MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010159	GA	3	6	234492	234497	50 %	0 %	50 %	0 %	162420194
3502	NC_010159	ATT	2	6	234507	234512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420194
3503	NC_010159	CAC	2	6	234627	234632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420194
3504	NC_010159	TTG	2	6	234636	234641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420194
3505	NC_010159	C	6	6	234691	234696	0 %	0 %	0 %	100 %	162420194
3506	NC_010159	TG	3	6	234796	234801	0 %	50 %	50 %	0 %	162420194
3507	NC_010159	TAA	2	6	234827	234832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420194
3508	NC_010159	CTG	2	6	234967	234972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419856
3509	NC_010159	CAA	2	6	234976	234981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419856
3510	NC_010159	CTG	2	6	234995	235000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419856
3511	NC_010159	CAT	2	6	235048	235053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419856
3512	NC_010159	TGT	2	6	235058	235063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419856
3513	NC_010159	TCA	2	6	235079	235084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419856
3514	NC_010159	CGG	2	6	235086	235091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419856
3515	NC_010159	CGG	2	6	235101	235106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419856
3516	NC_010159	GAT	2	6	235220	235225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419856
3517	NC_010159	TTA	2	6	235226	235231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419856
3518	NC_010159	ATG	2	6	235316	235321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420855
3519	NC_010159	TCA	2	6	235322	235327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420855
3520	NC_010159	GGCA	2	8	235381	235388	25 %	0 %	50 %	25 %	162420855
3521	NC_010159	CCG	3	9	235527	235535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420855
3522	NC_010159	CAC	2	6	235561	235566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420855
3523	NC_010159	ACC	2	6	235589	235594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420855
3524	NC_010159	GTG	2	6	235596	235601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420855
3525	NC_010159	CG	3	6	235653	235658	0 %	0 %	50 %	50 %	162420855
3526	NC_010159	TTG	2	6	235754	235759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420855
3527	NC_010159	CAC	2	6	235792	235797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420855
3528	NC_010159	GTT	2	6	235801	235806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420855
3529	NC_010159	ACC	2	6	235925	235930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420855
3530	NC_010159	GCC	2	6	235996	236001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420855
3531	NC_010159	GGA	2	6	236026	236031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162420855
3532	NC_010159	CGG	2	6	236068	236073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420855
3533	NC_010159	CGG	2	6	236094	236099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420855
3534	NC_010159	T	6	6	236105	236110	0 %	100 %	0 %	0 %	162420855
3535	NC_010159	GCA	2	6	236154	236159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420855
3536	NC_010159	ATTG	2	8	236168	236175	25 %	50 %	25 %	0 %	162420855
3537	NC_010159	CAC	2	6	236221	236226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420855
3538	NC_010159	GTTG	2	8	236244	236251	0 %	50 %	50 %	0 %	162420855
3539	NC_010159	CCA	2	6	236271	236276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420855
3540	NC_010159	GC	3	6	236292	236297	0 %	0 %	50 %	50 %	162420855
3541	NC_010159	A	7	7	236385	236391	100 %	0 %	0 %	0 %	162420855
3542	NC_010159	GAA	2	6	236468	236473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420326
3543	NC_010159	AACC	2	8	236481	236488	50 %	0 %	0 %	50 %	162420326
3544	NC_010159	CAC	2	6	236512	236517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420326
3545	NC_010159	GAA	2	6	236556	236561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420326
3546	NC_010159	CAT	2	6	236581	236586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420326
3547	NC_010159	AT	3	6	236613	236618	50 %	50 %	0 %	0 %	162420326
3548	NC_010159	GCA	2	6	236713	236718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420326
3549	NC_010159	TGCTG	2	10	236724	236733	0 %	40 %	40 %	20 %	162420326
3550	NC_010159	GCC	2	6	236774	236779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420326
3551	NC_010159	T	6	6	236792	236797	0 %	100 %	0 %	0 %	162420326
3552	NC_010159	TGCT	2	8	236859	236866	0 %	50 %	25 %	25 %	162420326
3553	NC_010159	C	6	6	236966	236971	0 %	0 %	0 %	100 %	162420326
3554	NC_010159	CAT	2	6	237025	237030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420326
3555	NC_010159	CA	3	6	237064	237069	50 %	0 %	0 %	50 %	162420326
