MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017168	ATA	2	6	297632	297637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137259
5002	NC_017168	TTA	2	6	297642	297647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137259
5003	NC_017168	GTA	2	6	297661	297666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137259
5004	NC_017168	TA	3	6	297679	297684	50 %	50 %	0 %	0 %	384137259
5005	NC_017168	ACC	2	6	297701	297706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137259
5006	NC_017168	CAT	2	6	297723	297728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137259
5007	NC_017168	GCT	2	6	297733	297738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137259
5008	NC_017168	ATC	2	6	297797	297802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137259
5009	NC_017168	TCTT	2	8	297803	297810	0 %	75 %	0 %	25 %	384137259
5010	NC_017168	CCA	2	6	297828	297833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137259
5011	NC_017168	AATA	2	8	297839	297846	75 %	25 %	0 %	0 %	384137259
5012	NC_017168	AT	3	6	297847	297852	50 %	50 %	0 %	0 %	384137259
5013	NC_017168	GGC	2	6	297877	297882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137259
5014	NC_017168	CAT	2	6	297915	297920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137259
5015	NC_017168	CAC	2	6	297970	297975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137259
5016	NC_017168	CGC	2	6	297985	297990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137259
5017	NC_017168	GAT	2	6	297997	298002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137259
5018	NC_017168	CAT	2	6	298036	298041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137259
5019	NC_017168	CGC	2	6	298049	298054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137260
5020	NC_017168	TAT	2	6	298127	298132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137260
5021	NC_017168	AAAG	2	8	298176	298183	75 %	0 %	25 %	0 %	384137260
5022	NC_017168	T	6	6	298213	298218	0 %	100 %	0 %	0 %	384137260
5023	NC_017168	T	6	6	298278	298283	0 %	100 %	0 %	0 %	384137260
5024	NC_017168	CAG	2	6	298331	298336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137260
5025	NC_017168	ACTC	2	8	298340	298347	25 %	25 %	0 %	50 %	384137260
5026	NC_017168	TGG	2	6	298394	298399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137260
5027	NC_017168	CCG	2	6	298408	298413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137260
5028	NC_017168	T	6	6	298488	298493	0 %	100 %	0 %	0 %	384137260
5029	NC_017168	ATC	2	6	298507	298512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137260
5030	NC_017168	AAG	2	6	298529	298534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137260
5031	NC_017168	CAA	2	6	298586	298591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137260
5032	NC_017168	A	6	6	298593	298598	100 %	0 %	0 %	0 %	384137260
5033	NC_017168	T	7	7	298607	298613	0 %	100 %	0 %	0 %	384137260
5034	NC_017168	TGA	2	6	299140	299145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137261
5035	NC_017168	CGG	2	6	299203	299208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137261
5036	NC_017168	GCC	2	6	299215	299220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137261
5037	NC_017168	CAGA	2	8	299336	299343	50 %	0 %	25 %	25 %	384137261
5038	NC_017168	GTT	2	6	299349	299354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137261
5039	NC_017168	ACA	2	6	299357	299362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137261
5040	NC_017168	ATA	2	6	299401	299406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137261
5041	NC_017168	TAT	2	6	299411	299416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137261
5042	NC_017168	AAAG	2	8	299460	299467	75 %	0 %	25 %	0 %	384137261
5043	NC_017168	ACT	2	6	299481	299486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137261
5044	NC_017168	GCT	2	6	299504	299509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137261
5045	NC_017168	ATC	2	6	299511	299516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137261
5046	NC_017168	CAC	2	6	299544	299549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137261
5047	NC_017168	ATA	2	6	299596	299601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137261
5048	NC_017168	CCT	2	6	299645	299650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137261
5049	NC_017168	CCG	2	6	299746	299751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137261
5050	NC_017168	TTG	2	6	299784	299789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137261
5051	NC_017168	CTT	2	6	299837	299842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137261
5052	NC_017168	CAA	2	6	299855	299860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137261
5053	NC_017168	ATAA	2	8	299872	299879	75 %	25 %	0 %	0 %	384137261
5054	NC_017168	CAT	2	6	299883	299888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137261
5055	NC_017168	T	6	6	299947	299952	0 %	100 %	0 %	0 %	384137261
5056	NC_017168	TGT	2	6	300064	300069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137262
5057	NC_017168	AGT	2	6	300105	300110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137262
5058	NC_017168	CA	3	6	300149	300154	50 %	0 %	0 %	50 %	384137262
5059	NC_017168	ACCA	2	8	300248	300255	50 %	0 %	0 %	50 %	384137262
5060	NC_017168	GGC	3	9	300257	300265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137262
