MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014017	CG	3	6	699	704	0 %	0 %	50 %	50 %	294496809
2	NC_014017	TA	3	6	1135	1140	50 %	50 %	0 %	0 %	294496810
3	NC_014017	AT	3	6	1228	1233	50 %	50 %	0 %	0 %	294496810
4	NC_014017	AT	3	6	1243	1248	50 %	50 %	0 %	0 %	294496810
5	NC_014017	TC	3	6	4396	4401	0 %	50 %	0 %	50 %	294496813
6	NC_014017	GA	4	8	4623	4630	50 %	0 %	50 %	0 %	294496813
7	NC_014017	AC	3	6	7480	7485	50 %	0 %	0 %	50 %	294496815
8	NC_014017	AT	3	6	7595	7600	50 %	50 %	0 %	0 %	294496815
9	NC_014017	CA	3	6	7607	7612	50 %	0 %	0 %	50 %	294496815
10	NC_014017	TG	3	6	8504	8509	0 %	50 %	50 %	0 %	294496817
11	NC_014017	AG	3	6	9743	9748	50 %	0 %	50 %	0 %	294496818
12	NC_014017	GA	3	6	10957	10962	50 %	0 %	50 %	0 %	294496819
13	NC_014017	TC	3	6	11401	11406	0 %	50 %	0 %	50 %	294496819
14	NC_014017	TA	3	6	12106	12111	50 %	50 %	0 %	0 %	294496821
15	NC_014017	TA	4	8	12322	12329	50 %	50 %	0 %	0 %	294496821
16	NC_014017	CT	3	6	14495	14500	0 %	50 %	0 %	50 %	294496823
17	NC_014017	CT	3	6	15324	15329	0 %	50 %	0 %	50 %	294496823
18	NC_014017	CT	3	6	17678	17683	0 %	50 %	0 %	50 %	294496825
19	NC_014017	CA	3	6	19773	19778	50 %	0 %	0 %	50 %	294496827
20	NC_014017	AG	3	6	19840	19845	50 %	0 %	50 %	0 %	294496827
21	NC_014017	GA	3	6	21426	21431	50 %	0 %	50 %	0 %	294496829
22	NC_014017	AT	3	6	22027	22032	50 %	50 %	0 %	0 %	294496830
23	NC_014017	AT	3	6	22083	22088	50 %	50 %	0 %	0 %	294496830
24	NC_014017	GA	3	6	22363	22368	50 %	0 %	50 %	0 %	294496830
25	NC_014017	AT	3	6	23206	23211	50 %	50 %	0 %	0 %	294496830
26	NC_014017	CG	3	6	23309	23314	0 %	0 %	50 %	50 %	294496830
27	NC_014017	AG	3	6	23397	23402	50 %	0 %	50 %	0 %	294496830
28	NC_014017	GC	3	6	24085	24090	0 %	0 %	50 %	50 %	294496831
29	NC_014017	CT	3	6	27153	27158	0 %	50 %	0 %	50 %	294496835
30	NC_014017	AG	3	6	28382	28387	50 %	0 %	50 %	0 %	294496837
31	NC_014017	CG	3	6	28942	28947	0 %	0 %	50 %	50 %	294496837
32	NC_014017	GC	3	6	29027	29032	0 %	0 %	50 %	50 %	294496837
33	NC_014017	CA	3	6	30125	30130	50 %	0 %	0 %	50 %	294496838
34	NC_014017	CT	3	6	31636	31641	0 %	50 %	0 %	50 %	294496840
35	NC_014017	GC	3	6	32043	32048	0 %	0 %	50 %	50 %	294496841
36	NC_014017	AT	3	6	32621	32626	50 %	50 %	0 %	0 %	294496841
37	NC_014017	CA	3	6	33753	33758	50 %	0 %	0 %	50 %	294496842
38	NC_014017	CT	3	6	33905	33910	0 %	50 %	0 %	50 %	294496842
