MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017168	GTT	2	6	186222	186227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137172
3002	NC_017168	CTGA	2	8	186264	186271	25 %	25 %	25 %	25 %	384137172
3003	NC_017168	TGT	2	6	186292	186297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137172
3004	NC_017168	CAG	2	6	186305	186310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137172
3005	NC_017168	TGA	2	6	186311	186316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137172
3006	NC_017168	CAA	2	6	186383	186388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137172
3007	NC_017168	TCAAA	2	10	186473	186482	60 %	20 %	0 %	20 %	384137172
3008	NC_017168	CAC	2	6	186756	186761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137173
3009	NC_017168	GCG	2	6	186820	186825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137173
3010	NC_017168	CTGC	2	8	186916	186923	0 %	25 %	25 %	50 %	384137173
3011	NC_017168	CAT	2	6	186932	186937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137173
3012	NC_017168	GC	3	6	186942	186947	0 %	0 %	50 %	50 %	384137173
3013	NC_017168	C	6	6	187005	187010	0 %	0 %	0 %	100 %	384137173
3014	NC_017168	GC	3	6	187012	187017	0 %	0 %	50 %	50 %	384137173
3015	NC_017168	GCG	2	6	187041	187046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137173
3016	NC_017168	TCA	3	9	187073	187081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137173
3017	NC_017168	ACA	2	6	187133	187138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137173
3018	NC_017168	CAC	2	6	187142	187147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137173
3019	NC_017168	AGC	2	6	187148	187153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137173
3020	NC_017168	CGC	2	6	187199	187204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137173
3021	NC_017168	GCC	2	6	187225	187230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137173
3022	NC_017168	CCAG	2	8	187289	187296	25 %	0 %	25 %	50 %	384137173
3023	NC_017168	CAA	2	6	187344	187349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137173
3024	NC_017168	CCG	2	6	187358	187363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137173
3025	NC_017168	TGGTGT	2	12	187389	187400	0 %	50 %	50 %	0 %	384137173
3026	NC_017168	TGCGG	2	10	187479	187488	0 %	20 %	60 %	20 %	384137173
3027	NC_017168	GGT	2	6	187572	187577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137173
3028	NC_017168	CAA	2	6	187589	187594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137173
3029	NC_017168	ATGAAT	2	12	187674	187685	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384137173
3030	NC_017168	CGA	2	6	187781	187786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137173
3031	NC_017168	CGC	2	6	187876	187881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137174
3032	NC_017168	GGC	2	6	187994	187999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137174
3033	NC_017168	AGC	2	6	188031	188036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137174
3034	NC_017168	TGC	2	6	188044	188049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137174
3035	NC_017168	TCA	2	6	188053	188058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137174
3036	NC_017168	CGC	2	6	188122	188127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137174
3037	NC_017168	ACA	2	6	188280	188285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137174
3038	NC_017168	CAG	2	6	188394	188399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137175
3039	NC_017168	CGA	2	6	188405	188410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137175
3040	NC_017168	GCC	2	6	188416	188421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137175
3041	NC_017168	GGT	2	6	188443	188448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137175
3042	NC_017168	CGC	2	6	188577	188582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137175
3043	NC_017168	GGC	2	6	188646	188651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137175
3044	NC_017168	GCC	2	6	188692	188697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137175
3045	NC_017168	CG	3	6	188703	188708	0 %	0 %	50 %	50 %	384137175
3046	NC_017168	AAG	2	6	188740	188745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137175
3047	NC_017168	GAA	2	6	188766	188771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137175
3048	NC_017168	CCAGCG	2	12	188816	188827	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384137175
3049	NC_017168	GTT	2	6	189033	189038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137175
3050	NC_017168	TTC	2	6	189049	189054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137175
3051	NC_017168	ATC	2	6	189064	189069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137175
3052	NC_017168	ACC	2	6	189081	189086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137175
3053	NC_017168	AAGTTA	2	12	189103	189114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384137175
3054	NC_017168	CCA	2	6	189209	189214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137175
3055	NC_017168	GTT	2	6	189288	189293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137176
3056	NC_017168	GTT	2	6	189301	189306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137176
3057	NC_017168	GTT	2	6	189310	189315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137176
3058	NC_017168	TGC	2	6	189318	189323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137176
3059	NC_017168	TTG	2	6	189329	189334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137176
3060	NC_017168	GAA	2	6	189340	189345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137176
3061	NC_017168	GTA	2	6	189346	189351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137176
3062	NC_017168	ACAGCA	2	12	189356	189367	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384137176
3063	NC_017168	GTC	2	6	189410	189415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137176
3064	NC_017168	AC	3	6	189435	189440	50 %	0 %	0 %	50 %	384137176
