MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 plasmid unnamed

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017169	GGCT	2	8	1101	1108	0 %	25 %	50 %	25 %	384141140
2	NC_017169	GAAG	2	8	1221	1228	50 %	0 %	50 %	0 %	384141140
3	NC_017169	CATC	2	8	1658	1665	25 %	25 %	0 %	50 %	384141140
4	NC_017169	TAAG	2	8	1805	1812	50 %	25 %	25 %	0 %	384141141
5	NC_017169	GTCA	2	8	1999	2006	25 %	25 %	25 %	25 %	384141141
6	NC_017169	CCAT	2	8	2070	2077	25 %	25 %	0 %	50 %	384141141
7	NC_017169	GATG	2	8	2935	2942	25 %	25 %	50 %	0 %	384141141
8	NC_017169	ATGA	2	8	3046	3053	50 %	25 %	25 %	0 %	384141141
9	NC_017169	CGCC	2	8	3191	3198	0 %	0 %	25 %	75 %	384141141
10	NC_017169	ACTT	2	8	3328	3335	25 %	50 %	0 %	25 %	384141142
11	NC_017169	GTGC	2	8	3648	3655	0 %	25 %	50 %	25 %	384141142
12	NC_017169	CCGA	2	8	4935	4942	25 %	0 %	25 %	50 %	384141143
13	NC_017169	CGCA	2	8	5004	5011	25 %	0 %	25 %	50 %	384141143
14	NC_017169	TTTG	2	8	5675	5682	0 %	75 %	25 %	0 %	384141144
15	NC_017169	ACTC	2	8	5999	6006	25 %	25 %	0 %	50 %	384141145
16	NC_017169	CGGA	2	8	6108	6115	25 %	0 %	50 %	25 %	384141145
17	NC_017169	TGTC	2	8	6587	6594	0 %	50 %	25 %	25 %	384141145
18	NC_017169	GCGG	2	8	6966	6973	0 %	0 %	75 %	25 %	384141147
19	NC_017169	CAGC	2	8	7489	7496	25 %	0 %	25 %	50 %	384141148
20	NC_017169	GCAA	2	8	7572	7579	50 %	0 %	25 %	25 %	384141148
21	NC_017169	CCAG	2	8	7950	7957	25 %	0 %	25 %	50 %	384141148
22	NC_017169	CTCG	2	8	8325	8332	0 %	25 %	25 %	50 %	384141149
23	NC_017169	CTCG	2	8	9345	9352	0 %	25 %	25 %	50 %	384141150
24	NC_017169	AATC	2	8	9387	9394	50 %	25 %	0 %	25 %	384141150
25	NC_017169	AATA	2	8	10352	10359	75 %	25 %	0 %	0 %	384141150
26	NC_017169	CATC	2	8	11002	11009	25 %	25 %	0 %	50 %	384141152
27	NC_017169	AGCA	2	8	12336	12343	50 %	0 %	25 %	25 %	384141154
28	NC_017169	CCAA	2	8	12599	12606	50 %	0 %	0 %	50 %	384141154
29	NC_017169	AATC	2	8	12609	12616	50 %	25 %	0 %	25 %	384141154
30	NC_017169	TAAT	2	8	12739	12746	50 %	50 %	0 %	0 %	384141154
31	NC_017169	GCCA	2	8	13698	13705	25 %	0 %	25 %	50 %	384141156
32	NC_017169	TTAC	2	8	14861	14868	25 %	50 %	0 %	25 %	384141158
33	NC_017169	TTGC	2	8	15651	15658	0 %	50 %	25 %	25 %	384141159
34	NC_017169	CTTC	2	8	15710	15717	0 %	50 %	0 %	50 %	384141159
35	NC_017169	CACG	2	8	15786	15793	25 %	0 %	25 %	50 %	384141159
36	NC_017169	ATCA	2	8	16245	16252	50 %	25 %	0 %	25 %	384141160
37	NC_017169	GCGT	2	8	16467	16474	0 %	25 %	50 %	25 %	384141160
38	NC_017169	TGCG	2	8	16831	16838	0 %	25 %	50 %	25 %	384141160
39	NC_017169	CGAG	2	8	17824	17831	25 %	0 %	50 %	25 %	384141161
