MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017154	CCAG	2	8	101769	101776	25 %	0 %	25 %	50 %	384120676
1502	NC_017154	GC	3	6	101813	101818	0 %	0 %	50 %	50 %	384120676
1503	NC_017154	ACC	2	6	101882	101887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120676
1504	NC_017154	CTT	2	6	101922	101927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120676
1505	NC_017154	T	6	6	101926	101931	0 %	100 %	0 %	0 %	384120676
1506	NC_017154	CGG	2	6	101957	101962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120676
1507	NC_017154	TCA	2	6	102059	102064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120676
1508	NC_017154	CAGC	2	8	102146	102153	25 %	0 %	25 %	50 %	384120676
1509	NC_017154	TAC	2	6	102217	102222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120676
1510	NC_017154	T	8	8	102265	102272	0 %	100 %	0 %	0 %	384120676
1511	NC_017154	AGT	2	6	102274	102279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120676
1512	NC_017154	ATA	2	6	102293	102298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120676
1513	NC_017154	TTC	2	6	102504	102509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120677
1514	NC_017154	AC	3	6	102522	102527	50 %	0 %	0 %	50 %	384120677
1515	NC_017154	GGC	2	6	102542	102547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120677
1516	NC_017154	CAA	2	6	102576	102581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120677
1517	NC_017154	CGA	2	6	102587	102592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120677
1518	NC_017154	CCA	2	6	102634	102639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120677
1519	NC_017154	G	6	6	102773	102778	0 %	0 %	100 %	0 %	384120677
1520	NC_017154	CAT	2	6	102806	102811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120677
1521	NC_017154	CAGT	2	8	102812	102819	25 %	25 %	25 %	25 %	384120677
1522	NC_017154	AGA	2	6	102908	102913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120677
1523	NC_017154	TGC	2	6	102938	102943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120677
1524	NC_017154	CGA	2	6	102974	102979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120677
1525	NC_017154	CGC	2	6	103008	103013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120677
1526	NC_017154	GC	3	6	103118	103123	0 %	0 %	50 %	50 %	384120677
1527	NC_017154	AAAT	2	8	103141	103148	75 %	25 %	0 %	0 %	384120677
1528	NC_017154	AGC	2	6	103221	103226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120677
1529	NC_017154	A	6	6	103242	103247	100 %	0 %	0 %	0 %	384120677
1530	NC_017154	ATA	2	6	103318	103323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120677
1531	NC_017154	TTAC	2	8	104394	104401	25 %	50 %	0 %	25 %	384120678
1532	NC_017154	CA	3	6	104676	104681	50 %	0 %	0 %	50 %	384120678
1533	NC_017154	TTG	2	6	104873	104878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120678
1534	NC_017154	GTTTT	2	10	105246	105255	0 %	80 %	20 %	0 %	384120679
1535	NC_017154	TAA	2	6	105263	105268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120679
1536	NC_017154	ATT	2	6	105342	105347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120679
1537	NC_017154	TTG	2	6	105380	105385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120679
1538	NC_017154	CAAT	2	8	105431	105438	50 %	25 %	0 %	25 %	384120679
1539	NC_017154	GCCC	2	8	105452	105459	0 %	0 %	25 %	75 %	384120679
1540	NC_017154	GCT	2	6	105560	105565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120679
1541	NC_017154	TTG	2	6	105571	105576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120679
1542	NC_017154	TGT	2	6	105593	105598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120679
1543	NC_017154	GCAAT	2	10	105643	105652	40 %	20 %	20 %	20 %	384120679
1544	NC_017154	ATT	2	6	105660	105665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120679
1545	NC_017154	CGT	2	6	105675	105680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120679
1546	NC_017154	ATCA	2	8	105693	105700	50 %	25 %	0 %	25 %	384120679
1547	NC_017154	CAG	2	6	105723	105728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120679
1548	NC_017154	TCA	2	6	105743	105748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120679
1549	NC_017154	A	6	6	105824	105829	100 %	0 %	0 %	0 %	384120679
1550	NC_017154	TTTCGG	2	12	105926	105937	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384120679
1551	NC_017154	GCAAG	2	10	105968	105977	40 %	0 %	40 %	20 %	384120679
1552	NC_017154	GTTG	2	8	106008	106015	0 %	50 %	50 %	0 %	384120679
1553	NC_017154	CAA	2	6	106052	106057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120679
1554	NC_017154	ATCA	2	8	106080	106087	50 %	25 %	0 %	25 %	384120679
1555	NC_017154	GT	3	6	106139	106144	0 %	50 %	50 %	0 %	384120679
1556	NC_017154	CGC	2	6	106148	106153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120679
1557	NC_017154	A	6	6	106155	106160	100 %	0 %	0 %	0 %	384120679
1558	NC_017154	AGTC	2	8	106173	106180	25 %	25 %	25 %	25 %	384120679
1559	NC_017154	TGC	2	6	106236	106241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120679
1560	NC_017154	T	6	6	106309	106314	0 %	100 %	0 %	0 %	384120679
1561	NC_017154	ACC	2	6	106396	106401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120679
1562	NC_017154	CCAG	2	8	106406	106413	25 %	0 %	25 %	50 %	384120679
1563	NC_017154	CCA	2	6	106414	106419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120679
1564	NC_017154	CAT	2	6	106428	106433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120679
1565	NC_017154	ATG	2	6	106465	106470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120679
1566	NC_017154	TTG	2	6	106483	106488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120679
1567	NC_017154	GAT	2	6	106583	106588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120679
1568	NC_017154	ATA	2	6	106862	106867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120679
1569	NC_017154	T	6	6	106886	106891	0 %	100 %	0 %	0 %	384120679
1570	NC_017154	AAT	2	6	106995	107000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120679
