MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017168	GAT	2	6	214699	214704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137198
3502	NC_017168	TATC	2	8	214724	214731	25 %	50 %	0 %	25 %	384137198
3503	NC_017168	AG	3	6	214761	214766	50 %	0 %	50 %	0 %	384137199
3504	NC_017168	ATT	3	9	214783	214791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137199
3505	NC_017168	CTA	2	6	214816	214821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137199
3506	NC_017168	AT	3	6	214897	214902	50 %	50 %	0 %	0 %	384137199
3507	NC_017168	A	6	6	214908	214913	100 %	0 %	0 %	0 %	384137199
3508	NC_017168	AC	3	6	214955	214960	50 %	0 %	0 %	50 %	384137199
3509	NC_017168	GAT	2	6	214985	214990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137199
3510	NC_017168	AAAT	2	8	215028	215035	75 %	25 %	0 %	0 %	384137199
3511	NC_017168	AG	3	6	215075	215080	50 %	0 %	50 %	0 %	384137199
3512	NC_017168	ATA	2	6	215151	215156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137199
3513	NC_017168	TC	3	6	215175	215180	0 %	50 %	0 %	50 %	384137199
3514	NC_017168	AGG	2	6	215184	215189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137199
3515	NC_017168	GAA	2	6	215222	215227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137199
3516	NC_017168	AGTG	2	8	215231	215238	25 %	25 %	50 %	0 %	384137199
3517	NC_017168	A	6	6	215248	215253	100 %	0 %	0 %	0 %	384137199
3518	NC_017168	TATT	2	8	215274	215281	25 %	75 %	0 %	0 %	384137199
3519	NC_017168	ATAA	2	8	215283	215290	75 %	25 %	0 %	0 %	384137199
3520	NC_017168	TAA	2	6	215338	215343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137200
3521	NC_017168	AAT	2	6	215387	215392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137200
3522	NC_017168	TCT	2	6	215439	215444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137200
3523	NC_017168	CAAA	2	8	215493	215500	75 %	0 %	0 %	25 %	384137200
3524	NC_017168	GAT	2	6	215574	215579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137200
3525	NC_017168	AAT	2	6	215588	215593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137200
3526	NC_017168	TAA	3	9	215609	215617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137200
3527	NC_017168	AAC	2	6	215657	215662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137200
3528	NC_017168	TTTAC	2	10	215689	215698	20 %	60 %	0 %	20 %	384137201
3529	NC_017168	TGT	2	6	215715	215720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137201
3530	NC_017168	TAT	2	6	215742	215747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137201
3531	NC_017168	AAT	2	6	215779	215784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137201
3532	NC_017168	TTA	2	6	215810	215815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137201
3533	NC_017168	TTA	2	6	215828	215833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137201
3534	NC_017168	TA	3	6	215869	215874	50 %	50 %	0 %	0 %	384137201
3535	NC_017168	ATT	2	6	215888	215893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137201
3536	NC_017168	TAT	2	6	215910	215915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137201
3537	NC_017168	AAAT	2	8	215972	215979	75 %	25 %	0 %	0 %	384137201
3538	NC_017168	ATTC	2	8	215988	215995	25 %	50 %	0 %	25 %	384137201
3539	NC_017168	GAA	2	6	216027	216032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137201
3540	NC_017168	CTTA	2	8	216053	216060	25 %	50 %	0 %	25 %	384137201
3541	NC_017168	AAATA	2	10	216075	216084	80 %	20 %	0 %	0 %	384137201
3542	NC_017168	TCA	2	6	216141	216146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137201
3543	NC_017168	AATG	2	8	216160	216167	50 %	25 %	25 %	0 %	384137201
3544	NC_017168	ATC	2	6	216202	216207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137201
3545	NC_017168	GCATT	2	10	216283	216292	20 %	40 %	20 %	20 %	384137202
3546	NC_017168	TGA	2	6	216319	216324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137202
3547	NC_017168	CAT	2	6	216340	216345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137202
3548	NC_017168	ATT	2	6	216349	216354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137202
3549	NC_017168	TAT	2	6	216366	216371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137202
3550	NC_017168	A	6	6	216377	216382	100 %	0 %	0 %	0 %	384137202
3551	NC_017168	AGAA	2	8	216397	216404	75 %	0 %	25 %	0 %	384137202
3552	NC_017168	GAA	2	6	216426	216431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137202
3553	NC_017168	TAA	2	6	216448	216453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137202
3554	NC_017168	A	6	6	216452	216457	100 %	0 %	0 %	0 %	384137202
3555	NC_017168	AGG	2	6	216506	216511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137202
3556	NC_017168	ATA	2	6	216556	216561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137202
3557	NC_017168	GAA	2	6	216609	216614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137202
3558	NC_017168	T	6	6	216827	216832	0 %	100 %	0 %	0 %	384137202
3559	NC_017168	GAG	2	6	216859	216864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137202
3560	NC_017168	ATT	2	6	216872	216877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137202
3561	NC_017168	GCT	2	6	216924	216929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137202