40	NC_017169	AGCG	2	8	17999	18006	25 %	0 %	50 %	25 %	384141161
41	NC_017169	GCCA	2	8	18043	18050	25 %	0 %	25 %	50 %	384141161
42	NC_017169	TGCG	2	8	18189	18196	0 %	25 %	50 %	25 %	384141161
43	NC_017169	AGCC	2	8	19384	19391	25 %	0 %	25 %	50 %	384141162
44	NC_017169	CCTG	2	8	20624	20631	0 %	25 %	25 %	50 %	384141164
45	NC_017169	GAAA	2	8	21092	21099	75 %	0 %	25 %	0 %	384141164
46	NC_017169	CAAG	2	8	21494	21501	50 %	0 %	25 %	25 %	384141164
47	NC_017169	TCGT	2	8	21737	21744	0 %	50 %	25 %	25 %	384141165
48	NC_017169	TGTT	2	8	22437	22444	0 %	75 %	25 %	0 %	384141166
49	NC_017169	GCGT	2	8	22501	22508	0 %	25 %	50 %	25 %	384141166
50	NC_017169	CAAC	2	8	25110	25117	50 %	0 %	0 %	50 %	384141169
51	NC_017169	CTGG	2	8	26540	26547	0 %	25 %	50 %	25 %	384141173
52	NC_017169	TCAT	2	8	26766	26773	25 %	50 %	0 %	25 %	384141173
53	NC_017169	CCCA	2	8	27236	27243	25 %	0 %	0 %	75 %	384141174
54	NC_017169	TACC	2	8	27264	27271	25 %	25 %	0 %	50 %	384141174
55	NC_017169	TTAC	2	8	27753	27760	25 %	50 %	0 %	25 %	384141174
56	NC_017169	TGAG	2	8	27777	27784	25 %	25 %	50 %	0 %	384141175
57	NC_017169	TCGC	2	8	28083	28090	0 %	25 %	25 %	50 %	384141176
58	NC_017169	AACA	2	8	29417	29424	75 %	0 %	0 %	25 %	384141178
59	NC_017169	TGGG	2	8	29521	29528	0 %	25 %	75 %	0 %	384141178
60	NC_017169	ATCC	2	8	30172	30179	25 %	25 %	0 %	50 %	384141178
61	NC_017169	GGGC	2	8	30192	30199	0 %	0 %	75 %	25 %	384141178
62	NC_017169	CAGC	2	8	30415	30422	25 %	0 %	25 %	50 %	384141179
63	NC_017169	TCAA	2	8	31017	31024	50 %	25 %	0 %	25 %	384141179
64	NC_017169	CAGA	2	8	31060	31067	50 %	0 %	25 %	25 %	384141179
65	NC_017169	GGTT	2	8	31719	31726	0 %	50 %	50 %	0 %	384141180
66	NC_017169	TAAG	2	8	32973	32980	50 %	25 %	25 %	0 %	384141182
67	NC_017169	TCTG	2	8	34151	34158	0 %	50 %	25 %	25 %	384141185
68	NC_017169	CTGA	2	8	34350	34357	25 %	25 %	25 %	25 %	384141185
69	NC_017169	TGAG	2	8	34601	34608	25 %	25 %	50 %	0 %	384141185
70	NC_017169	CAGC	2	8	35096	35103	25 %	0 %	25 %	50 %	384141186
71	NC_017169	GAAT	2	8	35608	35615	50 %	25 %	25 %	0 %	384141186
72	NC_017169	GCGA	2	8	35663	35670	25 %	0 %	50 %	25 %	384141186
73	NC_017169	CAGT	2	8	37753	37760	25 %	25 %	25 %	25 %	384141187
74	NC_017169	GTCC	2	8	37789	37796	0 %	25 %	25 %	50 %	384141187
75	NC_017169	ATCC	2	8	40052	40059	25 %	25 %	0 %	50 %	384141191
76	NC_017169	CCAG	2	8	40222	40229	25 %	0 %	25 %	50 %	384141191
77	NC_017169	ATCC	2	8	40620	40627	25 %	25 %	0 %	50 %	384141191
78	NC_017169	CCAT	2	8	40673	40680	25 %	25 %	0 %	50 %	384141191
79	NC_017169	TCGG	2	8	41687	41694	0 %	25 %	50 %	25 %	384141194
80	NC_017169	CTGC	2	8	43153	43160	0 %	25 %	25 %	50 %	384141197