1571	NC_017154	CAA	2	6	107021	107026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120679
1572	NC_017154	GAC	2	6	107028	107033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120679
1573	NC_017154	ATTA	2	8	107139	107146	50 %	50 %	0 %	0 %	384120679
1574	NC_017154	GAA	2	6	107170	107175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120679
1575	NC_017154	TAAAT	2	10	107193	107202	60 %	40 %	0 %	0 %	384120679
1576	NC_017154	ATCC	2	8	107211	107218	25 %	25 %	0 %	50 %	384120679
1577	NC_017154	CTG	2	6	107261	107266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120679
1578	NC_017154	ACG	2	6	107295	107300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120679
1579	NC_017154	T	6	6	107320	107325	0 %	100 %	0 %	0 %	384120679
1580	NC_017154	TCAT	2	8	107344	107351	25 %	50 %	0 %	25 %	384120679
1581	NC_017154	T	6	6	107418	107423	0 %	100 %	0 %	0 %	384120680
1582	NC_017154	TTG	2	6	107584	107589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120680
1583	NC_017154	TAGAGA	2	12	107604	107615	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384120680
1584	NC_017154	TA	3	6	107692	107697	50 %	50 %	0 %	0 %	384120680
1585	NC_017154	AAT	2	6	107733	107738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120680
1586	NC_017154	AAAT	2	8	107902	107909	75 %	25 %	0 %	0 %	384120680
1587	NC_017154	GA	3	6	107913	107918	50 %	0 %	50 %	0 %	384120680
1588	NC_017154	TGT	2	6	108023	108028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120680
1589	NC_017154	CGC	2	6	108113	108118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120680
1590	NC_017154	ATC	2	6	108121	108126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120680
1591	NC_017154	GCT	2	6	108192	108197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120680
1592	NC_017154	TAT	2	6	108237	108242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120680
1593	NC_017154	TGA	2	6	108243	108248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120680
1594	NC_017154	TTAT	2	8	108272	108279	25 %	75 %	0 %	0 %	384120680
1595	NC_017154	T	6	6	108385	108390	0 %	100 %	0 %	0 %	384120680
1596	NC_017154	TTG	2	6	108403	108408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120680
1597	NC_017154	A	6	6	108414	108419	100 %	0 %	0 %	0 %	384120680
1598	NC_017154	TAAT	2	8	108498	108505	50 %	50 %	0 %	0 %	384120680
1599	NC_017154	AGC	2	6	108529	108534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120680
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1601	NC_017154	TGC	2	6	108627	108632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120680
1602	NC_017154	TATCGG	2	12	109788	109799	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384120681
1603	NC_017154	AAT	2	6	109850	109855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120681
1604	NC_017154	AATGC	2	10	109982	109991	40 %	20 %	20 %	20 %	384120681
1605	NC_017154	CAG	2	6	110021	110026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120681
1606	NC_017154	GCG	2	6	110093	110098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120681
1607	NC_017154	GTG	3	9	110177	110185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120681
1608	NC_017154	G	6	6	110195	110200	0 %	0 %	100 %	0 %	384120681
1609	NC_017154	TG	3	6	110229	110234	0 %	50 %	50 %	0 %	384120681
1610	NC_017154	TTC	2	6	110255	110260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120681
1611	NC_017154	GATAA	2	10	110444	110453	60 %	20 %	20 %	0 %	384120682
1612	NC_017154	GAA	2	6	110488	110493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120682
1613	NC_017154	TCA	2	6	110540	110545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120682
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1615	NC_017154	ACC	2	6	110704	110709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120682
1616	NC_017154	ACA	2	6	110760	110765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120682
1617	NC_017154	GTA	2	6	110792	110797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120682
1618	NC_017154	CCA	2	6	110804	110809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120682
1619	NC_017154	CCA	2	6	110822	110827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120682
1620	NC_017154	CTG	2	6	111129	111134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120683
1621	NC_017154	AAAC	2	8	111150	111157	75 %	0 %	0 %	25 %	384120683
1622	NC_017154	TAA	2	6	111187	111192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120683
1623	NC_017154	AGA	2	6	111246	111251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120683
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1985	NC_017154	CAAG	2	8	133588	133595	50 %	0 %	25 %	25 %	384120701
1986	NC_017154	GCC	2	6	133602	133607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120701
1987	NC_017154	CGCCTG	2	12	133838	133849	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384120701
1988	NC_017154	GCA	2	6	133852	133857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120701
1989	NC_017154	ACCC	2	8	133964	133971	25 %	0 %	0 %	75 %	384120701
1990	NC_017154	TGC	2	6	133992	133997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120701
1991	NC_017154	CTG	2	6	134003	134008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120701
1992	NC_017154	TTG	2	6	134129	134134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120701
1993	NC_017154	TCA	3	9	134148	134156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120701
1994	NC_017154	AACA	2	8	134189	134196	75 %	0 %	0 %	25 %	384120701
1995	NC_017154	CAT	2	6	134237	134242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120701
1996	NC_017154	TG	4	8	134268	134275	0 %	50 %	50 %	0 %	384120701
1997	NC_017154	AAAT	2	8	134365	134372	75 %	25 %	0 %	0 %	384120701
1998	NC_017154	CGC	2	6	134397	134402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120701
1999	NC_017154	GTTG	2	8	134406	134413	0 %	50 %	50 %	0 %	384120701
2000	NC_017154	CT	3	6	134432	134437	0 %	50 %	0 %	50 %	384120701

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