MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ chromosome

Total Repeats: 76493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010634	CAT	2	6	93900	93905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893434
1502	NC_010634	CCAG	2	8	93965	93972	25 %	0 %	25 %	50 %	186893434
1503	NC_010634	GC	3	6	94009	94014	0 %	0 %	50 %	50 %	186893434
1504	NC_010634	ACC	2	6	94078	94083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893434
1505	NC_010634	CTT	2	6	94118	94123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893434
1506	NC_010634	T	6	6	94122	94127	0 %	100 %	0 %	0 %	186893434
1507	NC_010634	CGG	2	6	94153	94158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893434
1508	NC_010634	TCA	2	6	94255	94260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893434
1509	NC_010634	CAGC	2	8	94342	94349	25 %	0 %	25 %	50 %	186893434
1510	NC_010634	TAC	2	6	94413	94418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893434
1511	NC_010634	T	8	8	94461	94468	0 %	100 %	0 %	0 %	186893434
1512	NC_010634	AGT	2	6	94470	94475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893434
1513	NC_010634	ATA	2	6	94489	94494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893434
1514	NC_010634	TTC	2	6	94700	94705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893435
1515	NC_010634	AC	3	6	94718	94723	50 %	0 %	0 %	50 %	186893435
1516	NC_010634	GGC	2	6	94738	94743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893435
1517	NC_010634	CAA	2	6	94772	94777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893435
1518	NC_010634	CGA	2	6	94783	94788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893435
1519	NC_010634	CCA	2	6	94830	94835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893435
1520	NC_010634	G	6	6	94969	94974	0 %	0 %	100 %	0 %	186893435
1521	NC_010634	CAT	2	6	95002	95007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893435
1522	NC_010634	CAGT	2	8	95008	95015	25 %	25 %	25 %	25 %	186893435
1523	NC_010634	AGA	2	6	95104	95109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893435
1524	NC_010634	TGC	2	6	95134	95139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893435
1525	NC_010634	CGA	2	6	95170	95175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893435
1526	NC_010634	CGC	2	6	95204	95209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893435
1527	NC_010634	GC	3	6	95314	95319	0 %	0 %	50 %	50 %	186893435
1528	NC_010634	AAAT	2	8	95337	95344	75 %	25 %	0 %	0 %	186893435
1529	NC_010634	AGC	2	6	95417	95422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893435
1530	NC_010634	A	6	6	95438	95443	100 %	0 %	0 %	0 %	186893435
1531	NC_010634	ATA	2	6	95514	95519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893435
1532	NC_010634	CAG	2	6	96198	96203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893436
1533	NC_010634	AC	3	6	96262	96267	50 %	0 %	0 %	50 %	186893436
1534	NC_010634	TGC	2	6	96287	96292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893436
1535	NC_010634	AAC	2	6	96340	96345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893436
1536	NC_010634	GAA	2	6	96387	96392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893436
1537	NC_010634	GTTTT	2	10	96755	96764	0 %	80 %	20 %	0 %	186893437
1538	NC_010634	TAA	2	6	96772	96777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893437
1539	NC_010634	ATT	2	6	96851	96856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893437
1540	NC_010634	TTG	2	6	96889	96894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893437
1541	NC_010634	CAAT	2	8	96940	96947	50 %	25 %	0 %	25 %	186893437
1542	NC_010634	GCCC	2	8	96961	96968	0 %	0 %	25 %	75 %	186893437
1543	NC_010634	GCT	2	6	97069	97074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893437
1544	NC_010634	TTG	2	6	97080	97085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893437
1545	NC_010634	TGT	2	6	97102	97107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893437
1546	NC_010634	GCAAT	2	10	97152	97161	40 %	20 %	20 %	20 %	186893437
1547	NC_010634	ATT	2	6	97169	97174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893437
1548	NC_010634	CGT	2	6	97184	97189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893437
1549	NC_010634	ATCA	2	8	97202	97209	50 %	25 %	0 %	25 %	186893437
1550	NC_010634	CAG	2	6	97232	97237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893437
1551	NC_010634	TCA	2	6	97252	97257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893437
1552	NC_010634	A	6	6	97333	97338	100 %	0 %	0 %	0 %	186893437
1553	NC_010634	TTTCGG	2	12	97435	97446	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	186893437
1554	NC_010634	GCAAG	2	10	97477	97486	40 %	0 %	40 %	20 %	186893437
1555	NC_010634	GTTG	2	8	97517	97524	0 %	50 %	50 %	0 %	186893437
1556	NC_010634	CAA	2	6	97561	97566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893437
1557	NC_010634	ATCA	2	8	97589	97596	50 %	25 %	0 %	25 %	186893437
1558	NC_010634	GT	3	6	97648	97653	0 %	50 %	50 %	0 %	186893437
1559	NC_010634	CGC	2	6	97657	97662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893437
1560	NC_010634	A	6	6	97664	97669	100 %	0 %	0 %	0 %	186893437
1561	NC_010634	AGTC	2	8	97682	97689	25 %	25 %	25 %	25 %	186893437
1562	NC_010634	TGC	2	6	97745	97750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893437
1563	NC_010634	T	6	6	97818	97823	0 %	100 %	0 %	0 %	186893437
1564	NC_010634	ACC	2	6	97905	97910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893437
1565	NC_010634	CCAG	2	8	97915	97922	25 %	0 %	25 %	50 %	186893437
1566	NC_010634	CCA	2	6	97923	97928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893437
1567	NC_010634	CAT	2	6	97937	97942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893437