3556	NC_010159	CGG	2	6	237179	237184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421910
3557	NC_010159	CAC	2	6	237332	237337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421910
3558	NC_010159	GCC	2	6	237363	237368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421910
3559	NC_010159	TAA	2	6	237392	237397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421910
3560	NC_010159	GTT	2	6	237485	237490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421910
3561	NC_010159	GTAG	2	8	237499	237506	25 %	25 %	50 %	0 %	162421910
3562	NC_010159	CCG	2	6	237598	237603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421910
3563	NC_010159	CCG	2	6	237605	237610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421910
3564	NC_010159	GGTGT	2	10	237742	237751	0 %	40 %	60 %	0 %	162421910
3565	NC_010159	ACC	2	6	237811	237816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421910
3566	NC_010159	GCC	2	6	237889	237894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421910
3567	NC_010159	CGCCAT	2	12	237986	237997	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	162421354
3568	NC_010159	ATC	2	6	238010	238015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421354
3569	NC_010159	TCA	2	6	238050	238055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421354
3570	NC_010159	GGC	2	6	238077	238082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421354
3571	NC_010159	TGC	2	6	238125	238130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421354
3572	NC_010159	CAC	2	6	238147	238152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421354
3573	NC_010159	TCA	2	6	238163	238168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421354
3574	NC_010159	GCC	2	6	238172	238177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421354
3575	NC_010159	GTT	2	6	238207	238212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421354
3576	NC_010159	T	6	6	238211	238216	0 %	100 %	0 %	0 %	162421354
3577	NC_010159	CCA	2	6	238239	238244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421354
3578	NC_010159	TCT	2	6	238262	238267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421354
3579	NC_010159	C	7	7	238279	238285	0 %	0 %	0 %	100 %	162421354
3580	NC_010159	GAT	2	6	238294	238299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421354
3581	NC_010159	TCA	2	6	238313	238318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421354
3582	NC_010159	GGC	2	6	238340	238345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421354
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3584	NC_010159	CCA	2	6	238448	238453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421354
3585	NC_010159	GCT	2	6	238570	238575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421354
3586	NC_010159	ACC	2	6	238579	238584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421354
3587	NC_010159	GGTGGC	2	12	238597	238608	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	162421354
3588	NC_010159	ATT	2	6	238654	238659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421354
3589	NC_010159	TGT	3	9	238670	238678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421354
3590	NC_010159	CGG	2	6	238704	238709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421354
3591	NC_010159	TCA	2	6	238751	238756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421081
3592	NC_010159	TGA	2	6	238772	238777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421081
3593	NC_010159	TCA	2	6	238811	238816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421081
3594	NC_010159	CAA	2	6	238905	238910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421081
3595	NC_010159	CGC	2	6	238911	238916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421081
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3597	NC_010159	GTG	2	6	239137	239142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421081
3598	NC_010159	CAG	2	6	239171	239176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421081
3599	NC_010159	GAG	2	6	239291	239296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162421081
3600	NC_010159	CACT	2	8	239332	239339	25 %	25 %	0 %	50 %	162421081
3601	NC_010159	AGG	2	6	239355	239360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162421081
3602	NC_010159	CGT	2	6	239427	239432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421081
3603	NC_010159	CTGA	2	8	239473	239480	25 %	25 %	25 %	25 %	162421081
3604	NC_010159	TGA	2	6	239573	239578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421081
3605	NC_010159	GCA	2	6	239599	239604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421081
3606	NC_010159	CCG	2	6	239606	239611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421081
3607	NC_010159	CG	3	6	239679	239684	0 %	0 %	50 %	50 %	162421081
3608	NC_010159	CAC	2	6	239715	239720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421081
