MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017168	TTC	2	6	239878	239883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137223
4002	NC_017168	CTT	3	9	239904	239912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137223
4003	NC_017168	CAG	2	6	239929	239934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137223
4004	NC_017168	GTG	2	6	240060	240065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137223
4005	NC_017168	TAGA	2	8	240181	240188	50 %	25 %	25 %	0 %	384137223
4006	NC_017168	CCCAA	2	10	240202	240211	40 %	0 %	0 %	60 %	384137223
4007	NC_017168	TCA	2	6	240317	240322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137223
4008	NC_017168	G	6	6	240325	240330	0 %	0 %	100 %	0 %	384137223
4009	NC_017168	AGG	2	6	240334	240339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137223
4010	NC_017168	GAT	3	9	241060	241068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137224
4011	NC_017168	GAA	2	6	241219	241224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137224
4012	NC_017168	GT	3	6	241324	241329	0 %	50 %	50 %	0 %	384137224
4013	NC_017168	GGT	2	6	241346	241351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137224
4014	NC_017168	TAC	2	6	241355	241360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137224
4015	NC_017168	TGGC	2	8	241419	241426	0 %	25 %	50 %	25 %	384137224
4016	NC_017168	GTG	2	6	241459	241464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137224
4017	NC_017168	TCG	2	6	241485	241490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137224
4018	NC_017168	TGC	2	6	241506	241511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137224
4019	NC_017168	AGG	2	6	241529	241534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137224
4020	NC_017168	CTC	2	6	241538	241543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137224
4021	NC_017168	CCGC	2	8	241552	241559	0 %	0 %	25 %	75 %	384137224
4022	NC_017168	GTTAA	2	10	241577	241586	40 %	40 %	20 %	0 %	384137224
4023	NC_017168	TCATGC	2	12	241592	241603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384137225
4024	NC_017168	AGT	2	6	241614	241619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137225
4025	NC_017168	CCG	2	6	241731	241736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137225
4026	NC_017168	TAC	2	6	241741	241746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137225
4027	NC_017168	TGG	2	6	241823	241828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137225
4028	NC_017168	CCG	2	6	241944	241949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137225
4029	NC_017168	TGG	2	6	241967	241972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137225
4030	NC_017168	TGA	2	6	241998	242003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137225
4031	NC_017168	GGC	3	9	242115	242123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137225
4032	NC_017168	TGAACG	2	12	242214	242225	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384137225
4033	NC_017168	TCG	2	6	242262	242267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137225
4034	NC_017168	GCC	2	6	242284	242289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137225
4035	NC_017168	AG	3	6	242301	242306	50 %	0 %	50 %	0 %	384137225
4036	NC_017168	ATG	2	6	242342	242347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137225
4037	NC_017168	GGT	2	6	242415	242420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137225
4038	NC_017168	TGC	2	6	242430	242435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137225
4039	NC_017168	TTG	2	6	242506	242511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137225
4040	NC_017168	TGA	2	6	242520	242525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137225
4041	NC_017168	AGCC	2	8	242538	242545	25 %	0 %	25 %	50 %	384137225
4042	NC_017168	TGA	2	6	242574	242579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137225
4043	NC_017168	GCC	2	6	242647	242652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137225
4044	NC_017168	CAGC	2	8	242730	242737	25 %	0 %	25 %	50 %	384137225
4045	NC_017168	GCT	2	6	242739	242744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137225
4046	NC_017168	TTG	2	6	242747	242752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137225
4047	NC_017168	GCTG	2	8	242844	242851	0 %	25 %	50 %	25 %	384137225
4048	NC_017168	GAT	2	6	242854	242859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137225
4049	NC_017168	GTG	2	6	242885	242890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137225
4050	NC_017168	G	6	6	242946	242951	0 %	0 %	100 %	0 %	384137225
4051	NC_017168	GAA	2	6	243019	243024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137225
4052	NC_017168	AGC	2	6	243110	243115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137225
4053	NC_017168	GAG	2	6	243136	243141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137225
4054	NC_017168	GAT	2	6	243264	243269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137225
4055	NC_017168	TGA	2	6	243288	243293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137225
4056	NC_017168	TTGA	2	8	243304	243311	25 %	50 %	25 %	0 %	384137225
4057	NC_017168	TGC	2	6	243350	243355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137225
4058	NC_017168	TGA	2	6	243374	243379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137225
4059	NC_017168	TCCA	2	8	243387	243394	25 %	25 %	0 %	50 %	384137225
4060	NC_017168	TGC	2	6	243404	243409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137225
4061	NC_017168	CAA	2	6	243486	243491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137225
4062	NC_017168	AGTC	2	8	243585	243592	25 %	25 %	25 %	25 %	384137225
4063	NC_017168	CTG	2	6	243631	243636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137225
4064	NC_017168	GGC	2	6	243735	243740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137225
4065	NC_017168	ACC	2	6	243763	243768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137225