1568	NC_010634	ATG	2	6	97974	97979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893437
1569	NC_010634	TTG	2	6	97992	97997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893437
1570	NC_010634	GAT	2	6	98092	98097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893437
1571	NC_010634	ATA	2	6	98371	98376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893437
1572	NC_010634	T	6	6	98395	98400	0 %	100 %	0 %	0 %	186893437
1573	NC_010634	AAT	2	6	98504	98509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893437
1574	NC_010634	CAA	2	6	98530	98535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893437
1575	NC_010634	GAC	2	6	98537	98542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893437
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1577	NC_010634	TAAT	2	8	98650	98657	50 %	50 %	0 %	0 %	186893437
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1584	NC_010634	TCAT	2	8	98853	98860	25 %	50 %	0 %	25 %	186893437
1585	NC_010634	T	6	6	98927	98932	0 %	100 %	0 %	0 %	186893438
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1590	NC_010634	AAT	2	6	99242	99247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893438
1591	NC_010634	AAAT	2	8	99411	99418	75 %	25 %	0 %	0 %	186893438
1592	NC_010634	GA	3	6	99422	99427	50 %	0 %	50 %	0 %	186893438
1593	NC_010634	TGT	2	6	99532	99537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893438
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1598	NC_010634	TGA	2	6	99752	99757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893438
1599	NC_010634	TTAT	2	8	99781	99788	25 %	75 %	0 %	0 %	186893438
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1601	NC_010634	TTG	2	6	99912	99917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893438
1602	NC_010634	A	6	6	99923	99928	100 %	0 %	0 %	0 %	186893438
1603	NC_010634	TAAT	2	8	100007	100014	50 %	50 %	0 %	0 %	186893438
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1610	NC_010634	TAA	2	6	100595	100600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893439
1611	NC_010634	GCT	2	6	101237	101242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893440
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1613	NC_010634	TATCGG	2	12	101297	101308	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	186893440
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1615	NC_010634	AATGC	2	10	101491	101500	40 %	20 %	20 %	20 %	186893440
1616	NC_010634	CAG	2	6	101530	101535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893440
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1620	NC_010634	TG	3	6	101738	101743	0 %	50 %	50 %	0 %	186893440
1621	NC_010634	TTC	2	6	101764	101769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893440
1622	NC_010634	GATAA	2	10	101953	101962	60 %	20 %	20 %	0 %	186893441
1623	NC_010634	GAA	2	6	101997	102002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893441
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1626	NC_010634	ACC	2	6	102213	102218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893441
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1748	NC_010634	CGC	2	6	109330	109335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893448
1749	NC_010634	CAC	2	6	109338	109343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893448
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1751	NC_010634	GGT	2	6	109672	109677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893448
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1777	NC_010634	GCG	2	6	111657	111662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893450
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1788	NC_010634	CGT	2	6	112873	112878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893452
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1873	NC_010634	GC	3	6	118017	118022	0 %	0 %	50 %	50 %	186893456
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1982	NC_010634	CGG	2	6	125247	125252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893462
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1984	NC_010634	TGA	2	6	125392	125397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893462
1985	NC_010634	ATCG	2	8	125477	125484	25 %	25 %	25 %	25 %	186893462
1986	NC_010634	AAC	2	6	125487	125492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893462
1987	NC_010634	TAT	2	6	125571	125576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893462
1988	NC_010634	TGGTA	2	10	125590	125599	20 %	40 %	40 %	0 %	186893462
1989	NC_010634	TTC	2	6	125630	125635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893462
1990	NC_010634	AGC	2	6	125647	125652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893462
1991	NC_010634	TCC	2	6	125687	125692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186893462
1992	NC_010634	AGA	2	6	125703	125708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893462
1993	NC_010634	GATGAC	2	12	125773	125784	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	186893462
1994	NC_010634	GCCT	2	8	125793	125800	0 %	25 %	25 %	50 %	186893462
1995	NC_010634	AAG	2	6	125832	125837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893462
1996	NC_010634	CTGC	2	8	125869	125876	0 %	25 %	25 %	50 %	186893462
1997	NC_010634	GGC	2	6	125881	125886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893462
1998	NC_010634	AAG	2	6	125928	125933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893462
1999	NC_010634	ATT	2	6	125973	125978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893462
2000	NC_010634	GGT	2	6	126031	126036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893462

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