3609	NC_010159	CCG	2	6	239731	239736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421081
3610	NC_010159	T	6	6	239765	239770	0 %	100 %	0 %	0 %	162421081
3611	NC_010159	CGC	2	6	239804	239809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421081
3612	NC_010159	CATA	2	8	239840	239847	50 %	25 %	0 %	25 %	162421081
3613	NC_010159	TG	3	6	240037	240042	0 %	50 %	50 %	0 %	162420922
3614	NC_010159	CAC	2	6	240092	240097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420922
3615	NC_010159	GTT	2	6	240117	240122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420922
3616	NC_010159	TGCC	2	8	240128	240135	0 %	25 %	25 %	50 %	162420922
3617	NC_010159	TTC	2	6	240153	240158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420922
3618	NC_010159	CCACTG	2	12	240160	240171	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	162420922
3619	NC_010159	GTT	2	6	240248	240253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420922
3620	NC_010159	AAC	2	6	240304	240309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420922
3621	NC_010159	GTT	2	6	240320	240325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420922
3622	NC_010159	TGC	2	6	240391	240396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420922
3623	NC_010159	CCAA	2	8	240397	240404	50 %	0 %	0 %	50 %	162420922
3624	NC_010159	AGC	2	6	240457	240462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420922
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3626	NC_010159	CTCCC	2	10	240600	240609	0 %	20 %	0 %	80 %	162420922
3627	NC_010159	GATT	2	8	240634	240641	25 %	50 %	25 %	0 %	162420922
3628	NC_010159	AC	3	6	240703	240708	50 %	0 %	0 %	50 %	162418952
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3630	NC_010159	CAT	2	6	240773	240778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418952
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3653	NC_010159	A	7	7	242345	242351	100 %	0 %	0 %	0 %	162419782
3654	NC_010159	A	6	6	242379	242384	100 %	0 %	0 %	0 %	162419782
3655	NC_010159	CAG	2	6	242388	242393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419782
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3737	NC_010159	TCA	2	6	246733	246738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420429
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3741	NC_010159	CCT	2	6	246935	246940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162420429
3742	NC_010159	TTG	2	6	246951	246956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420429
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3744	NC_010159	CTT	2	6	246974	246979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420429
3745	NC_010159	TAA	2	6	246993	246998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420429
3746	NC_010159	TCA	2	6	247054	247059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420429
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3749	NC_010159	TCG	2	6	247196	247201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418149
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3859	NC_010159	GTT	2	6	254075	254080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420905
3860	NC_010159	CGG	2	6	254105	254110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420905
3861	NC_010159	ACCTG	2	10	254138	254147	20 %	20 %	20 %	40 %	162420905
3862	NC_010159	GCA	2	6	254230	254235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420905
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3986	NC_010159	CAC	2	6	262934	262939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419743
3987	NC_010159	CTCCA	2	10	262968	262977	20 %	20 %	0 %	60 %	162419743
3988	NC_010159	GTAA	2	8	262983	262990	50 %	25 %	25 %	0 %	162419743
3989	NC_010159	TGA	2	6	263033	263038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419743
3990	NC_010159	TCA	2	6	263105	263110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419743
3991	NC_010159	CAT	2	6	263180	263185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419743
3992	NC_010159	TGAT	2	8	263194	263201	25 %	50 %	25 %	0 %	162419743
3993	NC_010159	GTA	2	6	263223	263228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419743
3994	NC_010159	ATT	2	6	263238	263243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419743
3995	NC_010159	CAGCA	2	10	263244	263253	40 %	0 %	20 %	40 %	162419743
3996	NC_010159	ATC	2	6	263307	263312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419743
3997	NC_010159	GCC	2	6	263334	263339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419743
3998	NC_010159	ATC	2	6	263421	263426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419743
3999	NC_010159	TGC	3	9	263462	263470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419743
4000	NC_010159	CG	3	6	263498	263503	0 %	0 %	50 %	50 %	162419743

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