MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017168	CCG	2	6	353683	353688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137320
6002	NC_017168	ATGA	2	8	353732	353739	50 %	25 %	25 %	0 %	384137320
6003	NC_017168	TGT	2	6	353794	353799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137320
6004	NC_017168	AT	3	6	353808	353813	50 %	50 %	0 %	0 %	384137320
6005	NC_017168	TGA	2	6	353839	353844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137320
6006	NC_017168	TCA	2	6	353894	353899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137320
6007	NC_017168	CGT	2	6	353979	353984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137321
6008	NC_017168	TTA	2	6	354001	354006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137321
6009	NC_017168	TCT	2	6	354085	354090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137321
6010	NC_017168	A	8	8	354105	354112	100 %	0 %	0 %	0 %	384137321
6011	NC_017168	GATT	2	8	354126	354133	25 %	50 %	25 %	0 %	384137321
6012	NC_017168	AT	3	6	354164	354169	50 %	50 %	0 %	0 %	384137321
6013	NC_017168	TAT	2	6	354199	354204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137321
6014	NC_017168	TAT	2	6	354246	354251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137321
6015	NC_017168	CAT	2	6	354255	354260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137321
6016	NC_017168	TAT	2	6	354264	354269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137321
6017	NC_017168	ATT	2	6	354302	354307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137321
6018	NC_017168	TAT	2	6	354308	354313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137321
6019	NC_017168	GCA	2	6	354355	354360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137321
6020	NC_017168	AGC	2	6	354361	354366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137321
6021	NC_017168	ATCA	2	8	354376	354383	50 %	25 %	0 %	25 %	384137321
6022	NC_017168	T	6	6	354482	354487	0 %	100 %	0 %	0 %	384137321
6023	NC_017168	ATG	2	6	354488	354493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137321
6024	NC_017168	AAT	2	6	354537	354542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137321
6025	NC_017168	AGG	2	6	354561	354566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137321
6026	NC_017168	ATA	2	6	354601	354606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137321
6027	NC_017168	A	7	7	354613	354619	100 %	0 %	0 %	0 %	384137321
6028	NC_017168	AAG	2	6	354631	354636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137321
6029	NC_017168	ATT	2	6	354673	354678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137321
6030	NC_017168	T	6	6	354702	354707	0 %	100 %	0 %	0 %	384137321
6031	NC_017168	ACG	2	6	354727	354732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137321
6032	NC_017168	TAT	2	6	354768	354773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137321
6033	NC_017168	TAT	2	6	354775	354780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137321
6034	NC_017168	ATT	2	6	354781	354786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137321
6035	NC_017168	ATTA	2	8	354807	354814	50 %	50 %	0 %	0 %	384137321
6036	NC_017168	ATT	2	6	354846	354851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137322
6037	NC_017168	TTC	2	6	354852	354857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137322
6038	NC_017168	TTA	2	6	354861	354866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137322
6039	NC_017168	AAG	2	6	354911	354916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137322
6040	NC_017168	TAA	2	6	354929	354934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137322
6041	NC_017168	AAT	2	6	354969	354974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137322
6042	NC_017168	ACTGT	2	10	354993	355002	20 %	40 %	20 %	20 %	384137322
6043	NC_017168	T	7	7	355024	355030	0 %	100 %	0 %	0 %	384137322
6044	NC_017168	TAT	2	6	355072	355077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137322
6045	NC_017168	ATCA	2	8	355116	355123	50 %	25 %	0 %	25 %	384137322
6046	NC_017168	A	6	6	355123	355128	100 %	0 %	0 %	0 %	384137322
6047	NC_017168	ACT	2	6	355130	355135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137322
6048	NC_017168	CT	3	6	355149	355154	0 %	50 %	0 %	50 %	384137322
6049	NC_017168	CACT	2	8	355198	355205	25 %	25 %	0 %	50 %	384137322
6050	NC_017168	AAT	2	6	355215	355220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137322
6051	NC_017168	CTTT	2	8	355237	355244	0 %	75 %	0 %	25 %	384137322
6052	NC_017168	CA	3	6	355307	355312	50 %	0 %	0 %	50 %	384137322
6053	NC_017168	AATA	2	8	355325	355332	75 %	25 %	0 %	0 %	384137322
6054	NC_017168	AAAT	2	8	355375	355382	75 %	25 %	0 %	0 %	384137322
6055	NC_017168	GCA	2	6	355447	355452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137322
6056	NC_017168	AAC	2	6	355492	355497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137322
6057	NC_017168	GA	3	6	355520	355525	50 %	0 %	50 %	0 %	384137322
6058	NC_017168	GCT	2	6	355532	355537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137322
6059	NC_017168	AGA	2	6	355544	355549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137322
6060	NC_017168	ATT	2	6	355586	355591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137322
6061	NC_017168	TTTA	2	8	355592	355599	25 %	75 %	0 %	0 %	384137322
6062	NC_017168	TAT	3	9	355677	355685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137323
