MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 chromosome

Total Repeats: 70701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014029	TGC	2	6	254780	254785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502331
4002	NC_014029	TTGAT	2	10	254836	254845	20 %	60 %	20 %	0 %	294502331
4003	NC_014029	TTGC	2	8	254850	254857	0 %	50 %	25 %	25 %	294502331
4004	NC_014029	AAT	2	6	254870	254875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502331
4005	NC_014029	CAA	2	6	254890	254895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502331
4006	NC_014029	CA	3	6	254985	254990	50 %	0 %	0 %	50 %	294502331
4007	NC_014029	GCCA	2	8	255006	255013	25 %	0 %	25 %	50 %	294502331
4008	NC_014029	ATT	2	6	255049	255054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502331
4009	NC_014029	GAT	2	6	255116	255121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502331
4010	NC_014029	ATA	2	6	255161	255166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502331
4011	NC_014029	ATA	2	6	255178	255183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502331
4012	NC_014029	CGG	2	6	255192	255197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502331
4013	NC_014029	TAG	2	6	255272	255277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502331
4014	NC_014029	TCG	2	6	255334	255339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502331
4015	NC_014029	TTA	2	6	255342	255347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502331
4016	NC_014029	GGC	2	6	255352	255357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502331
4017	NC_014029	CCGC	2	8	255396	255403	0 %	0 %	25 %	75 %	294502331
4018	NC_014029	GTT	2	6	255470	255475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502331
4019	NC_014029	TAA	2	6	255517	255522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502331
4020	NC_014029	TGA	2	6	255541	255546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502331
4021	NC_014029	AT	3	6	255725	255730	50 %	50 %	0 %	0 %	294502332
4022	NC_014029	ATTTAA	2	12	255758	255769	50 %	50 %	0 %	0 %	294502332
4023	NC_014029	T	8	8	255830	255837	0 %	100 %	0 %	0 %	294502332
4024	NC_014029	TTG	2	6	255844	255849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502332
4025	NC_014029	T	7	7	255900	255906	0 %	100 %	0 %	0 %	294502332
4026	NC_014029	ATT	2	6	255936	255941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502332
4027	NC_014029	A	6	6	256034	256039	100 %	0 %	0 %	0 %	294502332
4028	NC_014029	ATATA	2	10	256062	256071	60 %	40 %	0 %	0 %	294502332
4029	NC_014029	TCAA	3	12	256113	256124	50 %	25 %	0 %	25 %	294502332
4030	NC_014029	GTTA	2	8	256164	256171	25 %	50 %	25 %	0 %	294502332
4031	NC_014029	ACCAAA	2	12	256319	256330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502332
4032	NC_014029	CAG	2	6	256370	256375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502332
4033	NC_014029	GT	3	6	256430	256435	0 %	50 %	50 %	0 %	294502332
4034	NC_014029	AAT	2	6	256456	256461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502332
4035	NC_014029	GGCG	2	8	256470	256477	0 %	0 %	75 %	25 %	294502332
4036	NC_014029	AACC	2	8	256480	256487	50 %	0 %	0 %	50 %	294502332
4037	NC_014029	CAAG	2	8	256498	256505	50 %	0 %	25 %	25 %	294502332
4038	NC_014029	ATT	2	6	256546	256551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502332
4039	NC_014029	TAT	2	6	256638	256643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502332
4040	NC_014029	TGG	2	6	256704	256709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502332
4041	NC_014029	AAT	2	6	256744	256749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502332
4042	NC_014029	A	7	7	256814	256820	100 %	0 %	0 %	0 %	294502332
4043	NC_014029	GTG	2	6	256852	256857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502332
4044	NC_014029	CAG	2	6	257038	257043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502332
4045	NC_014029	AAAAT	2	10	257174	257183	80 %	20 %	0 %	0 %	294502332
4046	NC_014029	GTT	2	6	257217	257222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502332
4047	NC_014029	GTA	2	6	257225	257230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502332
4048	NC_014029	ACC	2	6	257306	257311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502333
4049	NC_014029	CTG	2	6	257408	257413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502333
4050	NC_014029	GGA	2	6	257479	257484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502333
4051	NC_014029	AC	3	6	257515	257520	50 %	0 %	0 %	50 %	294502333
4052	NC_014029	TCAC	2	8	257607	257614	25 %	25 %	0 %	50 %	294502333
4053	NC_014029	GCTA	2	8	257641	257648	25 %	25 %	25 %	25 %	294502333
4054	NC_014029	CTG	2	6	257672	257677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502333
4055	NC_014029	T	7	7	257682	257688	0 %	100 %	0 %	0 %	294502333
4056	NC_014029	ATG	2	6	257852	257857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502333
4057	NC_014029	T	6	6	257872	257877	0 %	100 %	0 %	0 %	294502333
4058	NC_014029	GT	3	6	257912	257917	0 %	50 %	50 %	0 %	294502333
4059	NC_014029	GAT	2	6	257918	257923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502333
4060	NC_014029	TGA	2	6	257992	257997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502333
4061	NC_014029	GGC	2	6	258067	258072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502333
4062	NC_014029	TGG	2	6	258096	258101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502333
4063	NC_014029	ACA	2	6	258124	258129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502333
4064	NC_014029	TGG	2	6	258132	258137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502333
4065	NC_014029	TTA	2	6	258158	258163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502333
