MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pMT1

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017158	CAGGAG	2	12	408	419	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384124389
2	NC_017158	ATAGTG	2	12	3002	3013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124392
3	NC_017158	GCTGAA	2	12	5261	5272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384124392
4	NC_017158	GTGCCA	2	12	5756	5767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384124392
5	NC_017158	CGAGTT	2	12	11312	11323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384124395
6	NC_017158	AGTGAT	2	12	19589	19600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124401
7	NC_017158	GTTACG	2	12	22695	22706	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384124407
8	NC_017158	AACGGT	2	12	24271	24282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384124409
9	NC_017158	GGCTGC	2	12	27020	27031	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384124411
10	NC_017158	GACGCC	2	12	29451	29462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384124413
11	NC_017158	GGTGGC	2	12	33463	33474	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384124418
12	NC_017158	CGCGCC	2	12	40711	40722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124425
13	NC_017158	TGTGGT	2	12	42685	42696	0 %	50 %	50 %	0 %	384124426
14	NC_017158	TGGATA	2	12	46761	46772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124429
15	NC_017158	AGGGTT	2	12	49520	49531	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384124432
16	NC_017158	GCCAGT	2	12	52153	52164	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384124434
17	NC_017158	TCAGCA	2	12	52447	52458	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384124435
18	NC_017158	TGCTTG	2	12	52919	52930	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384124435
19	NC_017158	TCGCCA	2	12	52985	52996	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384124435
20	NC_017158	CAGGAG	2	12	54630	54641	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384124437
21	NC_017158	CGCCAG	2	12	58421	58432	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384124441
22	NC_017158	ACACGC	2	12	59281	59292	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384124442
23	NC_017158	CGCCAG	2	12	62821	62832	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384124443
24	NC_017158	CGTCCA	2	12	63363	63374	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384124443
25	NC_017158	TACGGT	2	12	68816	68827	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384124447
26	NC_017158	TAATTG	2	12	69160	69171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384124447
27	NC_017158	AATTCA	2	12	70032	70043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384124448
28	NC_017158	TTCTTT	2	12	72463	72474	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384124449
29	NC_017158	CATGTT	2	12	80196	80207	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384124455
30	NC_017158	CGCTTT	2	12	83586	83597	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384124459
31	NC_017158	ACCCCT	2	12	85922	85933	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384124461
32	NC_017158	GTTATT	2	12	88150	88161	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384124463
33	NC_017158	CCAGGA	2	12	92648	92659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124467
34	NC_017158	TCGGCT	2	12	94490	94501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124468

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.