MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 2145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010159	GTGTT	2	10	7317	7326	0 %	60 %	40 %	0 %	162419440
2	NC_010159	TCCAT	2	10	9226	9235	20 %	40 %	0 %	40 %	162420036
3	NC_010159	TGCAA	2	10	9881	9890	40 %	20 %	20 %	20 %	162421578
4	NC_010159	CTCTT	2	10	19760	19769	0 %	60 %	0 %	40 %	162420544
5	NC_010159	CCTGA	2	10	20889	20898	20 %	20 %	20 %	40 %	162421169
6	NC_010159	GATTG	2	10	24011	24020	20 %	40 %	40 %	0 %	162418335
7	NC_010159	GCCCC	2	10	24164	24173	0 %	0 %	20 %	80 %	162418335
8	NC_010159	TTGGC	2	10	25302	25311	0 %	40 %	40 %	20 %	162418335
9	NC_010159	GAGAA	2	10	28085	28094	60 %	0 %	40 %	0 %	162420098
10	NC_010159	GTCAG	2	10	28639	28648	20 %	20 %	40 %	20 %	162421654
11	NC_010159	TTGAT	2	10	28954	28963	20 %	60 %	20 %	0 %	162421654
12	NC_010159	GCTGA	2	10	29019	29028	20 %	20 %	40 %	20 %	162421654
13	NC_010159	TTGGG	2	10	29296	29305	0 %	40 %	60 %	0 %	162421654
14	NC_010159	AACGC	2	10	29923	29932	40 %	0 %	20 %	40 %	162421177
15	NC_010159	CCCGA	2	10	30374	30383	20 %	0 %	20 %	60 %	162421177
16	NC_010159	TGTGA	2	10	36026	36035	20 %	40 %	40 %	0 %	162420145
17	NC_010159	TTCCT	2	10	36834	36843	0 %	60 %	0 %	40 %	162420145
18	NC_010159	TTTGA	2	10	39462	39471	20 %	60 %	20 %	0 %	162420449
19	NC_010159	ACCTT	2	10	40174	40183	20 %	40 %	0 %	40 %	162420449
20	NC_010159	CGAAC	2	10	40523	40532	40 %	0 %	20 %	40 %	162420449
21	NC_010159	TGAGT	2	10	41902	41911	20 %	40 %	40 %	0 %	162421692
22	NC_010159	CAGCC	2	10	43083	43092	20 %	0 %	20 %	60 %	162421773
23	NC_010159	AGCAC	2	10	43842	43851	40 %	0 %	20 %	40 %	162421773
24	NC_010159	TAAGT	2	10	44077	44086	40 %	40 %	20 %	0 %	162418696
25	NC_010159	GCTGG	2	10	45843	45852	0 %	20 %	60 %	20 %	162418297
26	NC_010159	TTTGG	2	10	46177	46186	0 %	60 %	40 %	0 %	162418297
27	NC_010159	ATCAC	2	10	46312	46321	40 %	20 %	0 %	40 %	162418297
28	NC_010159	TCAAT	2	10	48779	48788	40 %	40 %	0 %	20 %	162419548
29	NC_010159	TCAGA	2	10	52583	52592	40 %	20 %	20 %	20 %	162420259
30	NC_010159	GGCGG	2	10	53883	53892	0 %	0 %	80 %	20 %	162420613
31	NC_010159	GGGTG	2	10	54123	54132	0 %	20 %	80 %	0 %	162420613
32	NC_010159	TCATC	2	10	62466	62475	20 %	40 %	0 %	40 %	162421088
33	NC_010159	GCAGC	2	10	64392	64401	20 %	0 %	40 %	40 %	162418456
34	NC_010159	GCGGT	2	10	66278	66287	0 %	20 %	60 %	20 %	162420891
35	NC_010159	CTGCC	2	10	68676	68685	0 %	20 %	20 %	60 %	162420304
36	NC_010159	CGCCA	2	10	69092	69101	20 %	0 %	20 %	60 %	162420304
37	NC_010159	CATCA	2	10	69315	69324	40 %	20 %	0 %	40 %	162420304
38	NC_010159	GCCAG	2	10	69470	69479	20 %	0 %	40 %	40 %	162418166
39	NC_010159	AACAA	2	10	78193	78202	80 %	0 %	0 %	20 %	162419011
40	NC_010159	GTTCG	2	10	82810	82819	0 %	40 %	40 %	20 %	162421422
41	NC_010159	AAGGT	2	10	83159	83168	40 %	20 %	40 %	0 %	162421422