6063	NC_017168	TGA	2	6	355694	355699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137323
6064	NC_017168	GTT	2	6	355715	355720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137323
6065	NC_017168	TTAA	2	8	355786	355793	50 %	50 %	0 %	0 %	384137323
6066	NC_017168	AAT	2	6	355798	355803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137323
6067	NC_017168	A	6	6	355839	355844	100 %	0 %	0 %	0 %	384137323
6068	NC_017168	AGA	2	6	355848	355853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137323
6069	NC_017168	AATC	2	8	355856	355863	50 %	25 %	0 %	25 %	384137323
6070	NC_017168	TTC	2	6	355908	355913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137323
6071	NC_017168	TAT	2	6	355918	355923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137323
6072	NC_017168	TATC	3	12	355952	355963	25 %	50 %	0 %	25 %	384137323
6073	NC_017168	A	6	6	355974	355979	100 %	0 %	0 %	0 %	384137323
6074	NC_017168	TTAA	2	8	355981	355988	50 %	50 %	0 %	0 %	384137323
6075	NC_017168	TTA	2	6	356029	356034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137323
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6077	NC_017168	TAT	2	6	356076	356081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137323
6078	NC_017168	GTG	2	6	356093	356098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137323
6079	NC_017168	CAG	2	6	356102	356107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137323
6080	NC_017168	ATA	2	6	356168	356173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137323
6081	NC_017168	TAC	2	6	356225	356230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137323
6082	NC_017168	AAC	2	6	356254	356259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137323
6083	NC_017168	ATT	2	6	356323	356328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137323
6084	NC_017168	ATTC	2	8	356387	356394	25 %	50 %	0 %	25 %	384137323
6085	NC_017168	ATG	2	6	356424	356429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137323
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6087	NC_017168	AGC	2	6	356585	356590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137324
6088	NC_017168	CT	3	6	356625	356630	0 %	50 %	0 %	50 %	384137324
6089	NC_017168	CAA	2	6	356634	356639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137324
6090	NC_017168	TTA	2	6	356746	356751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137324
6091	NC_017168	GAA	2	6	356763	356768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137324
6092	NC_017168	AAT	2	6	356769	356774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137324
6093	NC_017168	ATTAC	2	10	356807	356816	40 %	40 %	0 %	20 %	384137324
6094	NC_017168	ATA	2	6	356894	356899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137324
6095	NC_017168	AAT	2	6	356908	356913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137325
6096	NC_017168	GGT	2	6	356917	356922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137325
6097	NC_017168	ATT	2	6	356926	356931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137325
6098	NC_017168	TAT	2	6	356955	356960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137325
6099	NC_017168	CTG	2	6	356977	356982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137325
6100	NC_017168	TGAAT	2	10	357087	357096	40 %	40 %	20 %	0 %	384137325
6101	NC_017168	GCGT	2	8	357132	357139	0 %	25 %	50 %	25 %	384137325
6102	NC_017168	CTG	2	6	357158	357163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137325
6103	NC_017168	ACATT	2	10	357187	357196	40 %	40 %	0 %	20 %	384137325
6104	NC_017168	CCA	2	6	357211	357216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137325
6105	NC_017168	TGA	2	6	357237	357242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137325
6106	NC_017168	TGCC	2	8	357364	357371	0 %	25 %	25 %	50 %	384137325
6107	NC_017168	C	8	8	357370	357377	0 %	0 %	0 %	100 %	384137325
6108	NC_017168	ATC	2	6	357426	357431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137325
6109	NC_017168	TA	3	6	357473	357478	50 %	50 %	0 %	0 %	384137326
6110	NC_017168	A	7	7	357484	357490	100 %	0 %	0 %	0 %	384137326
6111	NC_017168	T	6	6	357523	357528	0 %	100 %	0 %	0 %	384137326
6112	NC_017168	AG	3	6	357632	357637	50 %	0 %	50 %	0 %	384137326
6113	NC_017168	CT	3	6	357643	357648	0 %	50 %	0 %	50 %	384137326
6114	NC_017168	AAT	2	6	357688	357693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137326
6115	NC_017168	TAA	2	6	357714	357719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137326
6116	NC_017168	ATT	2	6	357864	357869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137326
6117	NC_017168	CTTA	2	8	357875	357882	25 %	50 %	0 %	25 %	384137326
6118	NC_017168	AAAC	2	8	357883	357890	75 %	0 %	0 %	25 %	384137326
6119	NC_017168	GCC	2	6	357925	357930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137326
6120	NC_017168	ATC	2	6	357942	357947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137326
6121	NC_017168	TGA	2	6	358047	358052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137326
6122	NC_017168	ATC	2	6	358170	358175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137326
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6124	NC_017168	GATA	2	8	358290	358297	50 %	25 %	25 %	0 %	384137326
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6246	NC_017168	GCG	2	6	365677	365682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137332
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