MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pMT1

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014022	CAGGAG	2	12	408	419	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294501993
2	NC_014022	ATAGTG	2	12	3002	3013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294501996
3	NC_014022	GCTGAA	2	12	5261	5272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294501996
4	NC_014022	GTGCCA	2	12	5756	5767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294501996
5	NC_014022	CGAGTT	2	12	11312	11323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294501999
6	NC_014022	AGTGAT	2	12	19589	19600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502005
7	NC_014022	GTTACG	2	12	22695	22706	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294502011
8	NC_014022	AACGGT	2	12	24271	24282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294502013
9	NC_014022	GGCTGC	2	12	27020	27031	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294502015
10	NC_014022	GACGCC	2	12	29451	29462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294502017
11	NC_014022	GGTGGC	2	12	33464	33475	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	294502021
12	NC_014022	CGCGCC	2	12	40713	40724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502029
13	NC_014022	TGTGGT	2	12	42686	42697	0 %	50 %	50 %	0 %	294502030
14	NC_014022	TGGATA	2	12	46762	46773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502033
15	NC_014022	AGGGTT	2	12	49685	49696	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	294502036
16	NC_014022	GCCAGT	2	12	52317	52328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294502038
17	NC_014022	TCAGCA	2	12	52611	52622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294502039
18	NC_014022	TGCTTG	2	12	53083	53094	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294502039
19	NC_014022	TCGCCA	2	12	53149	53160	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294502039
20	NC_014022	CGCCAG	2	12	56627	56638	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294502043
21	NC_014022	ACACGC	2	12	57487	57498	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	294502044
22	NC_014022	CGCCAG	2	12	61027	61038	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294502045
23	NC_014022	CGTCCA	2	12	61569	61580	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294502045
24	NC_014022	TACGGT	2	12	67023	67034	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294502049
25	NC_014022	TAATTG	2	12	67367	67378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294502049
26	NC_014022	AATTCA	2	12	68239	68250	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294502050
27	NC_014022	TTCTTT	2	12	70670	70681	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294502051
28	NC_014022	CATGTT	2	12	78403	78414	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294502057
29	NC_014022	CGCTTT	2	12	81792	81803	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294502060
30	NC_014022	ACCCCT	2	12	84127	84138	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	294502061
31	NC_014022	GTTATT	2	12	86355	86366	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294502063
32	NC_014022	CCAGGA	2	12	90853	90864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502067
33	NC_014022	TCGGCT	2	12	92695	92706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502068

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.