MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003143	TCA	2	6	104797	104802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_003143	A	6	6	104878	104883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_003143	TTTCGG	2	12	104980	104991	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
504	NC_003143	GCAAG	2	10	105022	105031	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
505	NC_003143	GTTG	2	8	105062	105069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_003143	CAA	2	6	105106	105111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_003143	ATCA	2	8	105134	105141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
508	NC_003143	GT	3	6	105193	105198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_003143	CGC	2	6	105202	105207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_003143	A	6	6	105209	105214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_003143	AGTC	2	8	105227	105234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_003143	TGC	2	6	105290	105295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_003143	T	6	6	105363	105368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_003143	ACC	2	6	105450	105455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_003143	CCAG	2	8	105460	105467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
516	NC_003143	CCA	2	6	105468	105473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_003143	CAT	2	6	105482	105487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_003143	ATG	2	6	105519	105524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_003143	TTG	2	6	105537	105542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_003143	ACG	2	6	105584	105589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_003143	CCA	2	6	105615	105620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_003143	CGTT	2	8	107522	107529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
523	NC_003143	GAT	2	6	107597	107602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_003143	ATA	2	6	107876	107881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_003143	T	6	6	107900	107905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_003143	AAT	2	6	108009	108014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_003143	CAA	2	6	108035	108040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_003143	GAC	2	6	108042	108047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_003143	ATTA	2	8	108153	108160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_003143	GAA	2	6	108184	108189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_003143	TAAAT	2	10	108207	108216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_003143	ATCC	2	8	108225	108232	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
533	NC_003143	CTG	2	6	108275	108280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_003143	ACG	2	6	108309	108314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_003143	T	6	6	108334	108339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_003143	CGG	2	6	109625	109630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_003143	TGC	2	6	109641	109646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_003143	CAT	2	6	109669	109674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_003143	A	6	6	109693	109698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_003143	ATT	2	6	109749	109754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_003143	T	6	6	109772	109777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_003143	ATT	2	6	109778	109783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_003143	TTG	2	6	109798	109803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_003143	GAA	2	6	109824	109829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_003143	TA	3	6	109846	109851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_003143	ATT	2	6	110165	110170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_003143	AGT	2	6	110172	110177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_003143	ATT	2	6	110204	110209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_003143	A	6	6	110439	110444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_003143	CTT	2	6	110478	110483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_003143	T	6	6	110566	110571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_003143	AAC	2	6	110583	110588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_003143	GC	3	6	110596	110601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_003143	GGT	2	6	110619	110624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_003143	TAT	2	6	110639	110644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_003143	TAT	2	6	110653	110658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_003143	ATTC	2	8	110703	110710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
558	NC_003143	TGA	2	6	110717	110722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_003143	T	6	6	110725	110730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_003143	GAA	2	6	111368	111373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_003143	CAGA	2	8	111409	111416	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_003143	TAT	2	6	111417	111422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_003143	ATC	2	6	111982	111987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_003143	TTCA	2	8	112985	112992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
565	NC_003143	TAA	2	6	113060	113065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_003143	A	6	6	113078	113083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_003143	ATA	2	6	113120	113125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_003143	GAT	2	6	113179	113184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_003143	ATT	2	6	114545	114550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_003143	TGTAC	2	10	114578	114587	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
571	NC_003143	ATTA	2	8	114588	114595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_003143	A	6	6	115186	115191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_003143	GGA	2	6	115223	115228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_003143	CGT	2	6	116098	116103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_003143	ATG	2	6	116105	116110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_003143	GC	3	6	117213	117218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_003143	GTT	2	6	117239	117244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_003143	A	6	6	117312	117317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_003143	T	6	6	117333	117338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_003143	AGG	2	6	117356	117361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_003143	GTG	2	6	117377	117382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_003143	ATG	2	6	119730	119735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_003143	A	7	7	119765	119771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_003143	CGC	2	6	119846	119851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_003143	TTAT	2	8	119902	119909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_003143	GTG	2	6	119917	119922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_003143	T	6	6	120224	120229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_003143	ACC	2	6	120242	120247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_003143	GAT	3	9	120277	120285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_003143	GAT	2	6	120297	120302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_003143	GAT	2	6	120314	120319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_003143	TCG	2	6	120323	120328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_003143	GTC	2	6	120335	120340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_003143	GAT	2	6	120416	120421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_003143	ATAA	2	8	120427	120434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_003143	TAAA	2	8	120435	120442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_003143	TAA	2	6	120445	120450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_003143	TAA	2	6	120453	120458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_003143	GA	3	6	120488	120493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_003143	TTA	3	9	120518	120526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_003143	GAT	2	6	120547	120552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_003143	A	6	6	120569	120574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_003143	T	6	6	120604	120609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_003143	CATT	2	8	121213	121220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
605	NC_003143	T	6	6	121236	121241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_003143	AGTG	2	8	121249	121256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_003143	AAT	2	6	121289	121294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_003143	ATA	2	6	121308	121313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_003143	ATA	2	6	121318	121323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_003143	T	6	6	121327	121332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_003143	AAG	2	6	121425	121430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_003143	ATA	2	6	121454	121459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_003143	GGT	2	6	121537	121542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_003143	TAAA	2	8	121946	121953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_003143	GTT	2	6	122001	122006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_003143	GCT	2	6	122007	122012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_003143	CTCG	2	8	122017	122024	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
618	NC_003143	TGCTA	2	10	122053	122062	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
619	NC_003143	TTA	2	6	122126	122131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_003143	AAG	2	6	122155	122160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_003143	TGG	2	6	122233	122238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_003143	CAA	2	6	122263	122268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_003143	ATG	2	6	122290	122295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_003143	C	6	6	122318	122323	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
625	NC_003143	CGCA	2	8	122370	122377	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
626	NC_003143	CGT	2	6	122388	122393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_003143	TGT	2	6	122411	122416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_003143	G	7	7	122442	122448	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
629	NC_003143	CAG	2	6	122465	122470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_003143	GTG	2	6	122587	122592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_003143	TTG	2	6	122608	122613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_003143	TTGA	2	8	122670	122677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_003143	GTT	2	6	122703	122708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_003143	GCC	2	6	122715	122720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_003143	GCC	2	6	122730	122735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_003143	TGC	2	6	122738	122743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_003143	CAG	2	6	122790	122795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_003143	CT	5	10	122797	122806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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641	NC_003143	TGG	2	6	122916	122921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_003143	TAAT	2	8	133858	133865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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684	NC_003143	GCC	2	6	134642	134647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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