4066	NC_017168	TGG	2	6	244182	244187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137226
4067	NC_017168	CGT	2	6	244217	244222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137226
4068	NC_017168	AGA	2	6	244252	244257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137226
4069	NC_017168	CTG	2	6	244268	244273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137226
4070	NC_017168	GGT	2	6	244301	244306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137226
4071	NC_017168	TGTTC	2	10	244318	244327	0 %	60 %	20 %	20 %	384137226
4072	NC_017168	CCG	2	6	244441	244446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137226
4073	NC_017168	TTC	2	6	244460	244465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137226
4074	NC_017168	TTTGG	2	10	244499	244508	0 %	60 %	40 %	0 %	384137226
4075	NC_017168	GTG	2	6	244715	244720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137226
4076	NC_017168	ATC	2	6	244727	244732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137226
4077	NC_017168	CAT	2	6	244810	244815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137226
4078	NC_017168	AAC	2	6	244842	244847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137226
4079	NC_017168	TAT	3	9	244912	244920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137226
4080	NC_017168	GAT	2	6	244921	244926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137226
4081	NC_017168	TGA	2	6	244989	244994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137227
4082	NC_017168	A	6	6	244994	244999	100 %	0 %	0 %	0 %	384137227
4083	NC_017168	GAA	2	6	245006	245011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137227
4084	NC_017168	GTACCG	2	12	245031	245042	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384137227
4085	NC_017168	CAC	2	6	245104	245109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137227
4086	NC_017168	GTT	2	6	245143	245148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137227
4087	NC_017168	AAT	2	6	245192	245197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137227
4088	NC_017168	G	6	6	245271	245276	0 %	0 %	100 %	0 %	384137227
4089	NC_017168	CTG	2	6	245277	245282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137227
4090	NC_017168	TCAA	2	8	245316	245323	50 %	25 %	0 %	25 %	384137227
4091	NC_017168	ATT	2	6	245351	245356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137227
4092	NC_017168	CCATG	2	10	245402	245411	20 %	20 %	20 %	40 %	384137227
4093	NC_017168	TTA	2	6	245516	245521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137227
4094	NC_017168	ATG	2	6	245528	245533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137227
4095	NC_017168	GCA	2	6	245536	245541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137227
4096	NC_017168	GAT	2	6	245702	245707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137227
4097	NC_017168	TAA	2	6	246088	246093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137228
4098	NC_017168	TAG	2	6	246124	246129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137228
4099	NC_017168	CAT	2	6	246177	246182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137228
4100	NC_017168	GCTG	2	8	246350	246357	0 %	25 %	50 %	25 %	384137228
4101	NC_017168	TTAT	2	8	246363	246370	25 %	75 %	0 %	0 %	384137228
4102	NC_017168	AAT	2	6	246392	246397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137228
4103	NC_017168	AACG	2	8	246400	246407	50 %	0 %	25 %	25 %	384137228
4104	NC_017168	GCC	2	6	246611	246616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137229
4105	NC_017168	CGC	2	6	246625	246630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137229
4106	NC_017168	CTG	2	6	246634	246639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137229
4107	NC_017168	TCGC	2	8	246724	246731	0 %	25 %	25 %	50 %	384137229
4108	NC_017168	CATT	2	8	246778	246785	25 %	50 %	0 %	25 %	384137229
4109	NC_017168	TC	4	8	246789	246796	0 %	50 %	0 %	50 %	384137229
4110	NC_017168	CAGGAG	2	12	246804	246815	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384137229
4111	NC_017168	GTTCG	2	10	246822	246831	0 %	40 %	40 %	20 %	384137229
4112	NC_017168	GAC	2	6	246844	246849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137229
4113	NC_017168	CTT	2	6	247001	247006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137229
4114	NC_017168	TGG	2	6	247007	247012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137229
4115	NC_017168	CG	3	6	247018	247023	0 %	0 %	50 %	50 %	384137229
4116	NC_017168	TC	3	6	247132	247137	0 %	50 %	0 %	50 %	384137229
4117	NC_017168	AAGGT	2	10	247171	247180	40 %	20 %	40 %	0 %	384137229
4118	NC_017168	GCTG	2	8	247291	247298	0 %	25 %	50 %	25 %	384137229
4119	NC_017168	AGC	2	6	247366	247371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137229
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4121	NC_017168	TGA	2	6	247421	247426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137229
4122	NC_017168	CAT	2	6	247458	247463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137229
4123	NC_017168	TGA	2	6	247503	247508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137229
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4240	NC_017168	GTGGC	2	10	253509	253518	0 %	20 %	60 %	20 %	384137232
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4243	NC_017168	ATG	2	6	253668	253673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137232
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4360	NC_017168	CA	3	6	259718	259723	50 %	0 %	0 %	50 %	384137234
4361	NC_017168	CA	3	6	259727	259732	50 %	0 %	0 %	50 %	384137234
4362	NC_017168	CA	3	6	259736	259741	50 %	0 %	0 %	50 %	384137234
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4364	NC_017168	CA	3	6	259781	259786	50 %	0 %	0 %	50 %	384137234
4365	NC_017168	CA	3	6	259790	259795	50 %	0 %	0 %	50 %	384137234
4366	NC_017168	CA	3	6	259799	259804	50 %	0 %	0 %	50 %	384137234
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