42	NC_010159	AGCGC	2	10	83559	83568	20 %	0 %	40 %	40 %	162421756
43	NC_010159	TCAAA	2	10	84197	84206	60 %	20 %	0 %	20 %	162421756
44	NC_010159	CCAAA	2	10	94465	94474	60 %	0 %	0 %	40 %	162420835
45	NC_010159	AATGC	2	10	95140	95149	40 %	20 %	20 %	20 %	162420835
46	NC_010159	AACAA	2	10	95287	95296	80 %	0 %	0 %	20 %	162420835
47	NC_010159	ACGCC	2	10	97279	97288	20 %	0 %	20 %	60 %	162419827
48	NC_010159	ACGCG	2	10	98231	98240	20 %	0 %	40 %	40 %	162419827
49	NC_010159	TCAAA	2	10	99918	99927	60 %	20 %	0 %	20 %	162420311
50	NC_010159	TTTCT	2	10	100092	100101	0 %	80 %	0 %	20 %	162420311
51	NC_010159	TTGGC	2	10	102624	102633	0 %	40 %	40 %	20 %	162421185
52	NC_010159	TTCAC	2	10	103766	103775	20 %	40 %	0 %	40 %	162418727
53	NC_010159	GTTTT	2	10	107617	107626	0 %	80 %	20 %	0 %	162419349
54	NC_010159	GCAAT	2	10	108014	108023	40 %	20 %	20 %	20 %	162419349
55	NC_010159	GCAAG	2	10	108339	108348	40 %	0 %	40 %	20 %	162419349
56	NC_010159	TAAAT	2	10	109564	109573	60 %	40 %	0 %	0 %	162419349
57	NC_010159	TTTAT	2	10	111766	111775	20 %	80 %	0 %	0 %	162420207
58	NC_010159	AATGC	2	10	112353	112362	40 %	20 %	20 %	20 %	162421432
59	NC_010159	GATAA	2	10	112815	112824	60 %	20 %	20 %	0 %	162418907
60	NC_010159	TGTCA	2	10	119927	119936	20 %	40 %	20 %	20 %	162421601
61	NC_010159	ATCAC	2	10	121218	121227	40 %	20 %	0 %	40 %	162420661
62	NC_010159	CGTTT	2	10	122686	122695	0 %	60 %	20 %	20 %	162421065
63	NC_010159	ATATT	2	10	123911	123920	40 %	60 %	0 %	0 %	162420223
64	NC_010159	CATCT	2	10	126904	126913	20 %	40 %	0 %	40 %	162420666
65	NC_010159	GGCTT	2	10	127683	127692	0 %	40 %	40 %	20 %	162420811
66	NC_010159	TTTGA	2	10	135650	135659	20 %	60 %	20 %	0 %	162420999
67	NC_010159	GCGCT	2	10	136288	136297	0 %	20 %	40 %	40 %	162420999
68	NC_010159	ACCTT	2	10	136688	136697	20 %	40 %	0 %	40 %	162419384
69	NC_010159	CGAAC	2	10	137037	137046	40 %	0 %	20 %	40 %	162419384
70	NC_010159	GCAAA	2	10	138443	138452	60 %	0 %	20 %	20 %	162421828
71	NC_010159	TGGTT	2	10	138938	138947	0 %	60 %	40 %	0 %	162421044
72	NC_010159	CCGCC	2	10	140654	140663	0 %	0 %	20 %	80 %	162418314
73	NC_010159	TTTGG	2	10	140998	141007	0 %	60 %	40 %	0 %	162419754
74	NC_010159	TGCGC	2	10	141504	141513	0 %	20 %	40 %	40 %	162419754
75	NC_010159	TAAAG	2	10	146760	146769	60 %	20 %	20 %	0 %	162418635
76	NC_010159	ATTTC	2	10	146838	146847	20 %	60 %	0 %	20 %	162418635
77	NC_010159	TTATT	2	10	147235	147244	20 %	80 %	0 %	0 %	162418635
78	NC_010159	TAACT	2	10	148064	148073	40 %	40 %	0 %	20 %	162418635
79	NC_010159	TTTAG	2	10	150039	150048	20 %	60 %	20 %	0 %	162418635
80	NC_010159	TTTAT	2	10	150567	150576	20 %	80 %	0 %	0 %	162418635
81	NC_010159	TGAAT	2	10	150698	150707	40 %	40 %	20 %	0 %	162418635
82	NC_010159	CTAAT	2	10	150874	150883	40 %	40 %	0 %	20 %	162418635
