MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017168	ATAA	2	8	60629	60636	75 %	25 %	0 %	0 %	384137058
1002	NC_017168	AT	3	6	60637	60642	50 %	50 %	0 %	0 %	384137058
1003	NC_017168	AT	3	6	60706	60711	50 %	50 %	0 %	0 %	384137058
1004	NC_017168	CAC	2	6	60779	60784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137058
1005	NC_017168	TAT	2	6	60798	60803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1006	NC_017168	CT	3	6	60814	60819	0 %	50 %	0 %	50 %	384137058
1007	NC_017168	AG	3	6	60825	60830	50 %	0 %	50 %	0 %	384137058
1008	NC_017168	GA	3	6	60834	60839	50 %	0 %	50 %	0 %	384137058
1009	NC_017168	TAA	4	12	60853	60864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137058
1010	NC_017168	ATA	2	6	60927	60932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137058
1011	NC_017168	TAC	2	6	60976	60981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137058
1012	NC_017168	TA	3	6	60990	60995	50 %	50 %	0 %	0 %	384137058
1013	NC_017168	AATT	2	8	61036	61043	50 %	50 %	0 %	0 %	384137058
1014	NC_017168	CCT	2	6	61055	61060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137058
1015	NC_017168	ATTAG	2	10	61070	61079	40 %	40 %	20 %	0 %	384137058
1016	NC_017168	ATG	2	6	61157	61162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137058
1017	NC_017168	AGGA	2	8	61167	61174	50 %	0 %	50 %	0 %	384137058
1018	NC_017168	ACA	2	6	61199	61204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137058
1019	NC_017168	ATTCA	2	10	61246	61255	40 %	40 %	0 %	20 %	384137058
1020	NC_017168	ATA	2	6	61317	61322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137058
1021	NC_017168	TTAC	2	8	61325	61332	25 %	50 %	0 %	25 %	384137058
1022	NC_017168	AATAA	2	10	61376	61385	80 %	20 %	0 %	0 %	384137058
1023	NC_017168	T	6	6	61432	61437	0 %	100 %	0 %	0 %	384137058
1024	NC_017168	TGA	2	6	61441	61446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137058
1025	NC_017168	GTT	2	6	61454	61459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137058
1026	NC_017168	ATT	2	6	61468	61473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1027	NC_017168	ATT	2	6	61529	61534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1028	NC_017168	AGTT	2	8	61572	61579	25 %	50 %	25 %	0 %	384137058
1029	NC_017168	TAA	2	6	61585	61590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137058
1030	NC_017168	AAC	2	6	61609	61614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137058
1031	NC_017168	CCTG	2	8	61669	61676	0 %	25 %	25 %	50 %	384137058
1032	NC_017168	CGA	2	6	61770	61775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137058
1033	NC_017168	ATT	3	9	61805	61813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1034	NC_017168	ATA	2	6	61827	61832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137058
1035	NC_017168	ATA	2	6	61857	61862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137058
1036	NC_017168	ACTAA	2	10	61904	61913	60 %	20 %	0 %	20 %	384137058
1037	NC_017168	GTT	2	6	61949	61954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137058
1038	NC_017168	CTGG	2	8	61997	62004	0 %	25 %	50 %	25 %	384137058
1039	NC_017168	TGG	2	6	62100	62105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137058
1040	NC_017168	TGAA	2	8	62166	62173	50 %	25 %	25 %	0 %	384137058
1041	NC_017168	CAA	2	6	62202	62207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137058
1042	NC_017168	ATG	2	6	62241	62246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137058
1043	NC_017168	ACA	2	6	62271	62276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137058
1044	NC_017168	G	6	6	62328	62333	0 %	0 %	100 %	0 %	384137058
1045	NC_017168	AAC	2	6	62338	62343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137058
1046	NC_017168	A	6	6	62351	62356	100 %	0 %	0 %	0 %	384137058
1047	NC_017168	AAT	2	6	62375	62380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137058
1048	NC_017168	ATAG	2	8	62381	62388	50 %	25 %	25 %	0 %	384137058
1049	NC_017168	GTCA	2	8	62419	62426	25 %	25 %	25 %	25 %	384137058
1050	NC_017168	TAA	2	6	62434	62439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137058
1051	NC_017168	A	6	6	62438	62443	100 %	0 %	0 %	0 %	384137058
1052	NC_017168	TTA	2	6	62510	62515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1053	NC_017168	CTGATC	2	12	62730	62741	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384137058
1054	NC_017168	CTG	2	6	62856	62861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137058
1055	NC_017168	GAA	2	6	62909	62914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137058
1056	NC_017168	CAATTG	2	12	62918	62929	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384137058
1057	NC_017168	AGG	2	6	63031	63036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137058
1058	NC_017168	ATT	2	6	63070	63075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1059	NC_017168	TGC	2	6	63157	63162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137058
1060	NC_017168	CACT	2	8	63189	63196	25 %	25 %	0 %	50 %	384137058
1061	NC_017168	G	7	7	63346	63352	0 %	0 %	100 %	0 %	384137058
1062	NC_017168	CTG	2	6	63354	63359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137058
1063	NC_017168	GCT	2	6	63365	63370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137058
1064	NC_017168	CGG	2	6	63375	63380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137058
