MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 plasmid pYV03

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017565	AC	3	6	2680	2685	50 %	0 %	0 %	50 %	386307333
2	NC_017565	GT	3	6	2904	2909	0 %	50 %	50 %	0 %	386307333
3	NC_017565	CT	3	6	3692	3697	0 %	50 %	0 %	50 %	386307333
4	NC_017565	GA	3	6	3698	3703	50 %	0 %	50 %	0 %	386307333
5	NC_017565	TG	3	6	3988	3993	0 %	50 %	50 %	0 %	386307334
6	NC_017565	TG	3	6	4076	4081	0 %	50 %	50 %	0 %	386307334
7	NC_017565	GC	3	6	4183	4188	0 %	0 %	50 %	50 %	386307334
8	NC_017565	TC	3	6	4297	4302	0 %	50 %	0 %	50 %	386307334
9	NC_017565	TC	3	6	4628	4633	0 %	50 %	0 %	50 %	386307335
10	NC_017565	AC	3	6	5127	5132	50 %	0 %	0 %	50 %	386307335
11	NC_017565	CT	3	6	5798	5803	0 %	50 %	0 %	50 %	386307335
12	NC_017565	AC	3	6	6113	6118	50 %	0 %	0 %	50 %	386307335
13	NC_017565	GC	3	6	6145	6150	0 %	0 %	50 %	50 %	386307335
14	NC_017565	AG	4	8	6585	6592	50 %	0 %	50 %	0 %	386307335
15	NC_017565	GA	4	8	7956	7963	50 %	0 %	50 %	0 %	386307337
16	NC_017565	TG	3	6	8918	8923	0 %	50 %	50 %	0 %	386307338
17	NC_017565	AG	3	6	10149	10154	50 %	0 %	50 %	0 %	386307340
18	NC_017565	AT	3	6	10322	10327	50 %	50 %	0 %	0 %	386307340
19	NC_017565	GA	3	6	11384	11389	50 %	0 %	50 %	0 %	386307341
20	NC_017565	TC	3	6	11828	11833	0 %	50 %	0 %	50 %	386307341
21	NC_017565	TA	3	6	12527	12532	50 %	50 %	0 %	0 %	386307343
22	NC_017565	TA	4	8	12743	12750	50 %	50 %	0 %	0 %	386307344
23	NC_017565	GT	3	6	13581	13586	0 %	50 %	50 %	0 %	386307347
24	NC_017565	TC	3	6	15836	15841	0 %	50 %	0 %	50 %	386307352
25	NC_017565	CA	3	6	16070	16075	50 %	0 %	0 %	50 %	386307353
26	NC_017565	CA	3	6	17958	17963	50 %	0 %	0 %	50 %	386307354
27	NC_017565	AC	3	6	18088	18093	50 %	0 %	0 %	50 %	386307354
28	NC_017565	TG	4	8	18707	18714	0 %	50 %	50 %	0 %	386307355
29	NC_017565	GA	3	6	18744	18749	50 %	0 %	50 %	0 %	386307355
30	NC_017565	TC	3	6	19195	19200	0 %	50 %	0 %	50 %	386307355
31	NC_017565	AC	3	6	20032	20037	50 %	0 %	0 %	50 %	386307356
32	NC_017565	TG	3	6	20121	20126	0 %	50 %	50 %	0 %	386307356
33	NC_017565	TA	4	8	20390	20397	50 %	50 %	0 %	0 %	386307357
34	NC_017565	GC	4	8	20508	20515	0 %	0 %	50 %	50 %	386307357
35	NC_017565	AG	3	6	22252	22257	50 %	0 %	50 %	0 %	386307360
36	NC_017565	GA	3	6	22902	22907	50 %	0 %	50 %	0 %	386307360
37	NC_017565	AG	3	6	23680	23685	50 %	0 %	50 %	0 %	386307361
38	NC_017565	AC	3	6	25888	25893	50 %	0 %	0 %	50 %	386307366
39	NC_017565	AT	3	6	25915	25920	50 %	50 %	0 %	0 %	386307366
40	NC_017565	TC	4	8	29815	29822	0 %	50 %	0 %	50 %	386307374
41	NC_017565	GA	3	6	30044	30049	50 %	0 %	50 %	0 %	386307374
42	NC_017565	AT	3	6	31173	31178	50 %	50 %	0 %	0 %	386307377
43	NC_017565	TA	3	6	31529	31534	50 %	50 %	0 %	0 %	386307378
44	NC_017565	TA	3	6	31536	31541	50 %	50 %	0 %	0 %	386307378
