MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003143	TTA	2	6	211710	211715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_003143	ATA	2	6	211989	211994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_003143	T	6	6	212021	212026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_003143	AT	4	8	212106	212113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_003143	CTT	2	6	212124	212129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_003143	GTA	2	6	212130	212135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_003143	A	7	7	212135	212141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_003143	CA	5	10	212188	212197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_003143	T	9	9	213120	213128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_003143	TTA	2	6	213264	213269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_003143	AGT	2	6	215181	215186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_003143	A	6	6	215222	215227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_003143	T	6	6	215236	215241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_003143	TAAG	2	8	215632	215639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_003143	AAC	2	6	215700	215705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_003143	AGT	2	6	216196	216201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_003143	AAG	2	6	216225	216230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_003143	CT	3	6	218419	218424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_003143	ATTA	2	8	219655	219662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_003143	T	6	6	219697	219702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_003143	CAA	2	6	219823	219828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_003143	GGA	2	6	220402	220407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_003143	TATT	2	8	220408	220415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_003143	AAT	2	6	220425	220430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_003143	TAC	2	6	220731	220736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_003143	CGT	2	6	221274	221279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_003143	T	6	6	221311	221316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_003143	CTT	2	6	221351	221356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_003143	GTCA	2	8	221376	221383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_003143	AATTA	2	10	221399	221408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_003143	GCTT	2	8	221442	221449	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_003143	CTG	2	6	221451	221456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_003143	CCTA	2	8	221479	221486	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_003143	TGG	2	6	221491	221496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_003143	GAG	2	6	221610	221615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_003143	AAT	2	6	221634	221639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_003143	GAG	2	6	222633	222638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_003143	GGA	2	6	223553	223558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_003143	AGG	2	6	224687	224692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_003143	ATA	2	6	226634	226639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_003143	T	6	6	226665	226670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_003143	AGT	3	9	226765	226773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_003143	GGA	2	6	228795	228800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_003143	AGCC	2	8	232377	232384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_003143	TAG	2	6	232461	232466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_003143	GCT	2	6	233240	233245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_003143	GA	4	8	233259	233266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_003143	AG	3	6	233903	233908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_003143	A	7	7	235348	235354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_003143	T	7	7	235369	235375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_003143	CCA	2	6	235380	235385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_003143	TAC	3	9	235413	235421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_003143	TTAA	2	8	235457	235464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_003143	GTT	2	6	235473	235478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_003143	TTAA	2	8	235495	235502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_003143	ATT	2	6	235522	235527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_003143	ATC	2	6	235549	235554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_003143	TTG	2	6	235573	235578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_003143	T	6	6	235687	235692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_003143	ATG	2	6	235711	235716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_003143	TAT	2	6	236246	236251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_003143	TAC	2	6	236277	236282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_003143	TCT	2	6	236516	236521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_003143	ATGA	2	8	237038	237045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_003143	AAT	2	6	237060	237065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_003143	TAT	2	6	237069	237074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_003143	ATT	2	6	237099	237104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_003143	ATT	2	6	237148	237153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_003143	A	6	6	239882	239887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_003143	TAT	2	6	239952	239957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_003143	AGT	2	6	241477	241482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_003143	TA	3	6	243182	243187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_003143	CA	3	6	245144	245149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_003143	AATG	2	8	245152	245159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_003143	AGA	2	6	248651	248656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_003143	TC	3	6	250681	250686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_003143	GCC	2	6	250709	250714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_003143	TA	3	6	250715	250720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_003143	GGC	2	6	250721	250726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_003143	GTT	2	6	252707	252712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_003143	AAT	2	6	252713	252718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_003143	GA	3	6	252746	252751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_003143	T	6	6	252764	252769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_003143	GGC	2	6	252771	252776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_003143	GTG	2	6	252826	252831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_003143	GGA	2	6	252854	252859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_003143	TAAA	2	8	252961	252968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_003143	TGT	2	6	252969	252974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_003143	TTA	2	6	252976	252981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_003143	TTA	2	6	253007	