MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017157	TCA	2	6	33143	33148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124354
502	NC_017157	CTT	2	6	33161	33166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124354
503	NC_017157	TGT	2	6	33215	33220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124354
504	NC_017157	ATG	2	6	33241	33246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124354
505	NC_017157	ACCC	2	8	33341	33348	25 %	0 %	0 %	75 %	384124355
506	NC_017157	GAA	2	6	33350	33355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124355
507	NC_017157	GC	3	6	33366	33371	0 %	0 %	50 %	50 %	384124355
508	NC_017157	TCG	2	6	33421	33426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124355
509	NC_017157	ACT	2	6	33457	33462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124355
510	NC_017157	GCAGA	2	10	33498	33507	40 %	0 %	40 %	20 %	384124355
511	NC_017157	T	7	7	33564	33570	0 %	100 %	0 %	0 %	384124355
512	NC_017157	GGC	2	6	33596	33601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124355
513	NC_017157	TGT	2	6	33623	33628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124355
514	NC_017157	GTG	2	6	33649	33654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124355
515	NC_017157	A	7	7	33675	33681	100 %	0 %	0 %	0 %	384124355
516	NC_017157	GTT	2	6	33756	33761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124355
517	NC_017157	AT	3	6	33944	33949	50 %	50 %	0 %	0 %	384124355
518	NC_017157	CGT	2	6	34029	34034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124355
519	NC_017157	TCA	2	6	34040	34045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124355
520	NC_017157	TCA	2	6	34086	34091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124355
521	NC_017157	GTG	2	6	34092	34097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124355
522	NC_017157	AGA	3	9	34214	34222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124355
523	NC_017157	TCG	2	6	34279	34284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124355
524	NC_017157	ACA	2	6	34361	34366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124355
525	NC_017157	TAT	2	6	34966	34971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124356
526	NC_017157	TCA	2	6	34977	34982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124356
527	NC_017157	TTTCT	2	10	34983	34992	0 %	80 %	0 %	20 %	384124356
528	NC_017157	C	7	7	35010	35016	0 %	0 %	0 %	100 %	384124356
529	NC_017157	CA	3	6	35076	35081	50 %	0 %	0 %	50 %	384124356
530	NC_017157	ACCT	2	8	35154	35161	25 %	25 %	0 %	50 %	384124356
531	NC_017157	CT	3	6	35228	35233	0 %	50 %	0 %	50 %	384124356
532	NC_017157	GAG	2	6	35244	35249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384124356
533	NC_017157	ATT	2	6	35492	35497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124357
534	NC_017157	GTT	2	6	35528	35533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124357
535	NC_017157	TA	3	6	35553	35558	50 %	50 %	0 %	0 %	384124357
536	NC_017157	AGC	2	6	35588	35593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124357
537	NC_017157	CGT	2	6	35636	35641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124357
538	NC_017157	T	6	6	35710	35715	0 %	100 %	0 %	0 %	384124357
539	NC_017157	T	6	6	35722	35727	0 %	100 %	0 %	0 %	384124357
540	NC_017157	TTGC	2	8	35906	35913	0 %	50 %	25 %	25 %	384124357
541	NC_017157	TC	3	6	35938	35943	0 %	50 %	0 %	50 %	384124357
542	NC_017157	AGA	2	6	35971	35976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124357
543	NC_017157	GGA	2	6	35995	36000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384124357
544	NC_017157	CAC	2	6	36099	36104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124357
545	NC_017157	AGCG	2	8	36116	36123	25 %	0 %	50 %	25 %	384124357
546	NC_017157	CTT	2	6	36149	36154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124357
547	NC_017157	TTG	2	6	36171	36176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124357
548	NC_017157	AGTC	2	8	36203	36210	25 %	25 %	25 %	25 %	384124357
549	NC_017157	CCAAG	2	10	36251	36260	40 %	0 %	20 %	40 %	384124357
550	NC_017157	AAT	2	6	36691	36696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124358
551	NC_017157	A	6	6	36709	36714	100 %	0 %	0 %	0 %	384124358
552	NC_017157	GAA	2	6	36732	36737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124358
553	NC_017157	TTG	2	6	36744	36749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124358
554	NC_017157	TAACGT	2	12	36868	36879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384124358
555	NC_017157	CAA	2	6	36902	36907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124358
