MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_017154	ATG	2	6	166468	166473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120726
2503	NC_017154	CAA	2	6	166558	166563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120726
2504	NC_017154	GCG	2	6	166579	166584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120726
2505	NC_017154	TAA	2	6	166626	166631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120726
2506	NC_017154	AGCC	2	8	166633	166640	25 %	0 %	25 %	50 %	384120726
2507	NC_017154	ATG	2	6	166670	166675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120726
2508	NC_017154	GTG	2	6	166679	166684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120726
2509	NC_017154	CGCCAA	2	12	166730	166741	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384120726
2510	NC_017154	CT	3	6	166816	166821	0 %	50 %	0 %	50 %	384120726
2511	NC_017154	CGG	2	6	166889	166894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120726
2512	NC_017154	CGG	2	6	166985	166990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120726
2513	NC_017154	TCC	2	6	167022	167027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384120726
2514	NC_017154	AGT	2	6	167062	167067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120726
2515	NC_017154	AGC	2	6	167113	167118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120726
2516	NC_017154	AGC	2	6	167153	167158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120726
2517	NC_017154	AGTG	2	8	167220	167227	25 %	25 %	50 %	0 %	384120726
2518	NC_017154	CCT	2	6	167237	167242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384120726
2519	NC_017154	A	6	6	167253	167258	100 %	0 %	0 %	0 %	384120726
2520	NC_017154	ACA	2	6	167316	167321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120726
2521	NC_017154	A	6	6	167338	167343	100 %	0 %	0 %	0 %	384120726
2522	NC_017154	CAA	2	6	167594	167599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120727
2523	NC_017154	TCA	2	6	167605	167610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120727
2524	NC_017154	GAT	2	6	167640	167645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120727
2525	NC_017154	GTG	2	6	167812	167817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120727
2526	NC_017154	A	6	6	167844	167849	100 %	0 %	0 %	0 %	384120727
2527	NC_017154	TTTG	2	8	167907	167914	0 %	75 %	25 %	0 %	384120727
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2529	NC_017154	ATC	2	6	168142	168147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120727
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2531	NC_017154	GTC	2	6	168165	168170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120727
2532	NC_017154	GC	3	6	168174	168179	0 %	0 %	50 %	50 %	384120727
2533	NC_017154	CGC	2	6	168625	168630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120728
2534	NC_017154	AG	3	6	168868	168873	50 %	0 %	50 %	0 %	384120728
2535	NC_017154	GGT	2	6	168983	168988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120728
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2537	NC_017154	CGG	2	6	169078	169083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120728
2538	NC_017154	GCA	2	6	169115	169120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120728
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2540	NC_017154	TCAA	2	8	169155	169162	50 %	25 %	0 %	25 %	384120728
2541	NC_017154	TGC	2	6	169171	169176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120728
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2544	NC_017154	GC	3	6	169279	169284	0 %	0 %	50 %	50 %	384120729
2545	NC_017154	TGCC	2	8	169330	169337	0 %	25 %	25 %	50 %	384120729
2546	NC_017154	GC	3	6	169394	169399	0 %	0 %	50 %	50 %	384120729
2547	NC_017154	TAT	2	6	169467	169472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120729
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2550	NC_017154	GAT	2	6	169647	169652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120729
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2552	NC_017154	TATT	2	8	169686	169693	25 %	75 %	0 %	0 %	384120729
2553	NC_017154	GGC	2	6	169769	169774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120729
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2557	NC_017154	TTG	2	6	170075	170080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120730
2558	NC_017154	TGCA	2	8	170084	170091	25 %	25 %	25 %	25 %	384120730
2559	NC_017154	GAA	2	6	170175	170180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120730
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2561	NC_017154	GGC	2	6	170349	170354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120730
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2563	NC_017154	AGC	2	6	170405	170410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120730
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2570	NC_017154	GAGC	2	8	170808	170815	25 %	0 %	50 %	25 %	384120730
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2601	NC_017154	CAG	2	6	172475	172480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120731
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2603	NC_017154	AGT	2	6	172516	172521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120731
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2605	NC_017154	TG	3	6	172627	172632	0 %	50 %	50 %	0 %	384120732
2606	NC_017154	GCAA	2	8	172803	172810	50 %	0 %	25 %	25 %	384120732
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2609	NC_017154	CCAG	2	8	172930	172937	25 %	0 %	25 %	50 %	384120732
2610	NC_017154	GT	3	6	173001	173006	0 %	50 %	50 %	0 %	384120732
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2617	NC_017154	ATCTTC	2	12	173682	173693	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384120733
2618	NC_017154	CAAA	2	8	173694	173701	75 %	0 %	0 %	25 %	384120733
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2622	NC_017154	GGGC	2	8	173994	174001	0 %	0 %	75 %	25 %	384120734
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2742	NC_017154	TTTA	2	8	182246	182253	25 %	75 %	0 %	0 %	384120738
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2744	NC_017154	ATCA	2	8	182495	182502	50 %	25 %	0 %	25 %	384120738
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2988	NC_017154	GTG	2	6	197877	197882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120751
2989	NC_017154	GTGA	2	8	197915	197922	25 %	25 %	50 %	0 %	384120751
2990	NC_017154	CGGTA	2	10	197935	197944	20 %	20 %	40 %	20 %	384120751
2991	NC_017154	G	6	6	197973	197978	0 %	0 %	100 %	0 %	384120751
2992	NC_017154	GTT	2	6	198035	198040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120751
2993	NC_017154	GCA	2	6	198065	198070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120751
2994	NC_017154	AAC	2	6	198086	198091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120751
2995	NC_017154	CT	3	6	198131	198136	0 %	50 %	0 %	50 %	384120751
2996	NC_017154	GTG	2	6	198144	198149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120751
2997	NC_017154	TACT	2	8	198187	198194	25 %	50 %	0 %	25 %	384120751
2998	NC_017154	GCAAG	2	10	198274	198283	40 %	0 %	40 %	20 %	384120751
2999	NC_017154	CAT	2	6	198387	198392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120752
3000	NC_017154	GTTG	2	8	198474	198481	0 %	50 %	50 %	0 %	384120752

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