3562	NC_017168	ATG	2	6	216961	216966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137202
3563	NC_017168	AAT	2	6	216984	216989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137202
3564	NC_017168	TAAA	2	8	217057	217064	75 %	25 %	0 %	0 %	384137202
3565	NC_017168	ATTA	2	8	217101	217108	50 %	50 %	0 %	0 %	384137202
3566	NC_017168	TA	3	6	217107	217112	50 %	50 %	0 %	0 %	384137202
3567	NC_017168	TTA	2	6	217136	217141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137202
3568	NC_017168	CAT	2	6	217218	217223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137202
3569	NC_017168	TGA	2	6	217224	217229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137202
3570	NC_017168	CTAT	2	8	217283	217290	25 %	50 %	0 %	25 %	384137203
3571	NC_017168	GAAA	2	8	217310	217317	75 %	0 %	25 %	0 %	384137203
3572	NC_017168	A	6	6	217356	217361	100 %	0 %	0 %	0 %	384137203
3573	NC_017168	TAA	2	6	217377	217382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137203
3574	NC_017168	TGT	2	6	217383	217388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137203
3575	NC_017168	TGA	2	6	217451	217456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137203
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3577	NC_017168	TGC	2	6	217560	217565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137203
3578	NC_017168	TGA	2	6	217580	217585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137203
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3581	NC_017168	TGGT	2	8	217702	217709	0 %	50 %	50 %	0 %	384137203
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3589	NC_017168	T	6	6	217975	217980	0 %	100 %	0 %	0 %	384137203
3590	NC_017168	TGGT	2	8	218007	218014	0 %	50 %	50 %	0 %	384137203
3591	NC_017168	TAAG	2	8	218051	218058	50 %	25 %	25 %	0 %	384137203
3592	NC_017168	T	6	6	218082	218087	0 %	100 %	0 %	0 %	384137203
3593	NC_017168	C	6	6	218089	218094	0 %	0 %	0 %	100 %	384137203
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3595	NC_017168	AATA	2	8	218128	218135	75 %	25 %	0 %	0 %	384137203
3596	NC_017168	A	8	8	218155	218162	100 %	0 %	0 %	0 %	384137203
3597	NC_017168	ATT	2	6	218181	218186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137203
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3599	NC_017168	TGA	2	6	218211	218216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137203
3600	NC_017168	ATT	2	6	218246	218251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137203
3601	NC_017168	TGA	3	9	218283	218291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137203
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3603	NC_017168	ATA	2	6	218372	218377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137203
3604	NC_017168	AGC	2	6	218386	218391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137203
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3606	NC_017168	AGA	2	6	218439	218444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137204
3607	NC_017168	CTA	2	6	218448	218453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137204
3608	NC_017168	ATTAC	2	10	218488	218497	40 %	40 %	0 %	20 %	384137204
3609	NC_017168	TAA	2	6	218533	218538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137204
3610	NC_017168	ATC	2	6	218557	218562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137204
3611	NC_017168	A	6	6	218586	218591	100 %	0 %	0 %	0 %	384137204
3612	NC_017168	AAAT	3	12	218635	218646	75 %	25 %	0 %	0 %	384137204
3613	NC_017168	TAAAAA	2	12	218651	218662	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384137204
3614	NC_017168	TGG	2	6	218690	218695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137204
3615	NC_017168	AAAT	2	8	218710	218717	75 %	25 %	0 %	0 %	384137204
3616	NC_017168	AAAT	2	8	218762	218769	75 %	25 %	0 %	0 %	384137204
3617	NC_017168	AT	3	6	218794	218799	50 %	50 %	0 %	0 %	384137204
3618	NC_017168	GAT	4	12	218811	218822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137204
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3620	NC_017168	T	8	8	218900	218907	0 %	100 %	0 %	0 %	384137205
3621	NC_017168	TAT	2	6	218973	218978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137205
3622	NC_017168	ATC	2	6	218991	218996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137205
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3990	NC_017168	CT	3	6	238987	238992	0 %	50 %	0 %	50 %	384137222
3991	NC_017168	TTC	2	6	239011	239016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137222
3992	NC_017168	ATC	2	6	239049	239054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137222
3993	NC_017168	T	6	6	239093	239098	0 %	100 %	0 %	0 %	384137222
3994	NC_017168	AT	3	6	239131	239136	50 %	50 %	0 %	0 %	384137222
3995	NC_017168	ATCA	2	8	239193	239200	50 %	25 %	0 %	25 %	384137222
3996	NC_017168	CAG	2	6	239289	239294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137222
3997	NC_017168	GAT	2	6	239324	239329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137222
3998	NC_017168	ATTGC	2	10	239330	239339	20 %	40 %	20 %	20 %	384137222
3999	NC_017168	TCT	2	6	239712	239717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137223
4000	NC_017168	GCT	2	6	239795	239800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137223

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