MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014017	AGA	3	9	32891	32899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496841
502	NC_014017	TCG	2	6	32956	32961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496841
503	NC_014017	ACA	2	6	33038	33043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496841
504	NC_014017	TAT	2	6	33643	33648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496842
505	NC_014017	TCA	2	6	33654	33659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496842
506	NC_014017	TTTCT	2	10	33660	33669	0 %	80 %	0 %	20 %	294496842
507	NC_014017	C	7	7	33687	33693	0 %	0 %	0 %	100 %	294496842
508	NC_014017	CA	3	6	33753	33758	50 %	0 %	0 %	50 %	294496842
509	NC_014017	ACCT	2	8	33831	33838	25 %	25 %	0 %	50 %	294496842
510	NC_014017	CT	3	6	33905	33910	0 %	50 %	0 %	50 %	294496842
511	NC_014017	GAG	2	6	33921	33926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294496842
512	NC_014017	ATT	2	6	34169	34174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496843
513	NC_014017	GTT	2	6	34205	34210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496843
514	NC_014017	TA	3	6	34230	34235	50 %	50 %	0 %	0 %	294496843
515	NC_014017	AGC	2	6	34265	34270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496843
516	NC_014017	CGT	2	6	34313	34318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496843
517	NC_014017	T	6	6	34387	34392	0 %	100 %	0 %	0 %	294496843
518	NC_014017	T	6	6	34399	34404	0 %	100 %	0 %	0 %	294496843
519	NC_014017	TTGC	2	8	34583	34590	0 %	50 %	25 %	25 %	294496843
520	NC_014017	TC	3	6	34615	34620	0 %	50 %	0 %	50 %	294496843
521	NC_014017	AGA	2	6	34648	34653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496843
522	NC_014017	GGA	2	6	34672	34677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294496843
523	NC_014017	CAC	2	6	34776	34781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496843
524	NC_014017	AGCG	2	8	34793	34800	25 %	0 %	50 %	25 %	294496843
525	NC_014017	CTT	2	6	34826	34831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496843
526	NC_014017	TTG	2	6	34848	34853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496843
527	NC_014017	AGTC	2	8	34880	34887	25 %	25 %	25 %	25 %	294496843
528	NC_014017	CCAAG	2	10	34928	34937	40 %	0 %	20 %	40 %	294496843
529	NC_014017	AAT	2	6	35368	35373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496844
530	NC_014017	A	6	6	35386	35391	100 %	0 %	0 %	0 %	294496844
531	NC_014017	GAA	2	6	35409	35414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496844
532	NC_014017	TTG	2	6	35421	35426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496844
533	NC_014017	TAACGT	2	12	35545	35556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294496844
534	NC_014017	CAA	2	6	35579	35584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496844
535	NC_014017	GAT	2	6	35627	35632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496844
536	NC_014017	AAG	2	6	35694	35699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496844
537	NC_014017	TAA	2	6	35700	35705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496844
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539	NC_014017	T	6	6	35811	35816	0 %	100 %	0 %	0 %	294496845
540	NC_014017	GTTACT	2	12	35838	35849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294496845
541	NC_014017	TTATGT	2	12	35895	35906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294496845
542	NC_014017	TTA	2	6	35932	35937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496845
543	NC_014017	ATG	2	6	35957	35962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496845
544	NC_014017	GTA	2	6	35971	35976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496845
545	NC_014017	TTTGG	2	10	36063	36072	0 %	60 %	40 %	0 %	294496845
546	NC_014017	ATG	2	6	36077	36082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496845
547	NC_014017	CGTCT	2	10	36119	36128	0 %	40 %	20 %	40 %	294496845
548	NC_014017	TGGC	2	8	36204	36211	0 %	25 %	50 %	25 %	294496845
549	NC_014017	TCC	2	6	36249	36254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496845
550	NC_014017	AAC	2	6	36296	36301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496845
551	NC_014017	A	6	6	36320	36325	100 %	0 %	0 %	0 %	294496845
552	NC_014017	AGCG	2	8	36369	36376	25 %	0 %	50 %	25 %	294496845
553	NC_014017	TGA	2	6	36396	36401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496845
554	NC_014017	GCT	2	6	36409	36414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496845
555	NC_014017	CAA	2	6	36463	36468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496845
556	NC_014017	ATA	2	6	36556	36561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496845
557	NC_014017	CAA	2	6	36720	36725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496845
558	NC_014017	TCA	2	6	36726	36731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496845
559	NC_014017	GGT	2	6	36732	36737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496845
560	NC_014017	AAC	2	6	36744	36749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496845
561	NC_014017	TGAT	2	8	36794	36801	25 %	50 %	25 %	0 %	294496845
562	NC_014017	GTT	2	6	36865	36870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496845
563	NC_014017	TGAT	2	8	36911	36918	25 %	50 %	25 %	0 %	294496845
564	NC_014017	AAG	2	6	36953	36958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496845
565	NC_014017	CTGAA	2	10	36962	36971	40 %	20 %	20 %	20 %	294496845
566	NC_014017	TGC	2	6	36992	36997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496845
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569	NC_014017	GGT	2	6	37171	37176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496845
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574	NC_014017	CAT	2	6	37333	37338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496845
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578	NC_014017	ATC	2	6	37497	37502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496845
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590	NC_014017	GCT	2	6	38027	38032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496847
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595	NC_014017	TTA	2	6	38163	38168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496847
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599	NC_014017	A	6	6	38389	38394	100 %	0 %	0 %	0 %	294496847
600	NC_014017	CTG	2	6	38403	38408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496847
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606	NC_014017	ATG	2	6	38671	38676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496847
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610	NC_014017	ATTGC	2	10	39409	39418	20 %	40 %	20 %	20 %	294496848
611	NC_014017	GAA	2	6	39441	39446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496848
612	NC_014017	TGA	2	6	39478	39483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496848
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614	NC_014017	AAAT	2	8	39518	39525	75 %	25 %	0 %	0 %	294496848
615	NC_014017	GAATG	2	10	39650	39659	40 %	20 %	40 %	0 %	294496848
616	NC_014017	GCA	2	6	39829	39834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496849
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619	NC_014017	GCA	2	6	39976	39981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496849
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621	NC_014017	TAA	2	6	40083	40088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496849
622	NC_014017	GGA	2	6	40225	40230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294496850
623	NC_014017	CAA	2	6	40248	40253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496850
624	NC_014017	AAT	2	6	40261	40266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496850
625	NC_014017	AGA	2	6	40288	40293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496850
626	NC_014017	CTC	2	6	40316	40321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496850
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887	NC_014017	TGA	2	6	64704	64709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496871
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889	NC_014017	AAT	3	9	64765	64773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496871
890	NC_014017	TGA	2	6	64794	64799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496871
891	NC_014017	TAA	2	6	64802	64807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496871
892	NC_014017	GGA	2	6	64843	64848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294496871
893	NC_014017	TGA	2	6	65311	65316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496872
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897	NC_014017	CGG	2	6	65523	65528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496872
898	NC_014017	GCAC	2	8	65549	65556	25 %	0 %	25 %	50 %	294496872
899	NC_014017	GGTC	2	8	65684	65691	0 %	25 %	50 %	25 %	294496872
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918	NC_014017	T	6	6	67326	67331	0 %	100 %	0 %	0 %	294496874
919	NC_014017	GCC	2	6	67333	67338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496874
920	NC_014017	CAG	2	6	67344	67349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496874
921	NC_014017	CAG	2	6	67392	67397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496874

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