556	NC_017157	GAT	2	6	36950	36955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124358
557	NC_017157	AAG	2	6	37017	37022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124358
558	NC_017157	TAA	2	6	37023	37028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124358
559	NC_017157	AAC	2	6	37032	37037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124358
560	NC_017157	T	6	6	37134	37139	0 %	100 %	0 %	0 %	384124359
561	NC_017157	GTTACT	2	12	37161	37172	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384124359
562	NC_017157	TTATGT	2	12	37218	37229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384124359
563	NC_017157	TTA	2	6	37255	37260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124359
564	NC_017157	ATG	2	6	37280	37285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124359
565	NC_017157	GTA	2	6	37294	37299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124359
566	NC_017157	TTTGG	2	10	37386	37395	0 %	60 %	40 %	0 %	384124359
567	NC_017157	ATG	2	6	37400	37405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124359
568	NC_017157	CGTCT	2	10	37442	37451	0 %	40 %	20 %	40 %	384124359
569	NC_017157	TGGC	2	8	37527	37534	0 %	25 %	50 %	25 %	384124359
570	NC_017157	TCC	2	6	37572	37577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124359
571	NC_017157	AAC	2	6	37619	37624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124359
572	NC_017157	A	6	6	37643	37648	100 %	0 %	0 %	0 %	384124359
573	NC_017157	AGCG	2	8	37692	37699	25 %	0 %	50 %	25 %	384124359
574	NC_017157	TGA	2	6	37719	37724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124359
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576	NC_017157	CAA	2	6	37786	37791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124359
577	NC_017157	ATA	2	6	37879	37884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124359
578	NC_017157	CAA	2	6	38043	38048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124359
579	NC_017157	TCA	2	6	38049	38054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124359
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581	NC_017157	AAC	2	6	38067	38072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124359
582	NC_017157	TGAT	2	8	38117	38124	25 %	50 %	25 %	0 %	384124359
583	NC_017157	GTT	2	6	38188	38193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124359
584	NC_017157	TGAT	2	8	38234	38241	25 %	50 %	25 %	0 %	384124359
585	NC_017157	AAG	2	6	38276	38281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124359
586	NC_017157	CTGAA	2	10	38285	38294	40 %	20 %	20 %	20 %	384124359
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590	NC_017157	GGT	2	6	38494	38499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124359
591	NC_017157	CCG	2	6	38577	38582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124359
592	NC_017157	GTACG	2	10	38603	38612	20 %	20 %	40 %	20 %	384124359
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595	NC_017157	CAT	2	6	38656	38661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124359
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597	NC_017157	TTA	2	6	38746	38751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124359
598	NC_017157	AAG	2	6	38786	38791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124359
599	NC_017157	ATC	2	6	38820	38825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124359
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601	NC_017157	GTG	2	6	38971	38976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124360
602	NC_017157	TTCT	2	8	39040	39047	0 %	75 %	0 %	25 %	384124360
603	NC_017157	GAA	2	6	39090	39095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124360
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607	NC_017157	CG	3	6	39168	39173	0 %	0 %	50 %	50 %	384124360
608	NC_017157	T	6	6	39194	39199	0 %	100 %	0 %	0 %	384124360
609	NC_017157	TTG	2	6	39327	39332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124361
610	NC_017157	T	6	6	39341	39346	0 %	100 %	0 %	0 %	384124361
611	NC_017157	GCT	2	6	39350	39355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124361
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615	NC_017157	A	6	6	39465	39470	100 %	0 %	0 %	0 %	384124361
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617	NC_017157	CATTC	2	10	39554	39563	20 %	40 %	0 %	40 %	384124361
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620	NC_017157	A	6	6	39712	39717	100 %	0 %	0 %	0 %	384124361
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624	NC_017157	ATG	2	6	39889	39894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124361
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