MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pMT1

Total Repeats: 1418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017158	AACGG	2	10	29481	29490	40 %	0 %	40 %	20 %	384124413
502	NC_017158	GTT	3	9	29505	29513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124413
503	NC_017158	GGT	2	6	29544	29549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124414
504	NC_017158	TGG	3	9	29552	29560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124414
505	NC_017158	CAG	3	9	29594	29602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124414
506	NC_017158	ACG	2	6	29622	29627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124414
507	NC_017158	CCA	2	6	29629	29634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124414
508	NC_017158	GTC	2	6	29639	29644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124414
509	NC_017158	ATA	2	6	29657	29662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124414
510	NC_017158	TGA	3	9	29800	29808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124414
511	NC_017158	TGTC	2	8	29809	29816	0 %	50 %	25 %	25 %	384124414
512	NC_017158	TTC	2	6	30138	30143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124415
513	NC_017158	GTC	2	6	30156	30161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124415
514	NC_017158	CCA	2	6	30163	30168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124415
515	NC_017158	GCGG	2	8	30188	30195	0 %	0 %	75 %	25 %	384124415
516	NC_017158	TCG	2	6	30255	30260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124415
517	NC_017158	CAG	2	6	30383	30388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124415
518	NC_017158	TGG	2	6	30403	30408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124415
519	NC_017158	TTG	2	6	30441	30446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124415
520	NC_017158	GCA	2	6	30511	30516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124415
521	NC_017158	CAGC	2	8	30711	30718	25 %	0 %	25 %	50 %	384124416
522	NC_017158	AGA	2	6	30724	30729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124416
523	NC_017158	TCC	2	6	30782	30787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124416
524	NC_017158	GCAA	2	8	30794	30801	50 %	0 %	25 %	25 %	384124416
525	NC_017158	CAG	2	6	30825	30830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124416
526	NC_017158	CTT	2	6	30867	30872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124416
527	NC_017158	CTT	2	6	30906	30911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124416
528	NC_017158	TGC	2	6	30975	30980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
529	NC_017158	CTG	2	6	31054	31059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
530	NC_017158	CGT	2	6	31071	31076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
531	NC_017158	CTT	3	9	31122	31130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124416
532	NC_017158	GTC	2	6	31138	31143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
533	NC_017158	CCAG	2	8	31172	31179	25 %	0 %	25 %	50 %	384124416
534	NC_017158	GCC	2	6	31184	31189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124416
535	NC_017158	CGA	2	6	31193	31198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124416
536	NC_017158	ATG	2	6	31211	31216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124416
537	NC_017158	CGT	2	6	31218	31223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
538	NC_017158	GGC	2	6	31267	31272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124416
539	NC_017158	CTG	2	6	31288	31293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
540	NC_017158	T	6	6	31303	31308	0 %	100 %	0 %	0 %	384124416
541	NC_017158	GTA	2	6	31389	31394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124417
542	NC_017158	TGA	2	6	31463	31468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124417
543	NC_017158	CTCG	2	8	31547	31554	0 %	25 %	25 %	50 %	384124417
544	NC_017158	GCC	2	6	31651	31656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124417
545	NC_017158	TCG	2	6	31660	31665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124417
546	NC_017158	TTC	2	6	31713	31718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124417
547	NC_017158	CGA	2	6	31769	31774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124417
548	NC_017158	CCA	2	6	31790	31795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124417
549	NC_017158	A	6	6	31926	31931	100 %	0 %	0 %	0 %	384124417
550	NC_017158	TGA	2	6	32187	32192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124418
551	NC_017158	GAT	3	9	32472	32480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124418
552	NC_017158	GCT	2	6	32530	32535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124418
553	NC_017158	AATC	2	8	32609	32616	50 %	25 %	0 %	25 %	384124418
554	NC_017158	CG	3	6	32623	32628	0 %	0 %	50 %	50 %	384124418
555	NC_017158	GCC	2	6	32748	32753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124418
556	NC_017158	A	6	6	32773	32778	100 %	0 %	0 %	0 %	384124418
557	NC_017158	ACC	2	6	32783	32788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124418
558	NC_017158	CTG	2	6	32833	32838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124418
559	NC_017158	ATC	2	6	32859	32864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124418
560	NC_017158	ATG	2	6	33295	33300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124418
561	NC_017158	CAG	2	6	33369	33374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124418
562	NC_017158	GGC	2	6	33378	33383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124418
563	NC_017158	GGTGGC	2	12	33463	33474	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384124418
564	NC_017158	TTA	2	6	33548	33553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124418
565	NC_017158	AATA	2	8	33574	33581	75 %	25 %	0 %	0 %	384124418
566	NC_017158	ACG	2	6	33622	33627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124418
