MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 50626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017168	CCG	2	6	2038	2043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137009
2	NC_017168	CGG	2	6	2236	2241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137009
3	NC_017168	CTG	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137009
4	NC_017168	TGG	2	6	2457	2462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137009
5	NC_017168	AGT	2	6	2484	2489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137009
6	NC_017168	GTT	2	6	2633	2638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137009
7	NC_017168	GCT	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137009
8	NC_017168	GCC	3	9	2720	2728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137009
9	NC_017168	AGC	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137009
10	NC_017168	GGT	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137009
11	NC_017168	GCT	2	6	2905	2910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137009
12	NC_017168	GTC	2	6	2912	2917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137009
13	NC_017168	GGC	2	6	2969	2974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137009
14	NC_017168	CTC	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137009
15	NC_017168	GGT	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137009
16	NC_017168	TGC	2	6	3051	3056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137009
17	NC_017168	CAT	2	6	3149	3154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137009
18	NC_017168	AAT	2	6	3339	3344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137010
19	NC_017168	GCC	2	6	3361	3366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137010
20	NC_017168	TGC	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137010
21	NC_017168	CAG	2	6	3499	3504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137010
22	NC_017168	GGT	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137010
23	NC_017168	CAC	2	6	3811	3816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137010
24	NC_017168	TTG	2	6	3902	3907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137010
25	NC_017168	GCA	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137010
26	NC_017168	GCG	2	6	4055	4060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137010
27	NC_017168	TGC	2	6	4118	4123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137010
28	NC_017168	CGG	2	6	4229	4234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137010
29	NC_017168	TTG	2	6	4261	4266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137010
30	NC_017168	ATC	2	6	4387	4392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137010
31	NC_017168	GCG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137010
32	NC_017168	CGG	2	6	4437	4442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137010
33	NC_017168	CGG	2	6	4592	4597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137010
34	NC_017168	TTG	2	6	4601	4606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137010
35	NC_017168	CAG	2	6	4630	4635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137010
36	NC_017168	CAT	3	9	4647	4655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137010
37	NC_017168	GCA	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137010
38	NC_017168	GCG	2	6	4808	4813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137010
39	NC_017168	CTG	2	6	5002	5007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137010
40	NC_017168	GGT	2	6	5023	5028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137010
41	NC_017168	ATC	2	6	5030	5035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137010
42	NC_017168	GCG	2	6	5128	5133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137011
43	NC_017168	GGT	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137011
44	NC_017168	GGC	2	6	5321	5326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137011
45	NC_017168	CCG	2	6	5339	5344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137011
46	NC_017168	ATC	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137011
47	NC_017168	CAG	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137011
48	NC_017168	GCC	2	6	5437	5442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137011
49	NC_017168	GCG	2	6	5577	5582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137011
50	NC_017168	GCT	2	6	5727	5732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137011
51	NC_017168	AGA	2	6	6072	6077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137012
52	NC_017168	CAG	2	6	6250	6255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137012
53	NC_017168	TAA	2	6	6274	6279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137012
54	NC_017168	ACA	2	6	6378	6383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137012
55	NC_017168	TGC	2	6	6401	6406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137012
56	NC_017168	CCA	2	6	6411	6416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137012
57	NC_017168	AAC	2	6	6437	6442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137012
58	NC_017168	ACG	2	6	6556	6561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137012
59	NC_017168	CAG	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137012
60	NC_017168	TGG	2	6	6924	6929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137012
61	NC_017168	TGT	2	6	6974	6979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137012
62	NC_017168	CGC	2	6	7137	7142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137013
63	NC_017168	TAT	2	6	7358	7363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137013
64	NC_017168	CAT	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137013
65	NC_017168	TCA	2	6	7486	7491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137013
66	NC_017168	CTG	2	6	7509	7514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137013
67	NC_017168	TGA	2	6	7540	7545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137013
68	NC_017168	GAA	3	9	7591	7599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137013
69	NC_017168	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137013
70	NC_017168	AGC	2	6	7695	7700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137013