3065	NC_017168	CTT	2	6	189447	189452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137176
3066	NC_017168	TCA	2	6	189548	189553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137176
3067	NC_017168	CAA	2	6	189640	189645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137176
3068	NC_017168	CCG	2	6	189657	189662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137176
3069	NC_017168	CTGC	2	8	189666	189673	0 %	25 %	25 %	50 %	384137176
3070	NC_017168	TCTGC	2	10	189686	189695	0 %	40 %	20 %	40 %	384137176
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3072	NC_017168	ATC	2	6	189734	189739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137176
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3079	NC_017168	ATTG	2	8	190124	190131	25 %	50 %	25 %	0 %	384137177
3080	NC_017168	GT	3	6	190144	190149	0 %	50 %	50 %	0 %	384137177
3081	NC_017168	CGT	2	6	190246	190251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137177
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3083	NC_017168	TCA	2	6	190479	190484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137177
3084	NC_017168	CCA	2	6	190489	190494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137177
3085	NC_017168	TCA	2	6	190557	190562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137177
3086	NC_017168	T	6	6	190615	190620	0 %	100 %	0 %	0 %	384137178
3087	NC_017168	CAC	2	6	190645	190650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137178
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3089	NC_017168	GTT	2	6	190690	190695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137178
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3091	NC_017168	TGC	2	6	190828	190833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137178
3092	NC_017168	GTT	2	6	190858	190863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137178
3093	NC_017168	ACA	2	6	190928	190933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137178
3094	NC_017168	GATT	2	8	190954	190961	25 %	50 %	25 %	0 %	384137178
3095	NC_017168	TAT	2	6	191112	191117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137178
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3098	NC_017168	CAT	3	9	191224	191232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137178
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3100	NC_017168	CTG	2	6	191277	191282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137178
3101	NC_017168	GCC	2	6	191335	191340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137178
3102	NC_017168	CAG	2	6	191446	191451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137178
3103	NC_017168	CCA	2	6	191490	191495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137178
3104	NC_017168	AAT	2	6	191596	191601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137178
3105	NC_017168	CT	3	6	191657	191662	0 %	50 %	0 %	50 %	384137178
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3108	NC_017168	GCAT	2	8	191805	191812	25 %	25 %	25 %	25 %	384137179
3109	NC_017168	TGT	2	6	191842	191847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137179
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3111	NC_017168	CAT	2	6	192263	192268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137179
3112	NC_017168	ATCA	2	8	192360	192367	50 %	25 %	0 %	25 %	384137179
3113	NC_017168	GACCA	2	10	192402	192411	40 %	0 %	20 %	40 %	384137179
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3116	NC_017168	GGTGA	2	10	192493	192502	20 %	20 %	60 %	0 %	384137179
3117	NC_017168	CCA	2	6	192532	192537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137179
3118	NC_017168	CGG	2	6	192569	192574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137179
3119	NC_017168	TG	3	6	192575	192580	0 %	50 %	50 %	0 %	384137179
3120	NC_017168	GGC	2	6	192615	192620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137179
3121	NC_017168	GCA	2	6	192628	192633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137179
3122	NC_017168	ATC	2	6	192669	192674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137179
3123	NC_017168	TGC	2	6	192686	192691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137179
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3125	NC_017168	CGC	2	6	192717	192722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137179
3126	NC_017168	CGC	2	6	192729	192734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137179
3127	NC_017168	GATCA	2	10	192735	192744	40 %	20 %	20 %	20 %	384137179
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3129	NC_017168	TGC	2	6	192778	192783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137179
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3134	NC_017168	GGCT	2	8	193416	193423	0 %	25 %	50 %	25 %	384137180
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3145	NC_017168	AAC	2	6	194863	194868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137182
3146	NC_017168	A	6	6	195132	195137	100 %	0 %	0 %	0 %	384137182
3147	NC_017168	A	6	6	195165	195170	100 %	0 %	0 %	0 %	384137182
3148	NC_017168	AAC	2	6	195243	195248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137182
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3151	NC_017168	G	7	7	195452	195458	0 %	0 %	100 %	0 %	384137182
3152	NC_017168	CCCG	2	8	195586	195593	0 %	0 %	25 %	75 %	384137182
3153	NC_017168	GTA	2	6	195597	195602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137182
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3177	NC_017168	CATT	2	8	197530	197537	25 %	50 %	0 %	25 %	384137185
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3220	NC_017168	CTG	2	6	200198	200203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137187
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3224	NC_017168	TGA	2	6	200491	200496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137187
3225	NC_017168	TGT	2	6	200508	200513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137187