567	NC_017158	AG	3	6	33688	33693	50 %	0 %	50 %	0 %	384124418
568	NC_017158	TGG	2	6	34179	34184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124419
569	NC_017158	CATC	2	8	34224	34231	25 %	25 %	0 %	50 %	384124419
570	NC_017158	GA	3	6	34242	34247	50 %	0 %	50 %	0 %	384124419
571	NC_017158	TTG	2	6	34308	34313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124419
572	NC_017158	A	6	6	35335	35340	100 %	0 %	0 %	0 %	384124420
573	NC_017158	ATC	2	6	35344	35349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124420
574	NC_017158	GCT	2	6	35353	35358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124420
575	NC_017158	CAA	2	6	35391	35396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124420
576	NC_017158	CAA	2	6	35496	35501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124420
577	NC_017158	ATG	2	6	35519	35524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124420
578	NC_017158	TAC	2	6	35545	35550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124420
579	NC_017158	AGCA	2	8	35559	35566	50 %	0 %	25 %	25 %	384124420
580	NC_017158	ATG	2	6	35723	35728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124420
581	NC_017158	TGA	2	6	35765	35770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124420
582	NC_017158	A	6	6	35779	35784	100 %	0 %	0 %	0 %	384124420
583	NC_017158	AAATT	2	10	35792	35801	60 %	40 %	0 %	0 %	384124420
584	NC_017158	CCAA	2	8	35822	35829	50 %	0 %	0 %	50 %	384124420
585	NC_017158	AATC	2	8	35832	35839	50 %	25 %	0 %	25 %	384124420
586	NC_017158	GCT	2	6	35884	35889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124420
587	NC_017158	GCA	2	6	35901	35906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124420
588	NC_017158	TAAT	2	8	35962	35969	50 %	50 %	0 %	0 %	384124420
589	NC_017158	GCCA	2	8	36920	36927	25 %	0 %	25 %	50 %	384124421
590	NC_017158	GTT	2	6	37034	37039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124421
591	NC_017158	TCCCC	2	10	37051	37060	0 %	20 %	0 %	80 %	384124421
592	NC_017158	CTG	2	6	37262	37267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124421
593	NC_017158	TTAC	2	8	38083	38090	25 %	50 %	0 %	25 %	384124422
594	NC_017158	CA	3	6	38365	38370	50 %	0 %	0 %	50 %	384124422
595	NC_017158	TTGC	2	8	38873	38880	0 %	50 %	25 %	25 %	384124423
596	NC_017158	GCT	2	6	38902	38907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124423
597	NC_017158	CTTC	2	8	38932	38939	0 %	50 %	0 %	50 %	384124423
598	NC_017158	CACG	2	8	39008	39015	25 %	0 %	25 %	50 %	384124423
599	NC_017158	GACTG	2	10	39055	39064	20 %	20 %	40 %	20 %	384124423
600	NC_017158	GCG	2	6	39143	39148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124423
601	NC_017158	TCG	2	6	39153	39158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124423
602	NC_017158	TCT	2	6	39175	39180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124423
603	NC_017158	CCA	2	6	39186	39191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124423
604	NC_017158	CCA	2	6	39202	39207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124423
605	NC_017158	T	6	6	39319	39324	0 %	100 %	0 %	0 %	384124423
606	NC_017158	TCT	2	6	39379	39384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124424
607	NC_017158	GGC	2	6	39399	39404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124424
608	NC_017158	AAC	2	6	39419	39424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124424
609	NC_017158	GCA	2	6	39453	39458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124424
610	NC_017158	ATCA	2	8	39467	39474	50 %	25 %	0 %	25 %	384124424
611	NC_017158	ATG	2	6	39498	39503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124424
612	NC_017158	GAA	2	6	39553	39558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124424
613	NC_017158	CTC	2	6	39584	39589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124424
614	NC_017158	AGC	2	6	39659	39664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124424
615	NC_017158	GCGT	2	8	39689	39696	0 %	25 %	50 %	25 %	384124424
616	NC_017158	CATTG	2	10	39743	39752	20 %	40 %	20 %	20 %	384124424
617	NC_017158	ACA	2	6	39916	39921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124424
618	NC_017158	GTC	2	6	39944	39949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124424
619	NC_017158	GCT	2	6	39987	39992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124424
620	NC_017158	TGG	2	6	40002	40007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124424
621	NC_017158	TGCG	2	8	40053	40060	0 %	25 %	50 %	25 %	384124424
622	NC_017158	GAT	2	6	40146	40151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124425
623	NC_017158	CGT	2	6	40226	40231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124425
624	NC_017158	AG	3	6	40300	40305	50 %	0 %	50 %	0 %	384124425
625	NC_017158	CAC	2	6	40331	40336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124425
626	NC_017158	TTC	2	6	40411	40416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124425
627	NC_017158	TG	3	6	40520	40525	0 %	50 %	50 %	0 %	384124425
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748	NC_017158	TCT	2	6	50447	50452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124433
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754	NC_017158	CTG	2	6	51125	51130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124434
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993	NC_017158	ACC	2	6	64933	64938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124444
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997	NC_017158	CTT	2	6	65127	65132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124444
998	NC_017158	GTC	3	9	65143	65151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124444
999	NC_017158	TCG	2	6	65195	65200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124444
1000	NC_017158	GAT	2	6	65255	65260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124444

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