MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010159	TGT	2	6	263519	263524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419743
4002	NC_010159	GCT	2	6	263547	263552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419743
4003	NC_010159	AAT	2	6	263573	263578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419743
4004	NC_010159	GTT	2	6	263589	263594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419743
4005	NC_010159	TTG	2	6	263631	263636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419743
4006	NC_010159	CAT	3	9	263672	263680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419743
4007	NC_010159	GA	3	6	263733	263738	50 %	0 %	50 %	0 %	162419743
4008	NC_010159	AAT	2	6	263798	263803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419743
4009	NC_010159	TTG	2	6	263881	263886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419743
4010	NC_010159	A	7	7	263952	263958	100 %	0 %	0 %	0 %	162419743
4011	NC_010159	GTTCA	2	10	263985	263994	20 %	40 %	20 %	20 %	162419743
4012	NC_010159	TTGG	2	8	264045	264052	0 %	50 %	50 %	0 %	162419743
4013	NC_010159	CCAACC	2	12	264118	264129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419743
4014	NC_010159	C	6	6	264191	264196	0 %	0 %	0 %	100 %	162419743
4015	NC_010159	CTC	2	6	264351	264356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419743
4016	NC_010159	GCC	2	6	264371	264376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419743
4017	NC_010159	CTG	2	6	264450	264455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419743
4018	NC_010159	TGT	2	6	264701	264706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419743
4019	NC_010159	CT	3	6	264799	264804	0 %	50 %	0 %	50 %	162419743
4020	NC_010159	TCCA	2	8	264904	264911	25 %	25 %	0 %	50 %	162419743
4021	NC_010159	GCA	2	6	265025	265030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419743
4022	NC_010159	CCA	2	6	265055	265060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419743
4023	NC_010159	TCA	3	9	265096	265104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419743
4024	NC_010159	ATT	2	6	265143	265148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419743
4025	NC_010159	ACTG	2	8	265266	265273	25 %	25 %	25 %	25 %	162419743
4026	NC_010159	ATG	2	6	265292	265297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419743
4027	NC_010159	T	7	7	265316	265322	0 %	100 %	0 %	0 %	162419743
4028	NC_010159	ATT	2	6	265324	265329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419743
4029	NC_010159	TTAC	2	8	265687	265694	25 %	50 %	0 %	25 %	162421105
4030	NC_010159	CA	3	6	265969	265974	50 %	0 %	0 %	50 %	162421105
4031	NC_010159	TTG	2	6	266166	266171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421105
4032	NC_010159	TAT	3	9	266503	266511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421658
4033	NC_010159	TCG	2	6	266517	266522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421658
4034	NC_010159	TAT	2	6	266539	266544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421658
4035	NC_010159	GCG	3	9	266565	266573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421658
4036	NC_010159	CTG	2	6	266597	266602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421658
4037	NC_010159	ATC	2	6	266633	266638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421658
4038	NC_010159	GTT	2	6	266660	266665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421658
4039	NC_010159	TGG	3	9	266667	266675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421658
4040	NC_010159	ATC	2	6	266749	266754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421658
4041	NC_010159	TAT	2	6	266838	266843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421130
4042	NC_010159	TTG	2	6	266856	266861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421130
4043	NC_010159	GAAAA	2	10	266929	266938	80 %	0 %	20 %	0 %	162421130
4044	NC_010159	GA	3	6	266939	266944	50 %	0 %	50 %	0 %	162421130
4045	NC_010159	CCG	2	6	266979	266984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421130
4046	NC_010159	AGA	2	6	267001	267006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421130
4047	NC_010159	A	6	6	267142	267147	100 %	0 %	0 %	0 %	162421130
4048	NC_010159	AT	3	6	267150	267155	50 %	50 %	0 %	0 %	162421130
4049	NC_010159	TAT	2	6	267169	267174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421130
4050	NC_010159	A	7	7	267264	267270	100 %	0 %	0 %	0 %	162421130
4051	NC_010159	CTA	2	6	267278	267283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421130
4052	NC_010159	CTTT	2	8	267304	267311	0 %	75 %	0 %	25 %	162421130
4053	NC_010159	CAAA	2	8	267394	267401	75 %	0 %	0 %	25 %	162421130
4054	NC_010159	TAA	2	6	267418	267423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421130
4055	NC_010159	GAG	2	6	267470	267475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162421130
4056	NC_010159	A	6	6	267484	267489	100 %	0 %	0 %	0 %	162421130
4057	NC_010159	CAA	2	6	267490	267495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421130
4058	NC_010159	ATA	2	6	267498	267503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421130
4059	NC_010159	AG	3	6	267668	267673	50 %	0 %	50 %	0 %	162421130
4060	NC_010159	AAATG	2	10	268995	269004	60 %	20 %	20 %	0 %	162419424
4061	NC_010159	TCA	2	6	269010	269015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419424
4062	NC_010159	CTA	2	6	269034	269039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419424
4063	NC_010159	TTAAA	2	10	269142	269151	60 %	40 %	0 %	0 %	162419424
4064	NC_010159	ATG	2	6	269214	269219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419424
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4066	NC_010159	A	6	6	269331	269336	100 %	0 %	0 %	0 %	162419965
