MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010159	GCG	2	6	102179	102184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421185
1502	NC_010159	GCA	2	6	102264	102269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421185
1503	NC_010159	CCA	2	6	102291	102296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421185
1504	NC_010159	GCA	2	6	102348	102353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421185
1505	NC_010159	TGC	2	6	102393	102398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421185
1506	NC_010159	GCG	2	6	102402	102407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421185
1507	NC_010159	ATG	2	6	102408	102413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421185
1508	NC_010159	CAGC	2	8	102454	102461	25 %	0 %	25 %	50 %	162421185
1509	NC_010159	ACC	2	6	102546	102551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421185
1510	NC_010159	TTGGC	2	10	102624	102633	0 %	40 %	40 %	20 %	162421185
1511	NC_010159	TCG	2	6	102735	102740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421185
1512	NC_010159	TTGA	2	8	102782	102789	25 %	50 %	25 %	0 %	162421185
1513	NC_010159	ATG	2	6	102792	102797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421185
1514	NC_010159	GCA	2	6	102813	102818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421185
1515	NC_010159	GCA	2	6	102825	102830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421185
1516	NC_010159	GCG	2	6	102870	102875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421185
1517	NC_010159	TCG	2	6	103160	103165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418727
1518	NC_010159	T	6	6	103198	103203	0 %	100 %	0 %	0 %	162418727
1519	NC_010159	TGCT	2	8	103266	103273	0 %	50 %	25 %	25 %	162418727
1520	NC_010159	GCA	2	6	103331	103336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418727
1521	NC_010159	TTA	2	6	103415	103420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418727
1522	NC_010159	CAC	2	6	103575	103580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418727
1523	NC_010159	AC	3	6	103635	103640	50 %	0 %	0 %	50 %	162418727
1524	NC_010159	TCA	2	6	103706	103711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418727
1525	NC_010159	CAC	2	6	103731	103736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418727
1526	NC_010159	AATA	2	8	103738	103745	75 %	25 %	0 %	0 %	162418727
1527	NC_010159	TTCAC	2	10	103766	103775	20 %	40 %	0 %	40 %	162418727
1528	NC_010159	TGG	2	6	103794	103799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418727
1529	NC_010159	CTT	2	6	103827	103832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418727
1530	NC_010159	TCA	2	6	103842	103847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418727
1531	NC_010159	T	6	6	103874	103879	0 %	100 %	0 %	0 %	162418727
1532	NC_010159	GGA	2	6	103999	104004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162418727
1533	NC_010159	GTC	2	6	104059	104064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418727
1534	NC_010159	CAT	2	6	104089	104094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418727
1535	NC_010159	CCAG	2	8	104154	104161	25 %	0 %	25 %	50 %	162418727
1536	NC_010159	GC	3	6	104198	104203	0 %	0 %	50 %	50 %	162418727
1537	NC_010159	ACC	2	6	104267	104272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418727
1538	NC_010159	CTT	2	6	104307	104312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418727
1539	NC_010159	T	6	6	104311	104316	0 %	100 %	0 %	0 %	162418727
1540	NC_010159	CGG	2	6	104342	104347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418727
1541	NC_010159	TCA	2	6	104444	104449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418727
1542	NC_010159	CAGC	2	8	104531	104538	25 %	0 %	25 %	50 %	162418727
1543	NC_010159	TAC	2	6	104602	104607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418727
1544	NC_010159	T	8	8	104650	104657	0 %	100 %	0 %	0 %	162418727
1545	NC_010159	AGT	2	6	104659	104664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418727
1546	NC_010159	ATA	2	6	104678	104683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418727
1547	NC_010159	TTC	2	6	104889	104894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418263
1548	NC_010159	AC	3	6	104907	104912	50 %	0 %	0 %	50 %	162418263
1549	NC_010159	GGC	2	6	104927	104932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418263
1550	NC_010159	CAA	2	6	104961	104966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418263