39	NC_014017	TA	3	6	34230	34235	50 %	50 %	0 %	0 %	294496843
40	NC_014017	TC	3	6	34615	34620	0 %	50 %	0 %	50 %	294496843
41	NC_014017	GT	3	6	37581	37586	0 %	50 %	50 %	0 %	294496845
42	NC_014017	CG	3	6	37845	37850	0 %	0 %	50 %	50 %	294496846
43	NC_014017	AC	3	6	40372	40377	50 %	0 %	0 %	50 %	294496850
44	NC_014017	AG	3	6	41676	41681	50 %	0 %	50 %	0 %	294496852
45	NC_014017	TC	3	6	41903	41908	0 %	50 %	0 %	50 %	294496853
46	NC_014017	GC	3	6	41933	41938	0 %	0 %	50 %	50 %	294496853
47	NC_014017	GC	4	8	45987	45994	0 %	0 %	50 %	50 %	294496857
48	NC_014017	GT	3	6	46065	46070	0 %	50 %	50 %	0 %	294496857
49	NC_014017	CT	3	6	46421	46426	0 %	50 %	0 %	50 %	294496857
50	NC_014017	CT	3	6	46512	46517	0 %	50 %	0 %	50 %	294496857
51	NC_014017	TC	4	8	48557	48564	0 %	50 %	0 %	50 %	294496859
52	NC_014017	AT	3	6	49002	49007	50 %	50 %	0 %	0 %	294496859
53	NC_014017	TC	3	6	49579	49584	0 %	50 %	0 %	50 %	294496860
54	NC_014017	GC	3	6	50020	50025	0 %	0 %	50 %	50 %	294496860
55	NC_014017	GT	3	6	50052	50057	0 %	50 %	50 %	0 %	294496860
56	NC_014017	GT	3	6	51038	51043	0 %	50 %	50 %	0 %	294496860
57	NC_014017	GT	3	6	51461	51466	0 %	50 %	50 %	0 %	294496860
58	NC_014017	AG	3	6	51536	51541	50 %	0 %	50 %	0 %	294496860
59	NC_014017	GC	3	6	51973	51978	0 %	0 %	50 %	50 %	294496861
60	NC_014017	CA	3	6	52080	52085	50 %	0 %	0 %	50 %	294496861
61	NC_014017	CA	3	6	52168	52173	50 %	0 %	0 %	50 %	294496861
62	NC_014017	GC	3	6	54517	54522	0 %	0 %	50 %	50 %	294496862
63	NC_014017	CG	3	6	55022	55027	0 %	0 %	50 %	50 %	294496862
64	NC_014017	TG	3	6	55166	55171	0 %	50 %	50 %	0 %	294496862
65	NC_014017	AT	3	6	56633	56638	50 %	50 %	0 %	0 %	294496863
66	NC_014017	CA	3	6	56645	56650	50 %	0 %	0 %	50 %	294496863
67	NC_014017	CG	3	6	57876	57881	0 %	0 %	50 %	50 %	294496865
68	NC_014017	TC	3	6	59255	59260	0 %	50 %	0 %	50 %	294496866
69	NC_014017	TG	3	6	60739	60744	0 %	50 %	50 %	0 %	294496867
70	NC_014017	TC	3	6	61217	61222	0 %	50 %	0 %	50 %	294496868
71	NC_014017	CG	3	6	63384	63389	0 %	0 %	50 %	50 %	294496869
72	NC_014017	GT	3	6	63626	63631	0 %	50 %	50 %	0 %	294496869
73	NC_014017	GA	3	6	63753	63758	50 %	0 %	50 %	0 %	294496869
74	NC_014017	TA	3	6	64157	64162	50 %	50 %	0 %	0 %	294496870
75	NC_014017	GA	3	6	65441	65446	50 %	0 %	50 %	0 %	294496872

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.