5061	NC_017168	ATG	2	6	300315	300320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137262
5062	NC_017168	CGG	2	6	300331	300336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137262
5063	NC_017168	CTC	2	6	300401	300406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137262
5064	NC_017168	ACC	2	6	300593	300598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137262
5065	NC_017168	TCA	2	6	300600	300605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137262
5066	NC_017168	ACA	4	12	300625	300636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137262
5067	NC_017168	AAT	2	6	300761	300766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137262
5068	NC_017168	CCA	2	6	300822	300827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137262
5069	NC_017168	CA	3	6	300830	300835	50 %	0 %	0 %	50 %	384137262
5070	NC_017168	A	7	7	300889	300895	100 %	0 %	0 %	0 %	384137263
5071	NC_017168	T	6	6	300904	300909	0 %	100 %	0 %	0 %	384137263
5072	NC_017168	TTA	2	6	300921	300926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137263
5073	NC_017168	ATA	2	6	300995	301000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137263
5074	NC_017168	ATC	2	6	301011	301016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137263
5075	NC_017168	AAT	3	9	301064	301072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137263
5076	NC_017168	CAA	2	6	301163	301168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137263
5077	NC_017168	CGG	2	6	301299	301304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137263
5078	NC_017168	GCG	2	6	301397	301402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137263
5079	NC_017168	TAA	2	6	301412	301417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137263
5080	NC_017168	TGC	2	6	301434	301439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137263
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5082	NC_017168	AG	3	6	301475	301480	50 %	0 %	50 %	0 %	384137263
5083	NC_017168	TCCT	2	8	301529	301536	0 %	50 %	0 %	50 %	384137263
5084	NC_017168	CGG	2	6	301540	301545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137263
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5088	NC_017168	TCA	2	6	301619	301624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137264
5089	NC_017168	ATTC	2	8	301665	301672	25 %	50 %	0 %	25 %	384137264
5090	NC_017168	GGC	2	6	301680	301685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137264
5091	NC_017168	TCA	2	6	301799	301804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137264
5092	NC_017168	TAT	2	6	301845	301850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137264
5093	NC_017168	CAA	2	6	301884	301889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137264
5094	NC_017168	TTA	2	6	301901	301906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137264
5095	NC_017168	A	7	7	301979	301985	100 %	0 %	0 %	0 %	384137264
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5100	NC_017168	ATTT	2	8	302130	302137	25 %	75 %	0 %	0 %	384137265
5101	NC_017168	TGT	2	6	302155	302160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137265
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5103	NC_017168	TGT	2	6	302215	302220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137265
5104	NC_017168	TGC	2	6	302221	302226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137265
5105	NC_017168	GCT	2	6	302298	302303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137265
5106	NC_017168	GGA	2	6	302404	302409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137265
5107	NC_017168	TGT	2	6	302428	302433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137265
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5109	NC_017168	CTAT	2	8	302632	302639	25 %	50 %	0 %	25 %	384137265
5110	NC_017168	CTAT	2	8	302650	302657	25 %	50 %	0 %	25 %	384137265
5111	NC_017168	CTAT	2	8	302758	302765	25 %	50 %	0 %	25 %	384137265
5112	NC_017168	GCT	2	6	302882	302887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137265
5113	NC_017168	GCA	2	6	302972	302977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137265
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5115	NC_017168	CGC	2	6	303063	303068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137265
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5117	NC_017168	CCG	2	6	303083	303088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137265
5118	NC_017168	GGGC	2	8	303178	303185	0 %	0 %	75 %	25 %	384137265
5119	NC_017168	TCC	2	6	303205	303210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137265
5120	NC_017168	TTG	2	6	303212	303217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137265
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5122	NC_017168	GT	3	6	303245	303250	0 %	50 %	50 %	0 %	384137265
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5244	NC_017168	TGA	2	6	310806	310811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137273
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5485	NC_017168	ACA	2	6	323367	323372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137289
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5489	NC_017168	A	6	6	323763	323768	100 %	0 %	0 %	0 %	384137289
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