4066	NC_014029	TAA	2	6	258187	258192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502333
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4068	NC_014029	CAG	4	12	258227	258238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502333
4069	NC_014029	CAG	2	6	258266	258271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502333
4070	NC_014029	GTCA	2	8	258286	258293	25 %	25 %	25 %	25 %	294502333
4071	NC_014029	TTC	2	6	258333	258338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502333
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4073	NC_014029	TGG	2	6	258397	258402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502333
4074	NC_014029	GCA	2	6	258409	258414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502333
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4076	NC_014029	TTA	2	6	258473	258478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502333
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4079	NC_014029	AT	3	6	259018	259023	50 %	50 %	0 %	0 %	294502334
4080	NC_014029	AGA	2	6	259036	259041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502334
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4082	NC_014029	TTAA	2	8	259138	259145	50 %	50 %	0 %	0 %	294502334
4083	NC_014029	TCTTTA	2	12	259173	259184	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294502334
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4089	NC_014029	TTA	2	6	260563	260568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502335
4090	NC_014029	CAG	2	6	260700	260705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502335
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4092	NC_014029	GTG	2	6	260916	260921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502335
4093	NC_014029	CAA	2	6	260964	260969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502335
4094	NC_014029	TTA	2	6	260997	261002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502335
4095	NC_014029	TGG	2	6	261028	261033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502335
4096	NC_014029	TATTG	2	10	261053	261062	20 %	60 %	20 %	0 %	294502335
4097	NC_014029	ATG	2	6	261270	261275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502336
4098	NC_014029	AGCT	2	8	261313	261320	25 %	25 %	25 %	25 %	294502336
4099	NC_014029	CCCA	2	8	261340	261347	25 %	0 %	0 %	75 %	294502336
4100	NC_014029	CAA	2	6	261456	261461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502336
4101	NC_014029	GCCT	2	8	261463	261470	0 %	25 %	25 %	50 %	294502336
4102	NC_014029	GAT	2	6	261564	261569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502336
4103	NC_014029	CCG	2	6	261581	261586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502336
4104	NC_014029	GCT	2	6	261608	261613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502336
4105	NC_014029	GAT	2	6	261621	261626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502336
4106	NC_014029	CAA	2	6	261630	261635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502336
4107	NC_014029	GGGAT	2	10	261642	261651	20 %	20 %	60 %	0 %	294502336
4108	NC_014029	CAG	2	6	261684	261689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502336
4109	NC_014029	TGCC	2	8	261725	261732	0 %	25 %	25 %	50 %	294502336
4110	NC_014029	ATT	2	6	261750	261755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502336
4111	NC_014029	C	6	6	261779	261784	0 %	0 %	0 %	100 %	294502336
4112	NC_014029	GCC	2	6	261907	261912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502337
4113	NC_014029	CGG	2	6	261927	261932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502337
4114	NC_014029	GCG	2	6	262007	262012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502337
4115	NC_014029	GT	3	6	262023	262028	0 %	50 %	50 %	0 %	294502337
4116	NC_014029	GCG	2	6	262043	262048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502337
4117	NC_014029	TCAG	2	8	262068	262075	25 %	25 %	25 %	25 %	294502337
4118	NC_014029	GCTG	2	8	262119	262126	0 %	25 %	50 %	25 %	294502337
4119	NC_014029	GCC	2	6	262184	262189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502337
4120	NC_014029	AAC	2	6	262221	262226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502337
4121	NC_014029	ACC	2	6	262331	262336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502337
4122	NC_014029	TGC	2	6	262410	262415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502337
4123	NC_014029	TC	3	6	262427	262432	0 %	50 %	0 %	50 %	294502337
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4241	NC_014029	T	7	7	268200	268206	0 %	100 %	0 %	0 %	294502343
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4488	NC_014029	CCATG	2	10	282607	282616	20 %	20 %	20 %	40 %	294502355
4489	NC_014029	GCGG	2	8	282761	282768	0 %	0 %	75 %	25 %	294502355
4490	NC_014029	CGAT	2	8	282802	282809	25 %	25 %	25 %	25 %	294502355
4491	NC_014029	TTA	2	6	282888	282893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502355
4492	NC_014029	GCG	2	6	282912	282917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502355
4493	NC_014029	TTG	2	6	282993	282998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502355
4494	NC_014029	TGCT	2	8	283010	283017	0 %	50 %	25 %	25 %	294502355
4495	NC_014029	CAA	2	6	283031	283036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502355
4496	NC_014029	GGGTC	2	10	283186	283195	0 %	20 %	60 %	20 %	294502356
4497	NC_014029	TCA	2	6	283263	283268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502356
4498	NC_014029	TTGA	2	8	283304	283311	25 %	50 %	25 %	0 %	294502356
4499	NC_014029	CAG	2	6	283355	283360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502356
4500	NC_014029	CGG	2	6	283483	283488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502356

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