MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 chromosome

Total Repeats: 2322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014029	GTGTT	2	10	7332	7341	0 %	60 %	40 %	0 %	294502116
2	NC_014029	TCCAT	2	10	9241	9250	20 %	40 %	0 %	40 %	294502118
3	NC_014029	TGCAA	2	10	9896	9905	40 %	20 %	20 %	20 %	294502119
4	NC_014029	CTCTT	2	10	19709	19718	0 %	60 %	0 %	40 %	294502122
5	NC_014029	CCTGA	2	10	20827	20836	20 %	20 %	20 %	40 %	294502124
6	NC_014029	GATTG	2	10	23949	23958	20 %	40 %	40 %	0 %	294502126
7	NC_014029	GCCCC	2	10	24102	24111	0 %	0 %	20 %	80 %	294502126
8	NC_014029	TTGGC	2	10	25240	25249	0 %	40 %	40 %	20 %	294502126
9	NC_014029	GAGAA	2	10	28734	28743	60 %	0 %	40 %	0 %	294502129
10	NC_014029	GTCAG	2	10	29288	29297	20 %	20 %	40 %	20 %	294502130
11	NC_014029	TTGAT	2	10	29603	29612	20 %	60 %	20 %	0 %	294502130
12	NC_014029	GCTGA	2	10	29668	29677	20 %	20 %	40 %	20 %	294502130
13	NC_014029	TTGGG	2	10	29945	29954	0 %	40 %	60 %	0 %	294502130
14	NC_014029	AACGC	2	10	30572	30581	40 %	0 %	20 %	40 %	294502131
15	NC_014029	CCCGA	2	10	31023	31032	20 %	0 %	20 %	60 %	294502131
16	NC_014029	TGTGA	2	10	35965	35974	20 %	40 %	40 %	0 %	294502134
17	NC_014029	TTCCT	2	10	36773	36782	0 %	60 %	0 %	40 %	294502134
18	NC_014029	TTTGA	2	10	39401	39410	20 %	60 %	20 %	0 %	294502138
19	NC_014029	GCGCT	2	10	40039	40048	0 %	20 %	40 %	40 %	294502138
20	NC_014029	ACCTT	2	10	40439	40448	20 %	40 %	0 %	40 %	294502139
21	NC_014029	CGAAC	2	10	40788	40797	40 %	0 %	20 %	40 %	294502139
22	NC_014029	TGAGT	2	10	42167	42176	20 %	40 %	40 %	0 %	294502140
23	NC_014029	CAGCC	2	10	43348	43357	20 %	0 %	20 %	60 %	294502141
24	NC_014029	AGCAC	2	10	44107	44116	40 %	0 %	20 %	40 %	294502141
25	NC_014029	TAAGT	2	10	44342	44351	40 %	40 %	20 %	0 %	294502142
26	NC_014029	GCTGG	2	10	46108	46117	0 %	20 %	60 %	20 %	294502143
27	NC_014029	TTTGG	2	10	46442	46451	0 %	60 %	40 %	0 %	294502143
28	NC_014029	ATCAC	2	10	46577	46586	40 %	20 %	0 %	40 %	294502143
29	NC_014029	TCAAT	2	10	49044	49053	40 %	40 %	0 %	20 %	294502144
30	NC_014029	TCAGA	2	10	52848	52857	40 %	20 %	20 %	20 %	294502147
31	NC_014029	GGCGG	2	10	54148	54157	0 %	0 %	80 %	20 %	294502148
32	NC_014029	GGGTG	2	10	54388	54397	0 %	20 %	80 %	0 %	294502148
33	NC_014029	TCATC	2	10	62021	62030	20 %	40 %	0 %	40 %	294502156
34	NC_014029	GCAGC	2	10	63947	63956	20 %	0 %	40 %	40 %	294502157
35	NC_014029	GCGGT	2	10	65833	65842	0 %	20 %	60 %	20 %	294502160
36	NC_014029	CTGCC	2	10	68231	68240	0 %	20 %	20 %	60 %	294502162
37	NC_014029	CGCCA	2	10	68647	68656	20 %	0 %	20 %	60 %	294502162
38	NC_014029	CATCA	2	10	68870	68879	40 %	20 %	0 %	40 %	294502162
39	NC_014029	GCCAG	2	10	69025	69034	20 %	0 %	40 %	40 %	294502163
40	NC_014029	GTTTT	2	10	72827	72836	0 %	80 %	20 %	0 %	294502166
41	NC_014029	CTGTG	2	10	73439	73448	0 %	40 %	40 %	20 %	294502167
42	NC_014029	AACAA	2	10	77748	77757	80 %	0 %	0 %	20 %	294502171
43	NC_014029	CCAAA	2	10	92061	92070	60 %	0 %	0 %	40 %	294502184
44	NC_014029	AATGC	2	10	92736	92745	40 %	20 %	20 %	20 %	294502184
45	NC_014029	AACAA	2	10	92883	92892	80 %	0 %	0 %	20 %	294502184
46	NC_014029	ACGCC	2	10	94875	94884	20 %	0 %	20 %	60 %	294502187