81	NC_017169	GAAC	2	8	43962	43969	50 %	0 %	25 %	25 %	384141197
82	NC_017169	GAGG	2	8	44186	44193	25 %	0 %	75 %	0 %	384141197
83	NC_017169	TGAA	2	8	44240	44247	50 %	25 %	25 %	0 %	384141197
84	NC_017169	GCCT	2	8	44580	44587	0 %	25 %	25 %	50 %	384141198
85	NC_017169	TTTC	2	8	44885	44892	0 %	75 %	0 %	25 %	384141199
86	NC_017169	TTTC	2	8	45226	45233	0 %	75 %	0 %	25 %	384141199
87	NC_017169	GCAG	2	8	45407	45414	25 %	0 %	50 %	25 %	384141199
88	NC_017169	AACG	2	8	45566	45573	50 %	0 %	25 %	25 %	384141199
89	NC_017169	CAGG	2	8	47745	47752	25 %	0 %	50 %	25 %	384141202
90	NC_017169	ACCA	2	8	48292	48299	50 %	0 %	0 %	50 %	384141203
91	NC_017169	TATT	2	8	49324	49331	25 %	75 %	0 %	0 %	384141204
92	NC_017169	CAGG	2	8	49333	49340	25 %	0 %	50 %	25 %	384141204
93	NC_017169	GCGG	2	8	49796	49803	0 %	0 %	75 %	25 %	384141205
94	NC_017169	CTCG	2	8	50795	50802	0 %	25 %	25 %	50 %	384141207
95	NC_017169	ATTA	2	8	51284	51291	50 %	50 %	0 %	0 %	384141208
96	NC_017169	CTTA	2	8	51357	51364	25 %	50 %	0 %	25 %	384141208
97	NC_017169	CAGA	2	8	52170	52177	50 %	0 %	25 %	25 %	384141208
98	NC_017169	ATTG	2	8	52570	52577	25 %	50 %	25 %	0 %	384141208
99	NC_017169	CTGG	2	8	53443	53450	0 %	25 %	50 %	25 %	384141209
100	NC_017169	CAGC	2	8	53594	53601	25 %	0 %	25 %	50 %	384141209
101	NC_017169	CAGA	2	8	54303	54310	50 %	0 %	25 %	25 %	384141210
102	NC_017169	TATT	2	8	54592	54599	25 %	75 %	0 %	0 %	384141211
103	NC_017169	TCTG	2	8	54846	54853	0 %	50 %	25 %	25 %	384141211
104	NC_017169	GCTG	2	8	55066	55073	0 %	25 %	50 %	25 %	384141212
105	NC_017169	GCCA	2	8	57155	57162	25 %	0 %	25 %	50 %	384141214
106	NC_017169	CAAT	2	8	58229	58236	50 %	25 %	0 %	25 %	384141215
107	NC_017169	GCAA	2	8	59434	59441	50 %	0 %	25 %	25 %	384141216
108	NC_017169	GAAT	2	8	59844	59851	50 %	25 %	25 %	0 %	384141216
109	NC_017169	AGGG	2	8	60077	60084	25 %	0 %	75 %	0 %	384141216
110	NC_017169	CGAG	2	8	60801	60808	25 %	0 %	50 %	25 %	384141217
111	NC_017169	GTAA	2	8	61009	61016	50 %	25 %	25 %	0 %	384141217
112	NC_017169	TGGG	2	8	61061	61068	0 %	25 %	75 %	0 %	384141217
113	NC_017169	AGGT	2	8	61904	61911	25 %	25 %	50 %	0 %	384141217
114	NC_017169	ATCA	2	8	62555	62562	50 %	25 %	0 %	25 %	384141217
115	NC_017169	AAGG	2	8	62859	62866	50 %	0 %	50 %	0 %	384141218
116	NC_017169	GATT	2	8	64366	64373	25 %	50 %	25 %	0 %	384141219
117	NC_017169	ATCA	2	8	64884	64891	50 %	25 %	0 %	25 %	384141219
118	NC_017169	CATC	2	8	65008	65015	25 %	25 %	0 %	50 %	384141219
119	NC_017169	GATG	2	8	65805	65812	25 %	25 %	50 %	0 %	384141221
120	NC_017169	TTGA	2	8	67529	67536	25 %	50 %	25 %	0 %	384141222