1551	NC_010159	CGA	2	6	104972	104977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418263
1552	NC_010159	CCA	2	6	105019	105024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418263
1553	NC_010159	G	6	6	105158	105163	0 %	0 %	100 %	0 %	162418263
1554	NC_010159	CAT	2	6	105191	105196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418263
1555	NC_010159	CAGT	2	8	105197	105204	25 %	25 %	25 %	25 %	162418263
1556	NC_010159	AGA	2	6	105293	105298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418263
1557	NC_010159	TGC	2	6	105323	105328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418263
1558	NC_010159	CGA	2	6	105359	105364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418263
1559	NC_010159	CGC	2	6	105393	105398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418263
1560	NC_010159	GC	3	6	105503	105508	0 %	0 %	50 %	50 %	162418263
1561	NC_010159	AAAT	2	8	105526	105533	75 %	25 %	0 %	0 %	162418263
1562	NC_010159	AGC	2	6	105606	105611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418263
1563	NC_010159	A	6	6	105627	105632	100 %	0 %	0 %	0 %	162418263
1564	NC_010159	ATA	2	6	105703	105708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418263
1565	NC_010159	CAG	2	6	106371	106376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418438
1566	NC_010159	AC	3	6	106435	106440	50 %	0 %	0 %	50 %	162418438
1567	NC_010159	TGC	2	6	106460	106465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418438
1568	NC_010159	AAC	2	6	106513	106518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418438
1569	NC_010159	GAA	2	6	106560	106565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418438
1570	NC_010159	TTAC	2	8	106779	106786	25 %	50 %	0 %	25 %	162418550
1571	NC_010159	CA	3	6	107061	107066	50 %	0 %	0 %	50 %	162418550
1572	NC_010159	TTG	2	6	107258	107263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418550
1573	NC_010159	G	6	6	107439	107444	0 %	0 %	100 %	0 %	162419770
1574	NC_010159	GCCAAT	2	12	107490	107501	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	162419770
1575	NC_010159	ATC	2	6	107559	107564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419770
1576	NC_010159	TAAA	2	8	107597	107604	75 %	25 %	0 %	0 %	162419770
1577	NC_010159	GTTTT	2	10	107617	107626	0 %	80 %	20 %	0 %	162419349
1578	NC_010159	TAA	2	6	107634	107639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419349
1579	NC_010159	ATT	2	6	107713	107718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419349
1580	NC_010159	TTG	2	6	107751	107756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419349
1581	NC_010159	CAAT	2	8	107802	107809	50 %	25 %	0 %	25 %	162419349
1582	NC_010159	GCCC	2	8	107823	107830	0 %	0 %	25 %	75 %	162419349
1583	NC_010159	GCT	2	6	107931	107936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419349
1584	NC_010159	TTG	2	6	107942	107947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419349
1585	NC_010159	TGT	2	6	107964	107969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419349
1586	NC_010159	GCAAT	2	10	108014	108023	40 %	20 %	20 %	20 %	162419349
1587	NC_010159	ATT	2	6	108031	108036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419349
1588	NC_010159	CGT	2	6	108046	108051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419349
1589	NC_010159	ATCA	2	8	108064	108071	50 %	25 %	0 %	25 %	162419349
1590	NC_010159	CAG	2	6	108094	108099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419349
1591	NC_010159	TCA	2	6	108114	108119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419349
1592	NC_010159	A	6	6	108195	108200	100 %	0 %	0 %	0 %	162419349
1593	NC_010159	TTTCGG	2	12	108297	108308	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	162419349
1594	NC_010159	GCAAG	2	10	108339	108348	40 %	0 %	40 %	20 %	162419349
1595	NC_010159	GTTG	2	8	108379	108386	0 %	50 %	50 %	0 %	162419349
1596	NC_010159	CAA	2	6	108423	108428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419349
1597	NC_010159	ATCA	2	8	108451	108458	50 %	25 %	0 %	25 %	162419349
1598	NC_010159	GT	3	6	108510	108515	0 %	50 %	50 %	0 %	162419349
1599	NC_010159	CGC	2	6	108519	108524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419349
1600	NC_010159	A	6	6	108526	108531	100 %	0 %	0 %	0 %	162419349
1601	NC_010159	AGTC	2	8	108544	108551	25 %	25 %	25 %	25 %	162419349
1602	NC_010159	TGC	2	6	108607	108612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419349
1603	NC_010159	T	6	6	108680	108685	0 %	100 %	0 %	0 %	162419349
