MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017154	TGC	2	6	69901	69906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120646
1003	NC_017154	GCC	2	6	69920	69925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120646
1004	NC_017154	ATC	2	6	69936	69941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120646
1005	NC_017154	AAC	3	9	70229	70237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120647
1006	NC_017154	TTA	2	6	70280	70285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120647
1007	NC_017154	ATC	2	6	70370	70375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120647
1008	NC_017154	ACAT	2	8	70460	70467	50 %	25 %	0 %	25 %	384120647
1009	NC_017154	CTC	2	6	70524	70529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384120647
1010	NC_017154	CGG	2	6	70545	70550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120647
1011	NC_017154	ATT	2	6	70585	70590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120647
1012	NC_017154	CGTTAT	2	12	70648	70659	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384120647
1013	NC_017154	CAA	2	6	70662	70667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120647
1014	NC_017154	ATGG	2	8	70756	70763	25 %	25 %	50 %	0 %	384120647
1015	NC_017154	GT	3	6	70786	70791	0 %	50 %	50 %	0 %	384120647
1016	NC_017154	TGA	2	6	70800	70805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120647
1017	NC_017154	GAT	2	6	70828	70833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120647
1018	NC_017154	ATC	2	6	70909	70914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120647
1019	NC_017154	CGG	2	6	70938	70943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120647
1020	NC_017154	CGC	2	6	71046	71051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120647
1021	NC_017154	CTG	2	6	71071	71076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120647
1022	NC_017154	AGGG	2	8	71081	71088	25 %	0 %	75 %	0 %	384120647
1023	NC_017154	ATT	2	6	71179	71184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120647
1024	NC_017154	AAG	2	6	71240	71245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120647
1025	NC_017154	CTT	3	9	71262	71270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120647
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1027	NC_017154	A	6	6	71561	71566	100 %	0 %	0 %	0 %	384120648
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1029	NC_017154	GTG	2	6	71705	71710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120648
1030	NC_017154	GGTG	2	8	71736	71743	0 %	25 %	75 %	0 %	384120648
1031	NC_017154	TGA	2	6	71826	71831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120648
1032	NC_017154	TAT	2	6	71934	71939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120648
1033	NC_017154	GCC	2	6	71941	71946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120648
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1035	NC_017154	TGAA	2	8	71993	72000	50 %	25 %	25 %	0 %	384120648
1036	NC_017154	TGG	2	6	72171	72176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120648
1037	NC_017154	CCG	2	6	72199	72204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120648
1038	NC_017154	TCGA	2	8	72214	72221	25 %	25 %	25 %	25 %	384120648
1039	NC_017154	TGA	2	6	72360	72365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120648
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1041	NC_017154	GCC	2	6	72577	72582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120649
1042	NC_017154	TCA	2	6	72625	72630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120649
1043	NC_017154	CGG	2	6	72642	72647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120649
1044	NC_017154	TTG	2	6	72663	72668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120649
1045	NC_017154	AATA	2	8	72681	72688	75 %	25 %	0 %	0 %	384120649
1046	NC_017154	CCG	2	6	72692	72697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120649
1047	NC_017154	GTTTT	2	10	72827	72836	0 %	80 %	20 %	0 %	384120649
1048	NC_017154	GA	4	8	72842	72849	50 %	0 %	50 %	0 %	384120649
1049	NC_017154	AGC	2	6	72868	72873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120649
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1051	NC_017154	TTG	2	6	72921	72926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120649
1052	NC_017154	AGGGTG	2	12	72945	72956	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384120649
1053	NC_017154	GCG	2	6	72981	72986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120649
1054	NC_017154	TTG	2	6	73011	73016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120649
1055	NC_017154	GCT	2	6	73024	73029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120649
1056	NC_017154	GAT	2	6	73184	73189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120650
