MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017168	GAT	2	6	30722	30727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137033
502	NC_017168	CATGG	2	10	30772	30781	20 %	20 %	40 %	20 %	384137033
503	NC_017168	ACGGT	2	10	30844	30853	20 %	20 %	40 %	20 %	384137033
504	NC_017168	GAT	2	6	30930	30935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137033
505	NC_017168	GAC	2	6	30978	30983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137033
506	NC_017168	GTT	2	6	30990	30995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137033
507	NC_017168	T	6	6	30994	30999	0 %	100 %	0 %	0 %	384137033
508	NC_017168	TTC	2	6	31079	31084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137033
509	NC_017168	GAAT	2	8	31103	31110	50 %	25 %	25 %	0 %	384137033
510	NC_017168	TGA	2	6	31130	31135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137033
511	NC_017168	ACT	2	6	31164	31169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137033
512	NC_017168	TGT	2	6	31205	31210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137033
513	NC_017168	CTGC	2	8	31233	31240	0 %	25 %	25 %	50 %	384137033
514	NC_017168	TGAA	2	8	31297	31304	50 %	25 %	25 %	0 %	384137033
515	NC_017168	GAT	2	6	31364	31369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137033
516	NC_017168	CTG	2	6	31515	31520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137033
517	NC_017168	CTG	2	6	31564	31569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137033
518	NC_017168	TGAT	2	8	31687	31694	25 %	50 %	25 %	0 %	384137033
519	NC_017168	GAT	3	9	31692	31700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137033
520	NC_017168	GCA	2	6	31764	31769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137033
521	NC_017168	AGC	2	6	31773	31778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137033
522	NC_017168	CTG	2	6	31787	31792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137033
523	NC_017168	A	6	6	31810	31815	100 %	0 %	0 %	0 %	384137033
524	NC_017168	TGA	2	6	31843	31848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137033
525	NC_017168	A	6	6	31879	31884	100 %	0 %	0 %	0 %	384137033
526	NC_017168	TGA	2	6	31933	31938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137033
527	NC_017168	GAA	2	6	31941	31946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137033
528	NC_017168	ATTA	2	8	32153	32160	50 %	50 %	0 %	0 %	384137033
529	NC_017168	AAT	2	6	32172	32177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137033
530	NC_017168	ATC	2	6	32275	32280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137033
531	NC_017168	CAT	2	6	32281	32286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137033
532	NC_017168	GAA	2	6	32292	32297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137033
533	NC_017168	TAT	2	6	32307	32312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137033
534	NC_017168	AAT	2	6	32409	32414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137033
535	NC_017168	ATA	2	6	32446	32451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137033
536	NC_017168	GTA	2	6	32599	32604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137033
537	NC_017168	ATA	2	6	32614	32619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137033
538	NC_017168	TGG	2	6	32622	32627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137033
539	NC_017168	AT	3	6	32674	32679	50 %	50 %	0 %	0 %	384137033
540	NC_017168	A	6	6	32726	32731	100 %	0 %	0 %	0 %	384137033
541	NC_017168	TAA	2	6	32794	32799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137033
542	NC_017168	TCAA	2	8	32834	32841	50 %	25 %	0 %	25 %	384137033
543	NC_017168	TTG	2	6	32860	32865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137033
544	NC_017168	TGA	2	6	32867	32872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137033
545	NC_017168	ATA	2	6	33586	33591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137034
546	NC_017168	AAGCCA	2	12	33648	33659	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384137034
547	NC_017168	ATC	2	6	33714	33719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137034
548	NC_017168	A	6	6	34005	34010	100 %	0 %	0 %	0 %	384137035
549	NC_017168	CGC	2	6	34015	34020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137035
550	NC_017168	ACCGCC	2	12	35019	35030	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384137036
551	NC_017168	ACTGA	2	10	35079	35088	40 %	20 %	20 %	20 %	384137036
552	NC_017168	T	7	7	35219	35225	0 %	100 %	0 %	0 %	384137036
553	NC_017168	CGATCA	2	12	35347	35358	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384137036
554	NC_017168	AAG	3	9	35391	35399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137036
555	NC_017168	CGG	2	6	35461	35466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137036
556	NC_017168	AGA	2	6	35642	35647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137037
557	NC_017168	ATG	2	6	35670	35675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137037
558	NC_017168	CATA	2	8	35732	35739	50 %	25 %	0 %	25 %	384137037
559	NC_017168	GCG	2	6	35755	35760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137037
560	NC_017168	CT	3	6	35804	35809	0 %	50 %	0 %	50 %	384137037
561	NC_017168	GCCA	2	8	35812	35819	25 %	0 %	25 %	50 %	384137037
562	NC_017168	A	6	6	35829	35834	100 %	0 %	0 %	0 %	384137037
563	NC_017168	TCC	2	6	35840	35845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137037
564	NC_017168	TTG	2	6	35883	35888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137037
565	NC_017168	AGT	2	6	35927	35932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137037
566	NC_017168	GCA	2	6	35970	35975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137037
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570	NC_017168	ACC	2	6	36225	36230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137037
571	NC_017168	CT	3	6	36259	36264	0 %	50 %	0 %	50 %	384137037
572	NC_017168	GT	3	6	36319	36324	0 %	50 %	50 %	0 %	384137037
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580	NC_017168	ACG	2	6	36768	36773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137037
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584	NC_017168	AGC	2	6	36914	36919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137037
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589	NC_017168	A	6	6	37113	37118	100 %	0 %	0 %	0 %	384137037
590	NC_017168	ATATA	2	10	37196	37205	60 %	40 %	0 %	0 %	384137037
591	NC_017168	CAAA	2	8	37310	37317	75 %	0 %	0 %	25 %	384137037
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593	NC_017168	AT	4	8	37399	37406	50 %	50 %	0 %	0 %	384137037
594	NC_017168	ATT	2	6	37549	37554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137037
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597	NC_017168	A	6	6	37644	37649	100 %	0 %	0 %	0 %	384137037
598	NC_017168	GAT	2	6	37665	37670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137037
599	NC_017168	T	7	7	37718	37724	0 %	100 %	0 %	0 %	384137037
600	NC_017168	GTA	2	6	37741	37746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137037
601	NC_017168	TGG	2	6	37823	37828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137037
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604	NC_017168	TATTT	2	10	37923	37932	20 %	80 %	0 %	0 %	384137038
605	NC_017168	T	6	6	37930	37935	0 %	100 %	0 %	0 %	384137038
606	NC_017168	TAT	2	6	37960	37965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137038
607	NC_017168	TGA	2	6	37980	37985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137038
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610	NC_017168	A	9	9	38031	38039	100 %	0 %	0 %	0 %	384137038
611	NC_017168	ACA	2	6	38084	38089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137038
612	NC_017168	AAC	2	6	38112	38117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137038
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614	NC_017168	AAGG	2	8	38185	38192	50 %	0 %	50 %	0 %	384137038
615	NC_017168	A	7	7	38266	38272	100 %	0 %	0 %	0 %	384137038
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620	NC_017168	TTTA	2	8	38408	38415	25 %	75 %	0 %	0 %	384137038
621	NC_017168	GCG	2	6	38426	38431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137038
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623	NC_017168	A	7	7	38530	38536	100 %	0 %	0 %	0 %	384137038
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628	NC_017168	A	6	6	38999	39004	100 %	0 %	0 %	0 %	384137039
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