_005810	ATTGGT	2	12	2017677	2017688	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005810	GGTGGG	2	12	2018420	2018431	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005810	ATGGCG	2	12	2019451	2019462	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_005810	ACCCAA	2	12	2051212	2051223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_005810	AAAAAT	2	12	2087432	2087443	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005810	ATTTAA	2	12	2087495	2087506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005810	GTGTGA	2	12	2100696	2100707	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005810	TGGATG	2	12	2103333	2103344	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005810	GGGGGC	2	12	2103894	2103905	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_005810	TTCAAA	2	12	2118817	2118828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_005810	AAATAC	2	12	2125104	2125115	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_005810	TTGTCT	2	12	2141649	2141660	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_005810	TGAAAA	2	12	2182285	2182296	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005810	GGGAGA	2	12	2189538	2189549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005810	GGGAGA	2	12	2189711	2189722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005810	AGCATC	2	12	2212608	2212619	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_005810	TGTTTT	2	12	2212694	2212705	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005810	TTGGTC	2	12	2220363	2220374	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_005810	AGGTAA	2	12	2236868	2236879	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005810	CTTATT	2	12	2245229	2245240	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_005810	AACGGC	2	12	2273197	2273208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_005810	TGGTTC	2	12	2273480	2273491	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_005810	ATGCAG	2	12	2298674	2298685	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_005810	CCAAAG	2	12	2385491	2385502	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_005810	TATCAA	2	12	2385544	2385555	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_005810	GTTGTA	2	12	2429177	2429188	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005810	GCCTGT	2	12	2431150	2431161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_005810	AGTAAT	2	12	2460699	2460710	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005810	AATTTG	2	12	2471790	2471801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005810	TCATTT	2	12	2475240	2475251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_005810	GGATGA	7	42	2541106	2541147	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005810	ATAAAT	2	12	2541497	2541508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005810	CGGTGA	2	12	2579551	2579562	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_005810	ACTATC	2	12	2590913	2590924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_005810	AACAGA	2	12	2658329	2658340	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_005810	AGAAAA	2	12	2661455	2661466	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005810	ATAACG	2	12	2685603	2685614	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_005810	TGGCGG	2	12	2704107	2704118	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_005810	TTTTAA	2	12	2738286	2738297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005810	TCACTT	2	12	2738963	2738974	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_005810	GGCTGT	2	12	2769357	2769368	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_005810	ATAAGG	2	12	2770185	2770196	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005810	GGATAA	2	12	2820260	2820271	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005810	AAATGT	2	12	2821409	2821420	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005810	GGTATA	2	12	2823206	2823217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005810	CGTCAC	2	12	2845728	2845739	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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133	NC_005810	ATGCGT	2	12	2952855	2952866	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.