45	NC_017565	AT	3	6	32831	32836	50 %	50 %	0 %	0 %	386307380
46	NC_017565	TA	3	6	32924	32929	50 %	50 %	0 %	0 %	386307380
47	NC_017565	AT	3	6	33498	33503	50 %	50 %	0 %	0 %	386307381
48	NC_017565	TG	3	6	33591	33596	0 %	50 %	50 %	0 %	386307382
49	NC_017565	CT	3	6	34844	34849	0 %	50 %	0 %	50 %	386307385
50	NC_017565	GC	4	8	36098	36105	0 %	0 %	50 %	50 %	386307386
51	NC_017565	CT	3	6	36532	36537	0 %	50 %	0 %	50 %	386307386
52	NC_017565	CT	3	6	36623	36628	0 %	50 %	0 %	50 %	386307386
53	NC_017565	GC	3	6	38503	38508	0 %	0 %	50 %	50 %	386307388
54	NC_017565	CT	3	6	38760	38765	0 %	50 %	0 %	50 %	386307389
55	NC_017565	CG	3	6	42587	42592	0 %	0 %	50 %	50 %	386307397
56	NC_017565	AC	3	6	42851	42856	50 %	0 %	0 %	50 %	386307398
57	NC_017565	AG	3	6	44381	44386	50 %	0 %	50 %	0 %	386307398
58	NC_017565	AT	3	6	46201	46206	50 %	50 %	0 %	0 %	386307401
59	NC_017565	AG	3	6	46527	46532	50 %	0 %	50 %	0 %	386307402
60	NC_017565	TG	3	6	46679	46684	0 %	50 %	50 %	0 %	386307402
61	NC_017565	AT	3	6	47811	47816	50 %	50 %	0 %	0 %	386307403
62	NC_017565	GC	3	6	48389	48394	0 %	0 %	50 %	50 %	386307403
63	NC_017565	AG	3	6	48796	48801	50 %	0 %	50 %	0 %	386307404
64	NC_017565	TG	3	6	50307	50312	0 %	50 %	50 %	0 %	386307407
65	NC_017565	CG	3	6	51404	51409	0 %	0 %	50 %	50 %	386307408
66	NC_017565	CG	3	6	51490	51495	0 %	0 %	50 %	50 %	386307408
67	NC_017565	CA	3	6	52017	52022	50 %	0 %	0 %	50 %	386307408
68	NC_017565	CT	3	6	52230	52235	0 %	50 %	0 %	50 %	386307408
69	NC_017565	AG	3	6	53459	53464	50 %	0 %	50 %	0 %	386307410
70	NC_017565	TC	3	6	55870	55875	0 %	50 %	0 %	50 %	386307413
71	NC_017565	GC	3	6	56527	56532	0 %	0 %	50 %	50 %	386307415
72	NC_017565	TC	3	6	57214	57219	0 %	50 %	0 %	50 %	386307416
73	NC_017565	CG	3	6	57303	57308	0 %	0 %	50 %	50 %	386307416
74	NC_017565	AT	3	6	57406	57411	50 %	50 %	0 %	0 %	386307416
75	NC_017565	TC	3	6	58249	58254	0 %	50 %	0 %	50 %	386307416
76	NC_017565	AT	3	6	58529	58534	50 %	50 %	0 %	0 %	386307416
77	NC_017565	TC	3	6	59186	59191	0 %	50 %	0 %	50 %	386307417
78	NC_017565	TG	3	6	59468	59473	0 %	50 %	50 %	0 %	386307418
79	NC_017565	AG	3	6	62918	62923	50 %	0 %	50 %	0 %	386307422
80	NC_017565	CT	3	6	64157	64162	0 %	50 %	0 %	50 %	386307425
81	NC_017565	CT	3	6	64860	64865	0 %	50 %	0 %	50 %	386307425
82	NC_017565	AC	3	6	67394	67399	50 %	0 %	0 %	50 %	386307431
83	NC_017565	AT	3	6	67421	67426	50 %	50 %	0 %	0 %	386307431
84	NC_017565	GC	3	6	69615	69620	0 %	0 %	50 %	50 %	386307437
85	NC_017565	AG	3	6	71119	71124	50 %	0 %	50 %	0 %	386307440
86	NC_017565	CA	3	6	71485	71490	50 %	0 %	0 %	50 %	386307441
87	NC_017565	CG	3	6	71629	71634	0 %	0 %	50 %	50 %	386307441
88	NC_017565	GC	3	6	72134	72139	0 %	0 %	50 %	50 %	386307441

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.