MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 plasmid pMT1

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017155	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	384124223
2	NC_017155	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	384124223
3	NC_017155	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	384124223
4	NC_017155	GA	3	6	2327	2332	50 %	0 %	50 %	0 %	384124225
5	NC_017155	AT	3	6	2557	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	384124225
6	NC_017155	TG	3	6	3012	3017	0 %	50 %	50 %	0 %	384124226
7	NC_017155	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	384124226
8	NC_017155	AC	3	6	3534	3539	50 %	0 %	0 %	50 %	384124226
9	NC_017155	AC	3	6	3570	3575	50 %	0 %	0 %	50 %	384124226
10	NC_017155	AT	3	6	3693	3698	50 %	50 %	0 %	0 %	384124226
11	NC_017155	GC	3	6	5333	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	384124226
12	NC_017155	CA	3	6	5960	5965	50 %	0 %	0 %	50 %	384124227
13	NC_017155	TC	3	6	6684	6689	0 %	50 %	0 %	50 %	384124228
14	NC_017155	AT	3	6	6695	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	384124228
15	NC_017155	CG	3	6	7422	7427	0 %	0 %	50 %	50 %	384124228
16	NC_017155	CT	3	6	8538	8543	0 %	50 %	0 %	50 %	384124228
17	NC_017155	CG	3	6	8726	8731	0 %	0 %	50 %	50 %	384124228
18	NC_017155	AG	3	6	8922	8927	50 %	0 %	50 %	0 %	384124228
19	NC_017155	TG	3	6	10328	10333	0 %	50 %	50 %	0 %	384124228
20	NC_017155	GT	3	6	11822	11827	0 %	50 %	50 %	0 %	384124230
21	NC_017155	AC	3	6	13102	13107	50 %	0 %	0 %	50 %	384124231
22	NC_017155	CG	3	6	13474	13479	0 %	0 %	50 %	50 %	384124232
23	NC_017155	GA	3	6	15222	15227	50 %	0 %	50 %	0 %	384124233
24	NC_017155	AG	3	6	15472	15477	50 %	0 %	50 %	0 %	384124233
25	NC_017155	GA	3	6	16905	16910	50 %	0 %	50 %	0 %	384124233
26	NC_017155	AC	3	6	17588	17593	50 %	0 %	0 %	50 %	384124233
27	NC_017155	CA	3	6	19176	19181	50 %	0 %	0 %	50 %	384124235
28	NC_017155	GA	3	6	19264	19269	50 %	0 %	50 %	0 %	384124235
29	NC_017155	CT	3	6	20314	20319	0 %	50 %	0 %	50 %	384124237
30	NC_017155	AG	3	6	23243	23248	50 %	0 %	50 %	0 %	384124242
31	NC_017155	AT	3	6	25014	25019	50 %	50 %	0 %	0 %	384124244
32	NC_017155	AG	3	6	25265	25270	50 %	0 %	50 %	0 %	384124244
33	NC_017155	CG	4	8	25977	25984	0 %	0 %	50 %	50 %	384124244
34	NC_017155	GC	4	8	26072	26079	0 %	0 %	50 %	50 %	384124244
35	NC_017155	AT	3	6	26847	26852	50 %	50 %	0 %	0 %	384124245
36	NC_017155	CA	3	6	26955	26960	50 %	0 %	0 %	50 %	384124245
37	NC_017155	CG	3	6	27670	27675	0 %	0 %	50 %	50 %	384124245
38	NC_017155	CA	3	6	27723	27728	50 %	0 %	0 %	50 %	384124245
39	NC_017155	GT	3	6	28367	28372	0 %	50 %	50 %	0 %	384124246
40	NC_017155	CG	3	6	32624	32629	0 %	0 %	50 %	50 %	384124251
41	NC_017155	AG	3	6	33689	33694	50 %	0 %	50 %	0 %	384124251
42	NC_017155	GA	3	6	34243	34248	50 %	0 %	50 %	0 %	384124252
43	NC_017155	CG	3	6	34514	34519	0 %	0 %	50 %	50 %	384124253
44	NC_017155	TC	3	6	34561	34566	0 %	50 %	0 %	50 %	384124253
45	NC_017155	CA	3	6	38367	38372	50 %	0 %	0 %	50 %	384124256
46	NC_017155	AG	3	6	40302	40307	50 %	0 %	50 %	0 %	384124259
47	NC_017155	TG	3	6	40522	40527	0 %	50 %	50 %	0 %	384124259
48	NC_017155	GT	3	6	41620	41625	0 %	50 %	50 %	0 %	384124259
49	NC_017155	AG	3	6	42964	42969	50 %	0 %	50 %	0 %	384124260
50	NC_017155	AC	3	6	43916	43921	50 %	0 %	0 %	50 %	384124261
51	NC_017155	TG	3	6	48610	48615	0 %	50 %	50 %	0 %	384124264
