MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017168	CTG	2	6	266764	266769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137238
4502	NC_017168	GAT	2	6	266799	266804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137238
4503	NC_017168	CGGT	2	8	266810	266817	0 %	25 %	50 %	25 %	384137238
4504	NC_017168	CT	3	6	266820	266825	0 %	50 %	0 %	50 %	384137238
4505	NC_017168	AATT	2	8	266858	266865	50 %	50 %	0 %	0 %	384137238
4506	NC_017168	ACC	2	6	266879	266884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137238
4507	NC_017168	TGG	2	6	266908	266913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137238
4508	NC_017168	TGG	2	6	266915	266920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137238
4509	NC_017168	GCTG	2	8	266937	266944	0 %	25 %	50 %	25 %	384137238
4510	NC_017168	GTT	2	6	267000	267005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137238
4511	NC_017168	A	8	8	267087	267094	100 %	0 %	0 %	0 %	384137238
4512	NC_017168	TGA	2	6	267102	267107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137238
4513	NC_017168	GGC	3	9	267153	267161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137238
4514	NC_017168	TGC	2	6	267177	267182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137238
4515	NC_017168	TGG	2	6	267221	267226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137238
4516	NC_017168	CTG	2	6	267253	267258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137238
4517	NC_017168	TAT	2	6	267301	267306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137238
4518	NC_017168	GTG	2	6	267310	267315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137238
4519	NC_017168	GTT	2	6	267474	267479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137238
4520	NC_017168	CT	3	6	267484	267489	0 %	50 %	0 %	50 %	384137238
4521	NC_017168	CAT	2	6	267525	267530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137238
4522	NC_017168	T	6	6	267533	267538	0 %	100 %	0 %	0 %	384137238
4523	NC_017168	TATGTT	2	12	267570	267581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384137238
4524	NC_017168	TGG	2	6	267833	267838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137238
4525	NC_017168	CGG	2	6	267863	267868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137238
4526	NC_017168	GGT	2	6	267901	267906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137238
4527	NC_017168	AAC	2	6	267950	267955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137238
4528	NC_017168	ACTG	2	8	268041	268048	25 %	25 %	25 %	25 %	384137238
4529	NC_017168	ATC	2	6	268057	268062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137238
4530	NC_017168	CGC	2	6	268065	268070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137238
4531	NC_017168	GAT	2	6	268087	268092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137238
4532	NC_017168	AAC	2	6	268100	268105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137238
4533	NC_017168	GTG	2	6	268148	268153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137238
4534	NC_017168	GGCA	2	8	268154	268161	25 %	0 %	50 %	25 %	384137238
4535	NC_017168	CAA	2	6	268261	268266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137238
4536	NC_017168	TCA	2	6	268386	268391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137238
4537	NC_017168	CAT	2	6	268564	268569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137239
4538	NC_017168	TAT	2	6	268607	268612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137239
4539	NC_017168	TGT	2	6	268626	268631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137239
4540	NC_017168	ATT	2	6	268736	268741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137239
4541	NC_017168	ACG	2	6	268789	268794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137239
4542	NC_017168	T	6	6	268807	268812	0 %	100 %	0 %	0 %	384137239
4543	NC_017168	AAT	2	6	268838	268843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137239
4544	NC_017168	GCT	2	6	268846	268851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137239
4545	NC_017168	ATT	2	6	268901	268906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137239
4546	NC_017168	AT	3	6	269008	269013	50 %	50 %	0 %	0 %	384137239
4547	NC_017168	TCG	2	6	269020	269025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137239
4548	NC_017168	AT	3	6	269047	269052	50 %	50 %	0 %	0 %	384137239
4549	NC_017168	ATG	2	6	269076	269081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137239
4550	NC_017168	ACC	3	9	269168	269176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137239
4551	NC_017168	CAA	2	6	269180	269185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137239
4552	NC_017168	TGT	2	6	269259	269264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137239
4553	NC_017168	G	6	6	269291	269296	0 %	0 %	100 %	0 %	384137239
4554	NC_017168	T	7	7	269322	269328	0 %	100 %	0 %	0 %	384137239