1065	NC_017168	ATT	2	6	63404	63409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1066	NC_017168	AG	3	6	63588	63593	50 %	0 %	50 %	0 %	384137058
1067	NC_017168	ATT	2	6	63594	63599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1068	NC_017168	CAGA	2	8	63704	63711	50 %	0 %	25 %	25 %	384137058
1069	NC_017168	GA	4	8	63710	63717	50 %	0 %	50 %	0 %	384137058
1070	NC_017168	T	6	6	63735	63740	0 %	100 %	0 %	0 %	384137058
1071	NC_017168	TAT	2	6	63803	63808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1072	NC_017168	ATAAA	2	10	63816	63825	80 %	20 %	0 %	0 %	384137058
1073	NC_017168	T	6	6	63853	63858	0 %	100 %	0 %	0 %	384137058
1074	NC_017168	ATA	2	6	63864	63869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137058
1075	NC_017168	GTAGT	2	10	63873	63882	20 %	40 %	40 %	0 %	384137058
1076	NC_017168	CTG	2	6	63960	63965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137058
1077	NC_017168	ATA	2	6	64014	64019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137058
1078	NC_017168	CAA	2	6	64020	64025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137058
1079	NC_017168	A	6	6	64036	64041	100 %	0 %	0 %	0 %	384137058
1080	NC_017168	TGAT	2	8	64059	64066	25 %	50 %	25 %	0 %	384137058
1081	NC_017168	TTGG	2	8	64102	64109	0 %	50 %	50 %	0 %	384137058
1082	NC_017168	ATT	2	6	64162	64167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1083	NC_017168	ATG	2	6	64260	64265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137058
1084	NC_017168	TAAT	2	8	64332	64339	50 %	50 %	0 %	0 %	384137058
1085	NC_017168	A	6	6	64383	64388	100 %	0 %	0 %	0 %	384137058
1086	NC_017168	TTG	2	6	64410	64415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137058
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1088	NC_017168	TGA	2	6	64438	64443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137058
1089	NC_017168	TAAA	2	8	64455	64462	75 %	25 %	0 %	0 %	384137058
1090	NC_017168	TAG	2	6	64492	64497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137058
1091	NC_017168	GCA	2	6	64510	64515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137058
1092	NC_017168	TCT	2	6	64529	64534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137058
1093	NC_017168	CAT	2	6	64542	64547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137058
1094	NC_017168	CTC	3	9	64552	64560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137058
1095	NC_017168	G	6	6	64607	64612	0 %	0 %	100 %	0 %	384137058
1096	NC_017168	ATG	2	6	64635	64640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137058
1097	NC_017168	TAT	2	6	64646	64651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1098	NC_017168	TAA	2	6	64708	64713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137058
1099	NC_017168	GAGG	2	8	64730	64737	25 %	0 %	75 %	0 %	384137058
1100	NC_017168	ATA	2	6	64790	64795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137058
1101	NC_017168	TC	5	10	64833	64842	0 %	50 %	0 %	50 %	384137058
1102	NC_017168	TTGC	2	8	64856	64863	0 %	50 %	25 %	25 %	384137058
1103	NC_017168	ATG	2	6	64890	64895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137058
1104	NC_017168	CGC	2	6	64897	64902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137058
1105	NC_017168	GAT	2	6	64925	64930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137058
1106	NC_017168	AT	3	6	64959	64964	50 %	50 %	0 %	0 %	384137058
1107	NC_017168	GAAAT	2	10	65106	65115	60 %	20 %	20 %	0 %	384137058
1108	NC_017168	TAT	2	6	65122	65127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1109	NC_017168	TAT	2	6	65144	65149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1110	NC_017168	TGG	2	6	65161	65166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137058
1111	NC_017168	CTTTA	2	10	65184	65193	20 %	60 %	0 %	20 %	384137058
1112	NC_017168	ATC	2	6	65237	65242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137058
1113	NC_017168	ATG	2	6	65247	65252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137058
1114	NC_017168	GCG	2	6	65277	65282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137058
1115	NC_017168	TTA	2	6	65315	65320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
1116	NC_017168	TCTT	2	8	65460	65467	0 %	75 %	0 %	25 %	384137058
1117	NC_017168	ATA	2	6	65505	65510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137058
1118	NC_017168	TTAA	2	8	65519	65526	50 %	50 %	0 %	0 %	384137058
1119	NC_017168	GGTT	2	8	65562	65569	0 %	50 %	50 %	0 %	384137058
1120	NC_017168	TATAA	2	10	65576	65585	60 %	40 %	0 %	0 %	384137058
1121	NC_017168	AGC	2	6	65598	65603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137058
1122	NC_017168	CTC	2	6	65713	65718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137058
1123	NC_017168	GTTG	2	8	65719	65726	0 %	50 %	50 %	0 %	384137058
1124	NC_017168	TGA	2	6	65764	65769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137058
1125	NC_017168	TCG	2	6	65772	65777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137058
1126	NC_017168	CAG	3	9	65807	65815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137058
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1128	NC_017168	TTA	2	6	65883	65888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137058
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1251	NC_017168	ACC	2	6	72944	72949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137065
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