MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003134	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003134	AT	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003134	AG	3	6	18991	18996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003134	TA	3	6	19833	19838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003134	TA	3	6	28583	28588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003134	TA	4	8	28610	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003134	TA	3	6	32074	32079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003134	AT	3	6	35085	35090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003134	TG	3	6	36424	36429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003134	AG	3	6	45863	45868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003134	AG	3	6	45972	45977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003134	CT	3	6	46008	46013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_003134	AT	3	6	46111	46116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003134	CA	3	6	46151	46156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_003134	AG	3	6	46334	46339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003134	AG	3	6	46376	46381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003134	AG	3	6	47564	47569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003134	CT	3	6	47766	47771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_003134	CT	3	6	47971	47976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_003134	CG	4	8	48078	48085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_003134	TA	3	6	48862	48867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003134	TA	3	6	51226	51231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003134	CA	3	6	59235	59240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_003134	CG	3	6	61806	61811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_003134	GC	3	6	62241	62246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_003134	AT	3	6	66173	66178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003134	AT	3	6	70190	70195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003134	CA	3	6	70226	70231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_003134	TA	3	6	73476	73481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003134	GA	3	6	78098	78103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003134	CG	3	6	78161	78166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_003134	AC	3	6	79440	79445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_003134	TG	3	6	82409	82414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003134	CT	3	6	85902	85907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_003134	AG	3	6	86666	86671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003134	CG	3	6	87658	87663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_003134	AC	3	6	89247	89252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_003134	AT	3	6	91702	91707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003134	TA	3	6	91709	91714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003134	CT	3	6	93012	93017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_003134	GA	3	6	93247	93252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003134	AG	3	6	93415	93420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003134	AC	3	6	94152	94157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_003134	AG	3	6	94927	94932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003134	CG	3	6	95441	95446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.