121	NC_017169	TCTG	2	8	67663	67670	0 %	50 %	25 %	25 %	384141222
122	NC_017169	GAGC	2	8	67703	67710	25 %	0 %	50 %	25 %	384141222
123	NC_017169	AAGA	2	8	67817	67824	75 %	0 %	25 %	0 %	384141222
124	NC_017169	CTGA	2	8	68327	68334	25 %	25 %	25 %	25 %	384141222
125	NC_017169	CTCG	2	8	69173	69180	0 %	25 %	25 %	50 %	384141223
126	NC_017169	CCAG	2	8	69292	69299	25 %	0 %	25 %	50 %	384141223
127	NC_017169	GCTG	2	8	69520	69527	0 %	25 %	50 %	25 %	384141223
128	NC_017169	CAGC	2	8	69610	69617	25 %	0 %	25 %	50 %	384141223
129	NC_017169	TCCA	2	8	69712	69719	25 %	25 %	0 %	50 %	384141223
130	NC_017169	CGCC	2	8	70171	70178	0 %	0 %	25 %	75 %	384141224
131	NC_017169	AGCG	2	8	70537	70544	25 %	0 %	50 %	25 %	384141224
132	NC_017169	GCTG	2	8	70879	70886	0 %	25 %	50 %	25 %	384141224
133	NC_017169	TGAA	2	8	71250	71257	50 %	25 %	25 %	0 %	384141224
134	NC_017169	GCGT	2	8	72748	72755	0 %	25 %	50 %	25 %	384141224
135	NC_017169	AACG	2	8	72991	72998	50 %	0 %	25 %	25 %	384141224
136	NC_017169	TCGC	2	8	73315	73322	0 %	25 %	25 %	50 %	384141225
137	NC_017169	CATT	2	8	73369	73376	25 %	50 %	0 %	25 %	384141225
138	NC_017169	GCTG	2	8	73882	73889	0 %	25 %	50 %	25 %	384141225
139	NC_017169	CTCA	2	8	74377	74384	25 %	25 %	0 %	50 %	384141226
140	NC_017169	TCAG	2	8	74628	74635	25 %	25 %	25 %	25 %	384141226
141	NC_017169	CAGA	2	8	74827	74834	50 %	0 %	25 %	25 %	384141226
142	NC_017169	TTTA	2	8	75008	75015	25 %	75 %	0 %	0 %	384141227
143	NC_017169	TGAG	2	8	76051	76058	25 %	25 %	50 %	0 %	384141229
144	NC_017169	GGTT	2	8	76387	76394	0 %	50 %	50 %	0 %	384141229
145	NC_017169	AGCC	2	8	77160	77167	25 %	0 %	25 %	50 %	384141229
146	NC_017169	TCCA	2	8	77245	77252	25 %	25 %	0 %	50 %	384141229
147	NC_017169	CTAT	2	8	77468	77475	25 %	50 %	0 %	25 %	384141229
148	NC_017169	CTTC	2	8	78600	78607	0 %	50 %	0 %	50 %	384141229
149	NC_017169	TCGT	2	8	78984	78991	0 %	50 %	25 %	25 %	384141230
150	NC_017169	ATTA	2	8	79233	79240	50 %	50 %	0 %	0 %	384141230
151	NC_017169	TTCA	2	8	79553	79560	25 %	50 %	0 %	25 %	384141231
152	NC_017169	GATT	2	8	79653	79660	25 %	50 %	25 %	0 %	384141231
153	NC_017169	CTGC	2	8	80016	80023	0 %	25 %	25 %	50 %	384141231
154	NC_017169	CTGC	2	8	80176	80183	0 %	25 %	25 %	50 %	384141231
155	NC_017169	TGTT	2	8	81537	81544	0 %	75 %	25 %	0 %	384141231
156	NC_017169	CAAC	2	8	81787	81794	50 %	0 %	0 %	50 %	384141231
157	NC_017169	TTGA	2	8	82161	82168	25 %	50 %	25 %	0 %	384141231
158	NC_017169	ACGC	2	8	82367	82374	25 %	0 %	25 %	50 %	384141231
159	NC_017169	AAGG	2	8	82667	82674	50 %	0 %	50 %	0 %	384141231
160	NC_017169	TGCG	2	8	82717	82724	0 %	25 %	50 %	25 %	384141231