47	NC_014029	ACGCG	2	10	95827	95836	20 %	0 %	40 %	40 %	294502187
48	NC_014029	TCAAA	2	10	97514	97523	60 %	20 %	0 %	20 %	294502189
49	NC_014029	TTTCT	2	10	97688	97697	0 %	80 %	0 %	20 %	294502189
50	NC_014029	TTGGC	2	10	100239	100248	0 %	40 %	40 %	20 %	294502192
51	NC_014029	TTCAC	2	10	101381	101390	20 %	40 %	0 %	40 %	294502193
52	NC_014029	GTTTT	2	10	105246	105255	0 %	80 %	20 %	0 %	294502196
53	NC_014029	GCAAT	2	10	105643	105652	40 %	20 %	20 %	20 %	294502196
54	NC_014029	GCAAG	2	10	105968	105977	40 %	0 %	40 %	20 %	294502196
55	NC_014029	TAAAT	2	10	107193	107202	60 %	40 %	0 %	0 %	294502196
56	NC_014029	AATGC	2	10	109982	109991	40 %	20 %	20 %	20 %	294502198
57	NC_014029	GATAA	2	10	110444	110453	60 %	20 %	20 %	0 %	294502199
58	NC_014029	AGGTA	2	10	116568	116577	40 %	20 %	40 %	0 %	294502205
59	NC_014029	TGAGT	2	10	125884	125893	20 %	40 %	40 %	0 %	294502210
60	NC_014029	TCCAG	2	10	127307	127316	20 %	20 %	20 %	40 %	294502212
61	NC_014029	GAACC	2	10	127463	127472	40 %	0 %	20 %	40 %	294502212
62	NC_014029	TTTTG	2	10	128268	128277	0 %	80 %	20 %	0 %	294502213
63	NC_014029	TTCAC	2	10	131431	131440	20 %	40 %	0 %	40 %	294502216
64	NC_014029	GCATT	2	10	139385	139394	20 %	40 %	20 %	20 %	294502222
65	NC_014029	CGCGG	2	10	142127	142136	0 %	0 %	60 %	40 %	294502223
66	NC_014029	CACTT	2	10	142706	142715	20 %	40 %	0 %	40 %	294502223
67	NC_014029	GCGCA	2	10	144688	144697	20 %	0 %	40 %	40 %	294502224
68	NC_014029	AGGTT	2	10	155080	155089	20 %	40 %	40 %	0 %	294502232
69	NC_014029	CATCC	2	10	156131	156140	20 %	20 %	0 %	60 %	294502232
70	NC_014029	GCCCG	2	10	157506	157515	0 %	0 %	40 %	60 %	294502234
71	NC_014029	GGACC	2	10	158774	158783	20 %	0 %	40 %	40 %	294502234
72	NC_014029	GCTCA	2	10	160745	160754	20 %	20 %	20 %	40 %	294502235
73	NC_014029	TTGGC	2	10	161060	161069	0 %	40 %	40 %	20 %	294502236
74	NC_014029	TTGAG	2	10	163597	163606	20 %	40 %	40 %	0 %	294502239
75	NC_014029	TGGCT	2	10	165562	165571	0 %	40 %	40 %	20 %	294502241
76	NC_014029	ATTTT	2	10	174477	174486	20 %	80 %	0 %	0 %	294502250
77	NC_014029	GTGCG	2	10	174487	174496	0 %	20 %	60 %	20 %	294502250
78	NC_014029	TGGTG	2	10	178038	178047	0 %	40 %	60 %	0 %	294502251
79	NC_014029	AGCTG	2	10	183665	183674	20 %	20 %	40 %	20 %	294502255
80	NC_014029	CCATA	2	10	183972	183981	40 %	20 %	0 %	40 %	294502255
81	NC_014029	AATTG	2	10	189631	189640	40 %	40 %	20 %	0 %	294502259
82	NC_014029	TGCCA	2	10	189984	189993	20 %	20 %	20 %	40 %	294502260
83	NC_014029	TTGAA	2	10	190336	190345	40 %	40 %	20 %	0 %	294502260
84	NC_014029	CTTCC	2	10	194203	194212	0 %	40 %	0 %	60 %	294502264
85	NC_014029	CGGTA	2	10	197943	197952	20 %	20 %	40 %	20 %	294502267
86	NC_014029	GCAAG	2	10	198282	198291	40 %	0 %	40 %	20 %	294502267
87	NC_014029	TACGT	2	10	199177	199186	20 %	40 %	20 %	20 %	294502269
88	NC_014029	CGTTG	2	10	199453	199462	0 %	40 %	40 %	20 %	294502269
89	NC_014029	GCTGA	2	10	199838	199847	20 %	20 %	40 %	20 %	294502269
90	NC_014029	GCACC	2	10	200502	200511	20 %	0 %	20 %	60 %	294502270
91	NC_014029	ATGGC	2	10	204662	204671	20 %	20 %	40 %	20 %	294502274
92	NC_014029	GGCAT	2	10	206627	206636	20 %	20 %	40 %	20 %	294502276
93	NC_014029	ACTCT	2	10	209971	209980	20 %	40 %	0 %	40 %	294502278