83	NC_010159	AGTTC	2	10	153030	153039	20 %	40 %	20 %	20 %	162418635
84	NC_010159	ACAAA	2	10	159472	159481	80 %	0 %	0 %	20 %	162419798
85	NC_010159	CGTAT	2	10	160462	160471	20 %	40 %	20 %	20 %	162419380
86	NC_010159	AGCCA	2	10	161146	161155	40 %	0 %	20 %	40 %	162419380
87	NC_010159	GCAAA	2	10	161226	161235	60 %	0 %	20 %	20 %	162419380
88	NC_010159	AATAA	2	10	161453	161462	80 %	20 %	0 %	0 %	162419380
89	NC_010159	TCTCC	2	10	165970	165979	0 %	40 %	0 %	60 %	162420650
90	NC_010159	CCCCA	2	10	167872	167881	20 %	0 %	0 %	80 %	162421702
91	NC_010159	TCAGT	2	10	171723	171732	20 %	40 %	20 %	20 %	162421875
92	NC_010159	TCAGT	2	10	176826	176835	20 %	40 %	20 %	20 %	162420092
93	NC_010159	AGGTC	2	10	178158	178167	20 %	20 %	40 %	20 %	162420092
94	NC_010159	CCCAG	2	10	178721	178730	20 %	0 %	20 %	60 %	162419253
95	NC_010159	GTGCA	2	10	178891	178900	20 %	20 %	40 %	20 %	162419253
96	NC_010159	GCGCG	2	10	179855	179864	0 %	0 %	60 %	40 %	162419253
97	NC_010159	AGCAA	2	10	191614	191623	60 %	0 %	20 %	20 %	162419238
98	NC_010159	ATCGT	2	10	194073	194082	20 %	40 %	20 %	20 %	162421668
99	NC_010159	TTCAG	2	10	194148	194157	20 %	40 %	20 %	20 %	162421668
100	NC_010159	ATGAC	2	10	198022	198031	40 %	20 %	20 %	20 %	162418931
101	NC_010159	ACATT	2	10	198139	198148	40 %	40 %	0 %	20 %	162418931
102	NC_010159	CAAGC	2	10	199465	199474	40 %	0 %	20 %	40 %	162420697
103	NC_010159	TTGCC	2	10	202455	202464	0 %	40 %	20 %	40 %	162421373
104	NC_010159	GGCGC	2	10	202986	202995	0 %	0 %	60 %	40 %	162421373
105	NC_010159	CGCTG	2	10	203411	203420	0 %	20 %	40 %	40 %	162418645
106	NC_010159	TCGAT	2	10	206695	206704	20 %	40 %	20 %	20 %	162419214
107	NC_010159	CAGCG	2	10	207179	207188	20 %	0 %	40 %	40 %	162419214
108	NC_010159	GCTGG	2	10	207962	207971	0 %	20 %	60 %	20 %	162419214
109	NC_010159	TAATG	2	10	209259	209268	40 %	40 %	20 %	0 %	162419296
110	NC_010159	CCCAT	2	10	210094	210103	20 %	20 %	0 %	60 %	162419296
111	NC_010159	TCCAG	2	10	211672	211681	20 %	20 %	20 %	40 %	162421460
112	NC_010159	AATTC	2	10	223838	223847	40 %	40 %	0 %	20 %	162418505
113	NC_010159	AGCCA	2	10	224037	224046	40 %	0 %	20 %	40 %	162418505
114	NC_010159	TCATC	2	10	224668	224677	20 %	40 %	0 %	40 %	162419339
115	NC_010159	AGCCA	2	10	225518	225527	40 %	0 %	20 %	40 %	162419339
116	NC_010159	TCATC	2	10	226380	226389	20 %	40 %	0 %	40 %	162420866
117	NC_010159	AGTTC	2	10	227028	227037	20 %	40 %	20 %	20 %	162420866
118	NC_010159	AGCCA	2	10	227227	227236	40 %	0 %	20 %	40 %	162420866
119	NC_010159	TCATC	2	10	228135	228144	20 %	40 %	0 %	40 %	162421569
120	NC_010159	AAATG	2	10	230889	230898	60 %	20 %	20 %	0 %	162418690
121	NC_010159	AATTC	2	10	233104	233113	40 %	40 %	0 %	20 %	162418771
122	NC_010159	TGCTG	2	10	236724	236733	0 %	40 %	40 %	20 %	162420326