71	NC_017168	ATG	2	6	7735	7740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137013
72	NC_017168	GTG	2	6	7987	7992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137014
73	NC_017168	TGG	2	6	8086	8091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137014
74	NC_017168	TGT	2	6	8124	8129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137014
75	NC_017168	CAT	2	6	8130	8135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137014
76	NC_017168	CAG	2	6	8195	8200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137014
77	NC_017168	GGT	2	6	8201	8206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137014
78	NC_017168	TAT	2	6	8247	8252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137014
79	NC_017168	GGC	2	6	8331	8336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137014
80	NC_017168	CAC	2	6	8447	8452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137014
81	NC_017168	CTG	2	6	8461	8466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137014
82	NC_017168	GTG	2	6	8467	8472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137014
83	NC_017168	CCG	2	6	8491	8496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137014
84	NC_017168	GTG	2	6	8506	8511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137014
85	NC_017168	CAA	2	6	8515	8520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137014
86	NC_017168	GTT	2	6	8562	8567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137014
87	NC_017168	CCA	2	6	8639	8644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137014
88	NC_017168	CCA	2	6	8652	8657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137014
89	NC_017168	TGG	2	6	8711	8716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137014
90	NC_017168	TGC	2	6	8747	8752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137014
91	NC_017168	TAT	2	6	8810	8815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137014
92	NC_017168	CTT	2	6	8837	8842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137014
93	NC_017168	ATG	2	6	9019	9024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137014
94	NC_017168	AAC	2	6	9072	9077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137014
95	NC_017168	CGC	2	6	9168	9173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137015
96	NC_017168	GAT	2	6	9176	9181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137015
97	NC_017168	CAT	2	6	9475	9480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137016
98	NC_017168	TCA	3	9	9549	9557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137016
99	NC_017168	GTT	2	6	9601	9606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137016
100	NC_017168	TAA	2	6	9646	9651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137016
101	NC_017168	CCT	2	6	9667	9672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137016
102	NC_017168	GAG	2	6	9673	9678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137016
103	NC_017168	TGG	2	6	9686	9691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137016
104	NC_017168	TCA	2	6	9807	9812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137016
105	NC_017168	TAA	2	6	9918	9923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137016
106	NC_017168	GGC	2	6	9934	9939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137016
107	NC_017168	CTT	2	6	10008	10013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137016
108	NC_017168	ATT	2	6	10206	10211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137016
109	NC_017168	ATG	2	6	10852	10857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137017
110	NC_017168	ATC	2	6	10884	10889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137017
111	NC_017168	GAA	2	6	10977	10982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137017
112	NC_017168	TCA	2	6	11012	11017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137017
113	NC_017168	TGT	2	6	11063	11068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137017
114	NC_017168	TGG	2	6	11099	11104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137017
115	NC_017168	TCA	2	6	11131	11136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137017
116	NC_017168	TTC	2	6	11148	11153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137017
117	NC_017168	TCT	2	6	11194	11199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137017
118	NC_017168	GTG	2	6	11239	11244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137017
119	NC_017168	TGG	2	6	11258	11263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137017
120	NC_017168	CAT	2	6	11270	11275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137017
121	NC_017168	CAT	2	6	11399	11404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137017
122	NC_017168	GCT	2	6	11414	11419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137017
123	NC_017168	ATC	2	6	11424	11429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137017
124	NC_017168	CAC	2	6	11489	11494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137017
125	NC_017168	GCC	2	6	11586	11591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137017
126	NC_017168	TGT	2	6	11615	11620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137017
127	NC_017168	TCA	2	6	11665	11670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137017
128	NC_017168	TAG	2	6	11723	11728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137017
129	NC_017168	CGG	2	6	11777	11782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137017
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254	NC_017168	GCA	2	6	24033	24038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137029
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257	NC_017168	TGA	2	6	24169	24174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137029
258	NC_017168	CGC	2	6	24240	24245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137029
259	NC_017168	GGC	2	6	24250	24255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137029
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334	NC_017168	CTG	2	6	28822	28827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137032
335	NC_017168	CCG	2	6	28856	28861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137032
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