4555	NC_017168	TGC	2	6	269332	269337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137239
4556	NC_017168	TGTT	2	8	269500	269507	0 %	75 %	25 %	0 %	384137239
4557	NC_017168	ATC	2	6	269538	269543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137239
4558	NC_017168	CAT	2	6	269616	269621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137239
4559	NC_017168	AT	3	6	269655	269660	50 %	50 %	0 %	0 %	384137239
4560	NC_017168	AATGA	2	10	269678	269687	60 %	20 %	20 %	0 %	384137239
4561	NC_017168	AGAT	2	8	269697	269704	50 %	25 %	25 %	0 %	384137239
4562	NC_017168	A	6	6	269742	269747	100 %	0 %	0 %	0 %	384137239
4563	NC_017168	AAT	2	6	269774	269779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137239
4564	NC_017168	TGCC	2	8	269788	269795	0 %	25 %	25 %	50 %	384137239
4565	NC_017168	CGA	2	6	269802	269807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137239
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4569	NC_017168	TTA	2	6	269951	269956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137239
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4582	NC_017168	C	8	8	271145	271152	0 %	0 %	0 %	100 %	384137240
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4586	NC_017168	GC	3	6	271322	271327	0 %	0 %	50 %	50 %	384137240
4587	NC_017168	T	7	7	271413	271419	0 %	100 %	0 %	0 %	384137240
4588	NC_017168	TTA	2	6	271432	271437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137240
4589	NC_017168	ATATT	2	10	271444	271453	40 %	60 %	0 %	0 %	384137240
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4591	NC_017168	T	6	6	271921	271926	0 %	100 %	0 %	0 %	384137241
4592	NC_017168	ACC	2	6	271930	271935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137241
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4596	NC_017168	AATA	2	8	272133	272140	75 %	25 %	0 %	0 %	384137241
4597	NC_017168	CAT	2	6	272162	272167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137241
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4601	NC_017168	TGT	2	6	272253	272258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137241
4602	NC_017168	TAT	2	6	272262	272267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137241
4603	NC_017168	ATGGA	2	10	273819	273828	40 %	20 %	40 %	0 %	384137242
4604	NC_017168	TGC	2	6	273910	273915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
4605	NC_017168	TAG	2	6	273928	273933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137242
4606	NC_017168	GCT	2	6	273962	273967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
4607	NC_017168	TGG	2	6	273989	273994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137242
4608	NC_017168	TCG	2	6	274018	274023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
4609	NC_017168	TGG	2	6	274051	274056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137242
4610	NC_017168	GCT	2	6	274065	274070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
4611	NC_017168	ATC	2	6	274134	274139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137242
4612	NC_017168	TAT	2	6	274181	274186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137242
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4616	NC_017168	CAC	2	6	274291	274296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137242
4617	NC_017168	TGA	2	6	274469	274474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137242
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4620	NC_017168	ACC	2	6	274542	274547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137242
4621	NC_017168	TGGT	2	8	274560	274567	0 %	50 %	50 %	0 %	384137242
4622	NC_017168	CGT	2	6	274579	274584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
4623	NC_017168	TCA	2	6	274608	274613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137242
4624	NC_017168	GTTG	2	8	274637	274644	0 %	50 %	50 %	0 %	384137242
4625	NC_017168	AATGG	2	10	274679	274688	40 %	20 %	40 %	0 %	384137242
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4628	NC_017168	CTG	2	6	274816	274821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
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4635	NC_017168	CTG	2	6	275139	275144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
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4731	NC_017168	A	7	7	282391	282397	100 %	0 %	0 %	0 %	384137245
4732	NC_017168	A	7	7	282439	282445	100 %	0 %	0 %	0 %	384137245
4733	NC_017168	A	6	6	282462	282467	100 %	0 %	0 %	0 %	384137245
4734	NC_017168	GGC	2	6	282477	282482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137245
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4741	NC_017168	CGT	2	6	282796	282801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137246
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4851	NC_017168	A	6	6	288215	288220	100 %	0 %	0 %	0 %	384137247
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