1057	NC_017154	GCT	2	6	73205	73210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120650
1058	NC_017154	TC	3	6	73315	73320	0 %	50 %	0 %	50 %	384120650
1059	NC_017154	AG	3	6	73424	73429	50 %	0 %	50 %	0 %	384120650
1060	NC_017154	CTGTG	2	10	73439	73448	0 %	40 %	40 %	20 %	384120650
1061	NC_017154	GAT	2	6	73472	73477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120650
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1063	NC_017154	CGG	2	6	73571	73576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120651
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1066	NC_017154	GC	3	6	73927	73932	0 %	0 %	50 %	50 %	384120651
1067	NC_017154	TCACTT	2	12	73946	73957	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384120651
1068	NC_017154	TCT	2	6	73977	73982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120651
1069	NC_017154	TGC	2	6	73988	73993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120651
1070	NC_017154	CTT	2	6	74028	74033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120651
1071	NC_017154	CTG	2	6	74128	74133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120651
1072	NC_017154	T	6	6	74169	74174	0 %	100 %	0 %	0 %	384120651
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1075	NC_017154	TTCA	2	8	74329	74336	25 %	50 %	0 %	25 %	384120651
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1082	NC_017154	T	6	6	74643	74648	0 %	100 %	0 %	0 %	384120651
1083	NC_017154	A	6	6	74766	74771	100 %	0 %	0 %	0 %	384120651
1084	NC_017154	GAC	2	6	74799	74804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120651
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1088	NC_017154	CT	3	6	74884	74889	0 %	50 %	0 %	50 %	384120651
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1092	NC_017154	TGGT	2	8	74976	74983	0 %	50 %	50 %	0 %	384120652
1093	NC_017154	GT	3	6	75071	75076	0 %	50 %	50 %	0 %	384120652
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1098	NC_017154	CAT	2	6	75273	75278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120652
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1102	NC_017154	TCA	2	6	75486	75491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120652
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1104	NC_017154	GGCG	2	8	75651	75658	0 %	0 %	75 %	25 %	384120652
1105	NC_017154	GGTT	2	8	75739	75746	0 %	50 %	50 %	0 %	384120652
1106	NC_017154	TCA	2	6	75755	75760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120652
1107	NC_017154	CAC	2	6	75765	75770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120652
1108	NC_017154	AAT	2	6	75901	75906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120652
1109	NC_017154	TGA	2	6	75961	75966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120652
1110	NC_017154	GTG	2	6	75978	75983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120652
1111	NC_017154	GCC	2	6	76040	76045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120652
1112	NC_017154	ATA	2	6	76061	76066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120652
1113	NC_017154	ACC	2	6	76087	76092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120652
1114	NC_017154	AAC	2	6	76100	76105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120652
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1116	NC_017154	CAGG	2	8	76284	76291	25 %	0 %	50 %	25 %	384120652
1117	NC_017154	TG	3	6	76321	76326	0 %	50 %	50 %	0 %	384120652
1118	NC_017154	TGC	2	6	76334	76339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120652
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1122	NC_017154	GTT	3	9	76911	76919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120653
1123	NC_017154	GTG	2	6	76979	76984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120653
1124	NC_017154	TAAT	2	8	76997	77004	50 %	50 %	0 %	0 %	384120653
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1251	NC_017154	GCTG	2	8	86083	86090	0 %	25 %	50 %	25 %	384120662
1252	NC_017154	CCAG	2	8	86102	86109	25 %	0 %	25 %	50 %	384120662
1253	NC_017154	GTTG	2	8	86144	86151	0 %	50 %	50 %	0 %	384120662
1254	NC_017154	CTG	2	6	86202	86207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120662
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1373	NC_017154	ATG	2	6	94105	94110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120669
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1493	NC_017154	TTCAC	2	10	101381	101390	20 %	40 %	0 %	40 %	384120676
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1498	NC_017154	GGA	2	6	101614	101619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384120676
1499	NC_017154	GTC	2	6	101674	101679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120676
1500	NC_017154	CAT	2	6	101704	101709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120676

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