4067	NC_010159	ATA	2	6	269338	269343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419965
4068	NC_010159	TGT	2	6	269357	269362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419965
4069	NC_010159	A	6	6	269426	269431	100 %	0 %	0 %	0 %	162419965
4070	NC_010159	GAT	3	9	269445	269453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419965
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4075	NC_010159	GGGA	2	8	269753	269760	25 %	0 %	75 %	0 %	162419965
4076	NC_010159	A	7	7	269810	269816	100 %	0 %	0 %	0 %	162419965
4077	NC_010159	TTA	2	6	269829	269834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419965
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4079	NC_010159	GAAA	2	8	269937	269944	75 %	0 %	25 %	0 %	162419965
4080	NC_010159	A	6	6	269973	269978	100 %	0 %	0 %	0 %	162419965
4081	NC_010159	TAT	2	6	269987	269992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419965
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4083	NC_010159	A	6	6	270025	270030	100 %	0 %	0 %	0 %	162419965
4084	NC_010159	CAT	2	6	270059	270064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419965
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4088	NC_010159	GAC	2	6	270209	270214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419965
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4095	NC_010159	TAAA	2	8	270419	270426	75 %	25 %	0 %	0 %	162419965
4096	NC_010159	TTA	2	6	270432	270437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418353
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4099	NC_010159	CT	3	6	270548	270553	0 %	50 %	0 %	50 %	162418353
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4105	NC_010159	CGG	2	6	270758	270763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418353
4106	NC_010159	TAA	2	6	270769	270774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418353
4107	NC_010159	ACTCA	2	10	270776	270785	40 %	20 %	0 %	40 %	162418353
4108	NC_010159	TGA	2	6	270829	270834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418353
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4114	NC_010159	AT	3	6	271096	271101	50 %	50 %	0 %	0 %	162418353
4115	NC_010159	AGA	2	6	271105	271110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418353
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4121	NC_010159	ATGA	2	8	271484	271491	50 %	25 %	25 %	0 %	162418353
4122	NC_010159	TGT	2	6	271546	271551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418353
4123	NC_010159	AT	3	6	271560	271565	50 %	50 %	0 %	0 %	162418353
4124	NC_010159	TGA	2	6	271591	271596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418353
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4193	NC_010159	TTAA	2	8	273733	273740	50 %	50 %	0 %	0 %	162421194
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4231	NC_010159	AG	3	6	275384	275389	50 %	0 %	50 %	0 %	162419964
4232	NC_010159	CT	3	6	275395	275400	0 %	50 %	0 %	50 %	162419964
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4237	NC_010159	AAAC	2	8	275635	275642	75 %	0 %	0 %	25 %	162419964
4238	NC_010159	GCC	2	6	275677	275682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419964
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4241	NC_010159	ATC	2	6	275922	275927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419964
4242	NC_010159	A	7	7	275956	275962	100 %	0 %	0 %	0 %	162419964
4243	NC_010159	GATA	2	8	276042	276049	50 %	25 %	25 %	0 %	162419964
4244	NC_010159	A	8	8	276107	276114	100 %	0 %	0 %	0 %	162419964
4245	NC_010159	CTA	2	6	276134	276139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419964
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4247	NC_010159	TGA	2	6	276473	276478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419964
4248	NC_010159	TGA	2	6	276495	276500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419964
4249	NC_010159	A	6	6	276509	276514	100 %	0 %	0 %	0 %	162419964
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4253	NC_010159	CGAG	2	8	276732	276739	25 %	0 %	50 %	25 %	162419964
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4260	NC_010159	ATTGG	2	10	277024	277033	20 %	40 %	40 %	0 %	162419546
4261	NC_010159	CTGG	2	8	277074	277081	0 %	25 %	50 %	25 %	162419546
4262	NC_010159	CGGCG	2	10	277198	277207	0 %	0 %	60 %	40 %	162419546
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4369	NC_010159	CTG	2	6	286594	286599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421843
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4489	NC_010159	GGT	2	6	293231	293236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420269
4490	NC_010159	TCT	2	6	293337	293342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420269
4491	NC_010159	CGG	2	6	293390	293395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420269
4492	NC_010159	CGTAA	2	10	293518	293527	40 %	20 %	20 %	20 %	162420269
4493	NC_010159	TCA	2	6	293604	293609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420269
4494	NC_010159	GAG	2	6	293610	293615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162420269
4495	NC_010159	CCG	2	6	293694	293699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420269
4496	NC_010159	CCA	2	6	293713	293718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420269
4497	NC_010159	T	6	6	293795	293800	0 %	100 %	0 %	0 %	162420269
4498	NC_010159	CAC	2	6	293804	293809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420269
4499	NC_010159	T	7	7	293810	293816	0 %	100 %	0 %	0 %	162420269
4500	NC_010159	ACG	2	6	293828	293833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420269

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