253012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_003143	AATTAA	2	12	253029	253040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_003143	A	7	7	253039	253045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_003143	TATT	2	8	253070	253077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_003143	T	6	6	253089	253094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_003143	T	7	7	253103	253109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_003143	TGTT	2	8	253117	253124	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_003143	GCG	2	6	253149	253154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_003143	A	6	6	253194	253199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_003143	T	6	6	253242	253247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_003143	CCT	2	6	253251	253256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_003143	TATC	2	8	253342	253349	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_003143	CAG	3	9	254883	254891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_003143	TGA	2	6	254906	254911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_003143	CAT	2	6	254953	254958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_003143	ATTT	2	8	254989	254996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_003143	TAA	2	6	255011	255016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_003143	T	7	7	258516	258522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_003143	ATT	2	6	258662	258667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_003143	ATT	2	6	261721	261726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_003143	TAT	2	6	261762	261767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_003143	TAT	2	6	261826	261831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_003143	AATT	2	8	263033	263040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_003143	T	6	6	263039	263044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_003143	GAT	2	6	263055	263060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_003143	GGGC	2	8	264045	264052	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_003143	TAAA	2	8	264077	264084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_003143	ATC	2	6	264172	264177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_003143	A	6	6	264181	264186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_003143	AGGG	2	8	264206	264213	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_003143	TATCT	2	10	270624	270633	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1121	NC_003143	AAT	2	6	273515	273520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_003143	TAT	2	6	273546	273551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_003143	AAT	2	6	273555	273560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_003143	TTA	2	6	273565	273570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_003143	TA	3	6	273569	273574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_003143	CTG	2	6	273584	273589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_003143	TC	3	6	273712	273717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_003143	TTA	2	6	273752	273757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_003143	TA	3	6	273756	273761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_003143	ATT	2	6	273796	273801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_003143	GCTT	2	8	273818	273825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_003143	TAT	2	6	276392	276397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_003143	TTTA	2	8	276404	276411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_003143	TAC	2	6	276417	276422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_003143	T	6	6	276452	276457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_003143	AAAAT	2	10	276528	276537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_003143	GAAT	2	8	277853	277860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_003143	TAA	2	6	277867	277872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1273	NC_003143	ATA	2	6	316366	316371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_003143	TACT	2	8	316381	316388	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1281	NC_003143	CGT	2	6	317359	317364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1380	NC_003143	CTA	2	6	345559	345564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1400	NC_003143	GCG	2	6	356962	356967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1402	NC_003143	AGA	2	6	357033	357038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1403	NC_003143	GA	3	6	357055	357060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_003143	ATG	2	6	357083	357088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1405	NC_003143	CAGA	2	8	357097	357104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1406	NC_003143	A	6	6	358444	358449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_003143	TTGTA	2	10	359988	359997	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_003143	TGC	2	6	360014	360019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_003143	ATG	2	6	360030	360035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_003143	ACC	2	6	360066	360071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1411	NC_003143	GAT	2	6	360089	360094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_003143	TGC	2	6	360096	360101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_003143	GAT	2	6	360154	360159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_003143	TAA	2	6	360198	360203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_003143	CAC	2	6	360236	360241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1416	NC_003143	TAG	2	6	360247	360252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1418	NC_003143	TGA	2	6	360370	360375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_003143	TTA	2	6	361017	361022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_003143	CTTT	2	8	361052	361059	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1422	NC_003143	A	7	7	361105	361111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_003143	T	7	7	361117	361123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1436	NC_003143	ACCTC	2	10	363607	363616	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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1438	NC_003143	G	6	6	363696	363701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_003143	TTTG	2	8	363704	363711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_003143	TGC	2	6	363718	363723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_003143	T	6	6	364296	364301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_003143	GCT	2	6	364343	364348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1445	NC_003143	TTCA	2	8	364433	364440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1446	NC_003143	AG	3	6	364490	364495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_003143	CTTG	2	8	364520	364527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1448	NC_003143	TAC	2	6	365575	365580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_003143	ATT	2	6	366308	366313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1453	NC_003143	GCTG	2	8	366345	366352	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1454	NC_003143	GAC	2	6	366354	366359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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