MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Medievalis str. Harbin 35 chromosome

Total Repeats: 70304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017265	TCT	2	6	185924	185929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412888
3003	NC_017265	ATC	2	6	185932	185937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412888
3004	NC_017265	CG	4	8	185951	185958	0 %	0 %	50 %	50 %	384412888
3005	NC_017265	CTT	2	6	185969	185974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412888
3006	NC_017265	ATG	2	6	186039	186044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412888
3007	NC_017265	TG	3	6	186143	186148	0 %	50 %	50 %	0 %	384412888
3008	NC_017265	CTT	2	6	186230	186235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412888
3009	NC_017265	GCC	2	6	186364	186369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412888
3010	NC_017265	GTGA	2	8	186426	186433	25 %	25 %	50 %	0 %	384412888
3011	NC_017265	CTC	2	6	186516	186521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384412888
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3014	NC_017265	TGC	2	6	186638	186643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412889
3015	NC_017265	TGC	2	6	186647	186652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412889
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3017	NC_017265	TCT	2	6	186740	186745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412889
3018	NC_017265	CCG	2	6	186764	186769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412889
3019	NC_017265	CGA	2	6	186788	186793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412889
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3022	NC_017265	AAT	2	6	186994	186999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412890
3023	NC_017265	TCAGA	2	10	187005	187014	40 %	20 %	20 %	20 %	384412890
3024	NC_017265	ATC	2	6	187030	187035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412890
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3030	NC_017265	ATC	2	6	187346	187351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412890
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3033	NC_017265	ATA	2	6	187964	187969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412891
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3039	NC_017265	GGCGG	2	10	188305	188314	0 %	0 %	80 %	20 %	384412891
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3049	NC_017265	TCTCCG	2	12	188594	188605	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384412891
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3055	NC_017265	GGT	2	6	188950	188955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412891
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3057	NC_017265	TCG	2	6	188995	189000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412891
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3062	NC_017265	TTA	2	6	189326	189331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412891
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3092	NC_017265	TGT	2	6	190858	190863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412893
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3106	NC_017265	GC	3	6	191897	191902	0 %	0 %	50 %	50 %	384412894
3107	NC_017265	TGG	2	6	192040	192045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412894
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3109	NC_017265	TGC	2	6	192151	192156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412894
3110	NC_017265	TGTC	2	8	192159	192166	0 %	50 %	25 %	25 %	384412894
3111	NC_017265	AGA	2	6	192208	192213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384412894
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3121	NC_017265	CAT	2	6	192819	192824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412895
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3242	NC_017265	GCGGT	2	10	199990	199999	0 %	20 %	60 %	20 %	384412905
3243	NC_017265	GGC	2	6	200007	200012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412905
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3247	NC_017265	GTG	2	6	200377	200382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412905
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3250	NC_017265	GCA	3	9	200676	200684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412905
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3353	NC_017265	CTG	2	6	208285	208290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412911
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3357	NC_017265	TTCA	2	8	208486	208493	25 %	50 %	0 %	25 %	384412911
3358	NC_017265	CT	3	6	208532	208537	0 %	50 %	0 %	50 %	384412911
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3486	NC_017265	ATG	3	9	216666	216674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412921
3487	NC_017265	TCA	2	6	216835	216840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412921
3488	NC_017265	CGG	2	6	216970	216975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412921
3489	NC_017265	GTG	2	6	217010	217015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412921
3490	NC_017265	GTT	2	6	217049	217054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412921
3491	NC_017265	CGA	2	6	217058	217063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412921
3492	NC_017265	ATC	2	6	217084	217089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412921
3493	NC_017265	TGT	2	6	217147	217152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412921
3494	NC_017265	CAT	2	6	217172	217177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412921
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3496	NC_017265	AGC	2	6	217234	217239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412921
3497	NC_017265	AGC	3	9	217270	217278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412921
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3499	NC_017265	GACC	2	8	217379	217386	25 %	0 %	25 %	50 %	384412921
3500	NC_017265	CTTTTT	2	12	217404	217415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384412921

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