52	NC_017155	GT	3	6	49371	49376	0 %	50 %	50 %	0 %	384124265
53	NC_017155	CG	4	8	51785	51792	0 %	0 %	50 %	50 %	384124268
54	NC_017155	AG	3	6	51897	51902	50 %	0 %	50 %	0 %	384124268
55	NC_017155	CG	3	6	53031	53036	0 %	0 %	50 %	50 %	384124269
56	NC_017155	GA	3	6	53204	53209	50 %	0 %	50 %	0 %	384124269
57	NC_017155	GT	4	8	53820	53827	0 %	50 %	50 %	0 %	384124270
58	NC_017155	CA	3	6	54390	54395	50 %	0 %	0 %	50 %	384124270
59	NC_017155	GA	3	6	54857	54862	50 %	0 %	50 %	0 %	384124271
60	NC_017155	TA	3	6	55223	55228	50 %	50 %	0 %	0 %	384124271
61	NC_017155	CT	3	6	55769	55774	0 %	50 %	0 %	50 %	384124272
62	NC_017155	CA	3	6	56177	56182	50 %	0 %	0 %	50 %	384124272
63	NC_017155	CG	3	6	58025	58030	0 %	0 %	50 %	50 %	384124274
64	NC_017155	CT	3	6	58539	58544	0 %	50 %	0 %	50 %	384124274
65	NC_017155	GT	3	6	59314	59319	0 %	50 %	50 %	0 %	384124274
66	NC_017155	TC	3	6	60050	60055	0 %	50 %	0 %	50 %	384124274
67	NC_017155	TC	3	6	60219	60224	0 %	50 %	0 %	50 %	384124274
68	NC_017155	AC	3	6	60958	60963	50 %	0 %	0 %	50 %	384124275
69	NC_017155	GT	3	6	61306	61311	0 %	50 %	50 %	0 %	384124275
70	NC_017155	GA	3	6	61516	61521	50 %	0 %	50 %	0 %	384124275
71	NC_017155	TG	3	6	63786	63791	0 %	50 %	50 %	0 %	384124276
72	NC_017155	CT	3	6	63892	63897	0 %	50 %	0 %	50 %	384124276
73	NC_017155	TC	3	6	64894	64899	0 %	50 %	0 %	50 %	384124277
74	NC_017155	CG	3	6	65808	65813	0 %	0 %	50 %	50 %	384124278
75	NC_017155	GA	3	6	67161	67166	50 %	0 %	50 %	0 %	384124279
76	NC_017155	AT	3	6	67520	67525	50 %	50 %	0 %	0 %	384124279
77	NC_017155	TC	3	6	67699	67704	0 %	50 %	0 %	50 %	384124280
78	NC_017155	TC	3	6	67988	67993	0 %	50 %	0 %	50 %	384124280
79	NC_017155	AC	3	6	68333	68338	50 %	0 %	0 %	50 %	384124280
80	NC_017155	GT	3	6	69104	69109	0 %	50 %	50 %	0 %	384124280
81	NC_017155	CT	3	6	69991	69996	0 %	50 %	0 %	50 %	384124280
82	NC_017155	AT	3	6	70508	70513	50 %	50 %	0 %	0 %	384124281
83	NC_017155	CT	3	6	70558	70563	0 %	50 %	0 %	50 %	384124281
84	NC_017155	AT	3	6	71267	71272	50 %	50 %	0 %	0 %	384124282
85	NC_017155	AT	3	6	71390	71395	50 %	50 %	0 %	0 %	384124282
86	NC_017155	AG	3	6	71633	71638	50 %	0 %	50 %	0 %	384124282
87	NC_017155	CA	3	6	72785	72790	50 %	0 %	0 %	50 %	384124283
88	NC_017155	TC	3	6	76773	76778	0 %	50 %	0 %	50 %	384124286
89	NC_017155	TG	3	6	78458	78463	0 %	50 %	50 %	0 %	384124287
90	NC_017155	TA	3	6	78953	78958	50 %	50 %	0 %	0 %	384124287
91	NC_017155	GA	3	6	79506	79511	50 %	0 %	50 %	0 %	384124288
92	NC_017155	AG	3	6	80951	80956	50 %	0 %	50 %	0 %	384124289
93	NC_017155	AT	3	6	83275	83280	50 %	50 %	0 %	0 %	384124291
94	NC_017155	AT	4	8	83583	83590	50 %	50 %	0 %	0 %	384124291
95	NC_017155	AT	3	6	84490	84495	50 %	50 %	0 %	0 %	384124291
96	NC_017155	CG	3	6	84719	84724	0 %	0 %	50 %	50 %	384124292
97	NC_017155	TC	4	8	85023	85030	0 %	50 %	0 %	50 %	384124292
98	NC_017155	GA	3	6	85323	85328	50 %	0 %	50 %	0 %	384124292
99	NC_017155	CA	3	6	86065	86070	50 %	0 %	0 %	50 %	384124293
100	NC_017155	CA	3	6	88600	88605	50 %	0 %	0 %	50 %	384124294
101	NC_017155	GC	3	6	88747	88752	0 %	0 %	50 %	50 %	384124294
102	NC_017155	GC	3	6	89545	89550	0 %	0 %	50 %	50 %	384124296
103	NC_017155	GC	3	6	89917	89922	0 %	0 %	50 %	50 %	384124296
104	NC_017155	CG	3	6	89945	89950	0 %	0 %	50 %	50 %	384124296
105	NC_017155	GC	3	6	92604	92609	0 %	0 %	50 %	50 %	384124298

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.