123	NC_010159	GGTGT	2	10	237742	237751	0 %	40 %	60 %	0 %	162421910
124	NC_010159	CTCCC	2	10	240600	240609	0 %	20 %	0 %	80 %	162420922
125	NC_010159	ATGGC	2	10	244694	244703	20 %	20 %	40 %	20 %	162419059
126	NC_010159	GTCTG	2	10	245931	245940	0 %	40 %	40 %	20 %	162420954
127	NC_010159	CATCT	2	10	246342	246351	20 %	40 %	0 %	40 %	162420429
128	NC_010159	GCCAG	2	10	249443	249452	20 %	0 %	40 %	40 %	162421320
129	NC_010159	ACCTG	2	10	254138	254147	20 %	20 %	20 %	40 %	162420905
130	NC_010159	AACCC	2	10	254577	254586	40 %	0 %	0 %	60 %	162420905
131	NC_010159	TACCA	2	10	254739	254748	40 %	20 %	0 %	40 %	162420905
132	NC_010159	TCTGT	2	10	256914	256923	0 %	60 %	20 %	20 %	162419744
133	NC_010159	CCGTA	2	10	259862	259871	20 %	20 %	20 %	40 %	162418262
134	NC_010159	TCAGC	2	10	262230	262239	20 %	20 %	20 %	40 %	162419097
135	NC_010159	GTAAT	2	10	262319	262328	40 %	40 %	20 %	0 %	162419097
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138	NC_010159	GTTCA	2	10	263985	263994	20 %	40 %	20 %	20 %	162419743
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141	NC_010159	TTAAA	2	10	269142	269151	60 %	40 %	0 %	0 %	162419424
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147	NC_010159	ATTGG	2	10	277024	277033	20 %	40 %	40 %	0 %	162419546
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245	NC_010159	CGGTA	2	10	498913	498922	20 %	20 %	40 %	20 %	162421718
246	NC_010159	CACTT	2	10	499422	499431	20 %	40 %	0 %	40 %	162420557
247	NC_010159	GGTCT	2	10	500334	500343	0 %	40 %	40 %	20 %	162421288
248	NC_010159	CGGGG	2	10	501361	501370	0 %	0 %	80 %	20 %	162421164
249	NC_010159	CTGCC	2	10	505414	505423	0 %	20 %	20 %	60 %	162421115
250	NC_010159	TTGGT	2	10	507566	507575	0 %	60 %	40 %	0 %	162418410
251	NC_010159	CCATT	2	10	511287	511296	20 %	40 %	0 %	40 %	162419530
252	NC_010159	TACAG	2	10	511840	511849	40 %	20 %	20 %	20 %	162419530
253	NC_010159	CGCAC	2	10	513154	513163	20 %	0 %	20 %	60 %	162421378
254	NC_010159	ATGAA	2	10	515191	515200	60 %	20 %	20 %	0 %	162419509
255	NC_010159	AGCAG	2	10	516215	516224	40 %	0 %	40 %	20 %	162420371
256	NC_010159	CTGGA	2	10	517107	517116	20 %	20 %	40 %	20 %	162420371
257	NC_010159	ATTTA	2	10	518389	518398	40 %	60 %	0 %	0 %	162418686
258	NC_010159	TGCCT	2	10	519375	519384	0 %	40 %	20 %	40 %	162419569
259	NC_010159	ATTAT	2	10	519907	519916	40 %	60 %	0 %	0 %	162419148
260	NC_010159	ATACC	2	10	520064	520073	40 %	20 %	0 %	40 %	162419148
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262	NC_010159	TATTT	2	10	526129	526138	20 %	80 %	0 %	0 %	162420475
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388	NC_010159	TCGTA	2	10	795482	795491	20 %	40 %	20 %	20 %	162418950
389	NC_010159	CATCG	2	10	797889	797898	20 %	20 %	20 %	40 %	162418950
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