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3227	NC_017168	CTG	2	6	200598	200603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137187
3228	NC_017168	GCC	2	6	200672	200677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137187
3229	NC_017168	T	6	6	200839	200844	0 %	100 %	0 %	0 %	384137187
3230	NC_017168	TCA	2	6	200861	200866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137187
3231	NC_017168	CGT	2	6	200988	200993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137187
3232	NC_017168	C	6	6	200996	201001	0 %	0 %	0 %	100 %	384137187
3233	NC_017168	CAG	2	6	201193	201198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137187
3234	NC_017168	ACC	2	6	201267	201272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137187
3235	NC_017168	GTG	2	6	201292	201297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137187
3236	NC_017168	CCAT	2	8	201317	201324	25 %	25 %	0 %	50 %	384137187
3237	NC_017168	TCA	2	6	201351	201356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137187
3238	NC_017168	TGC	2	6	201399	201404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137187
3239	NC_017168	GCT	2	6	201474	201479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137187
3240	NC_017168	ATC	2	6	201487	201492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137187
3241	NC_017168	TAA	2	6	201531	201536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137187
3242	NC_017168	TGC	2	6	201583	201588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137187
3243	NC_017168	GC	3	6	201594	201599	0 %	0 %	50 %	50 %	384137187
3244	NC_017168	CAC	2	6	201639	201644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137187
3245	NC_017168	CAC	2	6	201675	201680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137187
3246	NC_017168	TCA	2	6	201686	201691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137187
3247	NC_017168	AATT	2	8	201744	201751	50 %	50 %	0 %	0 %	384137187
3248	NC_017168	ATC	2	6	201781	201786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137187
3249	NC_017168	CAT	2	6	201804	201809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137187
3250	NC_017168	ACA	2	6	201816	201821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137187
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3252	NC_017168	CAC	2	6	201900	201905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137187
3253	NC_017168	ATC	2	6	201946	201951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137187
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3255	NC_017168	CGA	2	6	202089	202094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137187
3256	NC_017168	ATC	2	6	202102	202107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137187
3257	NC_017168	AG	3	6	202135	202140	50 %	0 %	50 %	0 %	384137187
3258	NC_017168	TG	3	6	202145	202150	0 %	50 %	50 %	0 %	384137187
3259	NC_017168	CTGC	3	12	202223	202234	0 %	25 %	25 %	50 %	384137187
3260	NC_017168	ATA	2	6	202262	202267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137187
3261	NC_017168	AAT	2	6	202345	202350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137187
3262	NC_017168	TAT	2	6	202401	202406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137187
3263	NC_017168	AGGTG	2	10	202415	202424	20 %	20 %	60 %	0 %	384137187
3264	NC_017168	TAA	2	6	202441	202446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137187
3265	NC_017168	CATA	2	8	202488	202495	50 %	25 %	0 %	25 %	384137187
3266	NC_017168	CAC	2	6	202611	202616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137188
3267	NC_017168	GTA	2	6	202621	202626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137188
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3269	NC_017168	ATT	2	6	202651	202656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137188
3270	NC_017168	T	6	6	202655	202660	0 %	100 %	0 %	0 %	384137188
3271	NC_017168	ATT	2	6	202696	202701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137188
3272	NC_017168	TTTCC	2	10	202736	202745	0 %	60 %	0 %	40 %	384137188
3273	NC_017168	AAT	2	6	202777	202782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137188
3274	NC_017168	CAC	2	6	202999	203004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137188
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3293	NC_017168	TGC	2	6	204355	204360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137188
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3351	NC_017168	TGTT	2	8	208774	208781	0 %	75 %	25 %	0 %	384137192
3352	NC_017168	AGT	2	6	208815	208820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137192
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3356	NC_017168	ATT	2	6	208918	208923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137192
3357	NC_017168	AATA	2	8	208929	208936	75 %	25 %	0 %	0 %	384137192
3358	NC_017168	TAA	2	6	208967	208972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137192
3359	NC_017168	ATGA	2	8	208990	208997	50 %	25 %	25 %	0 %	384137192
3360	NC_017168	GA	3	6	208996	209001	50 %	0 %	50 %	0 %	384137192
3361	NC_017168	TTA	2	6	209010	209015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137192
3362	NC_017168	ATAA	2	8	209016	209023	75 %	25 %	0 %	0 %	384137192
3363	NC_017168	ATT	2	6	209062	209067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137193
3364	NC_017168	T	8	8	209078	209085	0 %	100 %	0 %	0 %	384137193
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3490	NC_017168	A	7	7	214315	214321	100 %	0 %	0 %	0 %	384137198
3491	NC_017168	TTG	2	6	214336	214341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137198
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3493	NC_017168	TAA	2	6	214407	214412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137198
3494	NC_017168	TAGAT	2	10	214479	214488	40 %	40 %	20 %	0 %	384137198
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3499	NC_017168	AGAT	2	8	214652	214659	50 %	25 %	25 %	0 %	384137198
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