MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017168	CAGA	2	8	91647	91654	50 %	0 %	25 %	25 %	384137082
1502	NC_017168	CG	3	6	92064	92069	0 %	0 %	50 %	50 %	384137083
1503	NC_017168	GTC	2	6	92083	92088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137083
1504	NC_017168	GGT	2	6	92102	92107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137083
1505	NC_017168	CAAT	2	8	92110	92117	50 %	25 %	0 %	25 %	384137083
1506	NC_017168	CTG	2	6	92148	92153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137083
1507	NC_017168	TCA	2	6	92243	92248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137083
1508	NC_017168	GAGT	2	8	92273	92280	25 %	25 %	50 %	0 %	384137083
1509	NC_017168	GT	3	6	92311	92316	0 %	50 %	50 %	0 %	384137083
1510	NC_017168	A	7	7	92360	92366	100 %	0 %	0 %	0 %	384137083
1511	NC_017168	ATC	2	6	92425	92430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137083
1512	NC_017168	CCT	2	6	92467	92472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137083
1513	NC_017168	ACG	2	6	92475	92480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137083
1514	NC_017168	ATT	2	6	92487	92492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137083
1515	NC_017168	TAT	2	6	92495	92500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137083
1516	NC_017168	GTT	2	6	92504	92509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137083
1517	NC_017168	CATT	2	8	92549	92556	25 %	50 %	0 %	25 %	384137083
1518	NC_017168	AATG	2	8	92561	92568	50 %	25 %	25 %	0 %	384137083
1519	NC_017168	ATC	2	6	92590	92595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137083
1520	NC_017168	CGT	2	6	92604	92609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137083
1521	NC_017168	AGC	2	6	92615	92620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137083
1522	NC_017168	CAT	2	6	92630	92635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137083
1523	NC_017168	GGC	2	6	92654	92659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137083
1524	NC_017168	GCA	2	6	92808	92813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137083
1525	NC_017168	GCA	2	6	92927	92932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137083
1526	NC_017168	AATG	2	8	92961	92968	50 %	25 %	25 %	0 %	384137083
1527	NC_017168	GATCTG	2	12	93150	93161	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384137084
1528	NC_017168	AAG	2	6	93208	93213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137084
1529	NC_017168	CT	3	6	93245	93250	0 %	50 %	0 %	50 %	384137084
1530	NC_017168	CCGA	2	8	93315	93322	25 %	0 %	25 %	50 %	384137084
1531	NC_017168	CGT	2	6	93356	93361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137084
1532	NC_017168	TCT	2	6	93384	93389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137084
1533	NC_017168	GTTG	2	8	93443	93450	0 %	50 %	50 %	0 %	384137084
1534	NC_017168	A	6	6	93483	93488	100 %	0 %	0 %	0 %	384137084
1535	NC_017168	GAC	2	6	93489	93494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137084
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1537	NC_017168	TGT	2	6	93625	93630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137084
1538	NC_017168	CAG	2	6	93631	93636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137084
1539	NC_017168	TGG	2	6	93695	93700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137084
1540	NC_017168	TTG	2	6	93763	93768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137084
1541	NC_017168	GGT	2	6	93771	93776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137084
1542	NC_017168	CTGAT	2	10	93835	93844	20 %	40 %	20 %	20 %	384137084
1543	NC_017168	CGAA	2	8	93949	93956	50 %	0 %	25 %	25 %	384137084
1544	NC_017168	CGA	2	6	93989	93994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137084
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1546	NC_017168	GGT	2	6	94146	94151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137084
1547	NC_017168	GCA	2	6	94161	94166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137084
1548	NC_017168	GGT	2	6	94215	94220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137084
1549	NC_017168	TCG	2	6	94234	94239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137084
1550	NC_017168	A	6	6	94245	94250	100 %	0 %	0 %	0 %	384137084
1551	NC_017168	CTGC	2	8	94251	94258	0 %	25 %	25 %	50 %	384137084
1552	NC_017168	GC	3	6	94277	94282	0 %	0 %	50 %	50 %	384137084
1553	NC_017168	TCA	2	6	94446	94451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137085
1554	NC_017168	TGA	2	6	94456	94461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137085
1555	NC_017168	CAG	2	6	94509	94514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137085
1556	NC_017168	GC	3	6	94570	94575	0 %	0 %	50 %	50 %	384137085
1557	NC_017168	CGG	2	6	94600	94605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137085
1558	NC_017168	TGC	2	6	94654	94659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137085
1559	NC_017168	GAA	2	6	94750	94755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137085
1560	NC_017168	GCG	2	6	94805	94810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137085
1561	NC_017168	TTCTC	2	10	94826	94835	0 %	60 %	0 %	40 %	384137085
1562	NC_017168	GCA	2	6	94884	94889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137085
1563	NC_017168	TGG	2	6	94948	94953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137085
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1565	NC_017168	CTT	2	6	94989	94994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137085
1566	NC_017168	CTG	2	6	95223	95228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137085
1567	NC_017168	AAG	2	6	95238	95243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137085
1568	NC_017168	TAC	2	6	95393	95398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137085
1569	NC_017168	TGC	2	6	95419	95424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137085
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1571	NC_017168	CTC	2	6	95644	95649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137086
1572	NC_017168	CAG	2	6	95691	95696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137086
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1580	NC_017168	ATC	2	6	96055	96060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137087
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1591	NC_017168	TGA	2	6	96402	96407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137087
1592	NC_017168	ATT	2	6	96436	96441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137087
1593	NC_017168	CAA	2	6	96444	96449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137087
1594	NC_017168	TAT	2	6	96450	96455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137087
1595	NC_017168	CCG	2	6	96477	96482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137087
1596	NC_017168	ATG	2	6	96509	96514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137087
1597	NC_017168	CAT	2	6	96549	96554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137087
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1603	NC_017168	CAT	2	6	97163	97168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137088
1604	NC_017168	TGA	2	6	97170	97175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137088
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1607	NC_017168	G	7	7	97281	97287	0 %	0 %	100 %	0 %	384137088
1608	NC_017168	G	6	6	97314	97319	0 %	0 %	100 %	0 %	384137088
1609	NC_017168	GGC	2	6	97327	97332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137088
1610	NC_017168	G	6	6	97338	97343	0 %	0 %	100 %	0 %	384137088
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1612	NC_017168	G	7	7	97468	97474	0 %	0 %	100 %	0 %	384137088
1613	NC_017168	T	6	6	97538	97543	0 %	100 %	0 %	0 %	384137088
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1620	NC_017168	TCAGGT	2	12	98221	98232	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384137089
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1622	NC_017168	A	6	6	98357	98362	100 %	0 %	0 %	0 %	384137089
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1625	NC_017168	TGA	2	6	98554	98559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137089
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1991	NC_017168	GCG	2	6	123730	123735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137113
1992	NC_017168	CG	3	6	123734	123739	0 %	0 %	50 %	50 %	384137113
1993	NC_017168	AT	3	6	123795	123800	50 %	50 %	0 %	0 %	384137113
1994	NC_017168	TTC	2	6	123841	123846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137113
1995	NC_017168	TCA	2	6	123950	123955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137113
1996	NC_017168	ATG	2	6	123990	123995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137113
1997	NC_017168	GTG	2	6	124011	124016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137113
1998	NC_017168	CGA	2	6	124048	124053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137113
1999	NC_017168	ATGT	2	8	124070	124077	25 %	50 %	25 %	0 %	384137113
2000	NC_017168	GGC	2	6	124078	124083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137113

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