94	NC_014029	GGGCA	2	10	211144	211153	20 %	0 %	60 %	20 %	294502280
95	NC_014029	CAGCT	2	10	211492	211501	20 %	20 %	20 %	40 %	294502281
96	NC_014029	TCTGG	2	10	213501	213510	0 %	40 %	40 %	20 %	294502284
97	NC_014029	TCGTA	2	10	214372	214381	20 %	40 %	20 %	20 %	294502284
98	NC_014029	GGAAT	2	10	219651	219660	40 %	20 %	40 %	0 %	294502290
99	NC_014029	TGCAG	2	10	220390	220399	20 %	20 %	40 %	20 %	294502291
100	NC_014029	AAGGT	2	10	222946	222955	40 %	20 %	40 %	0 %	294502295
101	NC_014029	AATTT	2	10	223251	223260	40 %	60 %	0 %	0 %	304653862
102	NC_014029	GTAAA	2	10	224253	224262	60 %	20 %	20 %	0 %	294502297
103	NC_014029	CCCGT	2	10	225235	225244	0 %	20 %	20 %	60 %	294502299
104	NC_014029	GCTTT	2	10	228313	228322	0 %	60 %	20 %	20 %	294502305
105	NC_014029	TTGGG	2	10	229981	229990	0 %	40 %	60 %	0 %	294502307
106	NC_014029	GCGCT	2	10	230061	230070	0 %	20 %	40 %	40 %	294502307
107	NC_014029	CGATC	2	10	231670	231679	20 %	20 %	20 %	40 %	294502309
108	NC_014029	TTAAC	2	10	233732	233741	40 %	40 %	0 %	20 %	294502312
109	NC_014029	TGCCC	2	10	235513	235522	0 %	20 %	20 %	60 %	294502313
110	NC_014029	CTGGG	2	10	237774	237783	0 %	20 %	60 %	20 %	294502315
111	NC_014029	GTAAT	2	10	238438	238447	40 %	40 %	20 %	0 %	294502316
112	NC_014029	CGATT	2	10	241868	241877	20 %	40 %	20 %	20 %	294502321
113	NC_014029	CTTGG	2	10	241996	242005	0 %	40 %	40 %	20 %	294502321
114	NC_014029	AATAG	2	10	242409	242418	60 %	20 %	20 %	0 %	294502322
115	NC_014029	TTTGA	2	10	242867	242876	20 %	60 %	20 %	0 %	294502323
116	NC_014029	GCGCT	2	10	243505	243514	0 %	20 %	40 %	40 %	294502323
117	NC_014029	ACCTT	2	10	243905	243914	20 %	40 %	0 %	40 %	294502324
118	NC_014029	CGAAC	2	10	244254	244263	40 %	0 %	20 %	40 %	294502324
119	NC_014029	TGGCA	2	10	250622	250631	20 %	20 %	40 %	20 %	294502329
120	NC_014029	TTGAT	2	10	254836	254845	20 %	60 %	20 %	0 %	294502331
121	NC_014029	ATATA	2	10	256062	256071	60 %	40 %	0 %	0 %	294502332
122	NC_014029	AAAAT	2	10	257174	257183	80 %	20 %	0 %	0 %	294502332
123	NC_014029	TATTG	2	10	261053	261062	20 %	60 %	20 %	0 %	294502335
124	NC_014029	GGGAT	2	10	261642	261651	20 %	20 %	60 %	0 %	294502336
125	NC_014029	ATGAA	2	10	264484	264493	60 %	20 %	20 %	0 %	294502338
126	NC_014029	TCTCC	2	10	266369	266378	0 %	40 %	0 %	60 %	294502341
127	NC_014029	TATCG	2	10	266449	266458	20 %	40 %	20 %	20 %	294502341
128	NC_014029	GGGCG	2	10	269714	269723	0 %	0 %	80 %	20 %	294502345
129	NC_014029	GCAGA	2	10	270339	270348	40 %	0 %	40 %	20 %	294502345
130	NC_014029	TGGGC	2	10	271750	271759	0 %	20 %	60 %	20 %	294502346
131	NC_014029	GCAGC	2	10	272698	272707	20 %	0 %	40 %	40 %	294502347
132	NC_014029	ATTTA	2	10	273308	273317	40 %	60 %	0 %	0 %	294502347
133	NC_014029	TTCTT	2	10	274717	274726	0 %	80 %	0 %	20 %	294502348
134	NC_014029	TCACT	2	10	276745	276754	20 %	40 %	0 %	40 %	294502350
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251	NC_014029	GTTCT	2	10	483742	483751	0 %	60 %	20 %	20 %	294502514
252	NC_014029	TCGGT	2	10	485667	485676	0 %	40 %	40 %	20 %	294502516
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260	NC_014029	TCACT	2	10	502211	502220	20 %	40 %	0 %	40 %	294502525
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