161	NC_017169	GACG	2	8	82896	82903	25 %	0 %	50 %	25 %	384141231
162	NC_017169	CAGG	2	8	83253	83260	25 %	0 %	50 %	25 %	384141231
163	NC_017169	ACGA	2	8	83368	83375	50 %	0 %	25 %	25 %	384141231
164	NC_017169	CCAC	2	8	83476	83483	25 %	0 %	0 %	75 %	384141231
165	NC_017169	TGAC	2	8	83833	83840	25 %	25 %	25 %	25 %	384141231
166	NC_017169	CTGC	2	8	84313	84320	0 %	25 %	25 %	50 %	384141232
167	NC_017169	ACCA	2	8	84454	84461	50 %	0 %	0 %	50 %	384141232
168	NC_017169	AACT	2	8	84749	84756	50 %	25 %	0 %	25 %	384141232
169	NC_017169	TGAA	2	8	84926	84933	50 %	25 %	25 %	0 %	384141233
170	NC_017169	TTCG	2	8	85465	85472	0 %	50 %	25 %	25 %	384141233
171	NC_017169	AGAT	2	8	85493	85500	50 %	25 %	25 %	0 %	384141233
172	NC_017169	GCGT	2	8	85607	85614	0 %	25 %	50 %	25 %	384141234
173	NC_017169	AGTC	2	8	86650	86657	25 %	25 %	25 %	25 %	384141235
174	NC_017169	GTTA	2	8	86705	86712	25 %	50 %	25 %	0 %	384141236
175	NC_017169	GTTG	2	8	87408	87415	0 %	50 %	50 %	0 %	384141236
176	NC_017169	TGCC	2	8	87854	87861	0 %	25 %	25 %	50 %	384141236
177	NC_017169	GCCG	2	8	88296	88303	0 %	0 %	50 %	50 %	384141236
178	NC_017169	CTTC	2	8	88325	88332	0 %	50 %	0 %	50 %	384141236
179	NC_017169	AGCC	2	8	89766	89773	25 %	0 %	25 %	50 %	384141236
180	NC_017169	CGAA	2	8	89834	89841	50 %	0 %	25 %	25 %	384141236
181	NC_017169	AAGC	2	8	89867	89874	50 %	0 %	25 %	25 %	384141236
182	NC_017169	CGCA	2	8	90012	90019	25 %	0 %	25 %	50 %	384141236
183	NC_017169	CAAG	2	8	90542	90549	50 %	0 %	25 %	25 %	384141236
184	NC_017169	CGCC	2	8	90595	90602	0 %	0 %	25 %	75 %	384141236
185	NC_017169	CATC	2	8	90716	90723	25 %	25 %	0 %	50 %	384141236
186	NC_017169	CCCG	2	8	91213	91220	0 %	0 %	25 %	75 %	384141236
187	NC_017169	GCGA	2	8	91450	91457	25 %	0 %	50 %	25 %	384141237
188	NC_017169	CGCA	2	8	91483	91490	25 %	0 %	25 %	50 %	384141237
189	NC_017169	CAGT	2	8	91727	91734	25 %	25 %	25 %	25 %	384141238
190	NC_017169	CAGT	2	8	92206	92213	25 %	25 %	25 %	25 %	384141239
191	NC_017169	TCAA	2	8	92882	92889	50 %	25 %	0 %	25 %	384141240
192	NC_017169	AACC	2	8	92935	92942	50 %	0 %	0 %	50 %	384141240
193	NC_017169	TGGC	2	8	93135	93142	0 %	25 %	50 %	25 %	384141240
194	NC_017169	GATA	2	8	93375	93382	50 %	25 %	25 %	0 %	384141241
195	NC_017169	CAGA	2	8	94255	94262	50 %	0 %	25 %	25 %	384141243
196	NC_017169	TGAA	2	8	95848	95855	50 %	25 %	25 %	0 %	384141245
197	NC_017169	ACGG	2	8	95913	95920	25 %	0 %	50 %	25 %	384141245
198	NC_017169	AAGC	2	8	95967	95974	50 %	0 %	25 %	25 %	384141245
199	NC_017169	GCTC	2	8	95995	96002	0 %	25 %	25 %	50 %	384141245

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.