1604	NC_010159	ACC	2	6	108767	108772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419349
1605	NC_010159	CCAG	2	8	108777	108784	25 %	0 %	25 %	50 %	162419349
1606	NC_010159	CCA	2	6	108785	108790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419349
1607	NC_010159	CAT	2	6	108799	108804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419349
1608	NC_010159	ATG	2	6	108836	108841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419349
1609	NC_010159	TTG	2	6	108854	108859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419349
1610	NC_010159	GAT	2	6	108954	108959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419349
1611	NC_010159	ATA	2	6	109233	109238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419349
1612	NC_010159	T	6	6	109257	109262	0 %	100 %	0 %	0 %	162419349
1613	NC_010159	AAT	2	6	109366	109371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419349
1614	NC_010159	CAA	2	6	109392	109397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419349
1615	NC_010159	GAC	2	6	109399	109404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419349
1616	NC_010159	ATTA	2	8	109510	109517	50 %	50 %	0 %	0 %	162419349
1617	NC_010159	GAA	2	6	109541	109546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419349
1618	NC_010159	TAAAT	2	10	109564	109573	60 %	40 %	0 %	0 %	162419349
1619	NC_010159	ATCC	2	8	109582	109589	25 %	25 %	0 %	50 %	162419349
1620	NC_010159	CTG	2	6	109632	109637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419349
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1622	NC_010159	T	6	6	109691	109696	0 %	100 %	0 %	0 %	162419349
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1624	NC_010159	T	6	6	109789	109794	0 %	100 %	0 %	0 %	162420638
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1651	NC_010159	T	8	8	111746	111753	0 %	100 %	0 %	0 %	162420207
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1660	NC_010159	TG	3	6	112600	112605	0 %	50 %	50 %	0 %	162421432
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1740	NC_010159	AACA	2	8	117307	117314	75 %	0 %	0 %	25 %	162418374
1741	NC_010159	T	6	6	117373	117378	0 %	100 %	0 %	0 %	162418374
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1744	NC_010159	G	6	6	117661	117666	0 %	0 %	100 %	0 %	162420014
1745	NC_010159	TCA	2	6	117691	117696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420014
1746	NC_010159	CAT	2	6	117773	117778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420014
1747	NC_010159	G	7	7	117798	117804	0 %	0 %	100 %	0 %	162420014
1748	NC_010159	ACG	2	6	117900	117905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420014
1749	NC_010159	GCG	2	6	118021	118026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420014
1750	NC_010159	GCT	2	6	118106	118111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420014
1751	NC_010159	CTT	2	6	118112	118117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420014
1752	NC_010159	AGC	2	6	118150	118155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420014
1753	NC_010159	TAA	2	6	118187	118192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420014
1754	NC_010159	TCC	2	6	118196	118201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162420014
1755	NC_010159	TTAC	2	8	118296	118303	25 %	50 %	0 %	25 %	162421874
1756	NC_010159	CA	3	6	118578	118583	50 %	0 %	0 %	50 %	162421874
1757	NC_010159	TTG	2	6	118775	118780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421874
1758	NC_010159	GGTA	2	8	118984	118991	25 %	25 %	50 %	0 %	162419256
1759	NC_010159	TCG	2	6	119002	119007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419256
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1763	NC_010159	GTTT	2	8	119270	119277	0 %	75 %	25 %	0 %	162419256
1764	NC_010159	T	6	6	119291	119296	0 %	100 %	0 %	0 %	162419256
1765	NC_010159	CAAC	2	8	119366	119373	50 %	0 %	0 %	50 %	162419256
1766	NC_010159	AC	4	8	119480	119487	50 %	0 %	0 %	50 %	162419256
1767	NC_010159	GTT	2	6	119507	119512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419256
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1770	NC_010159	TCG	2	6	119620	119625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419256
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1772	NC_010159	T	6	6	119682	119687	0 %	100 %	0 %	0 %	162419256
1773	NC_010159	CTT	2	6	119690	119695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419256
1774	NC_010159	GCC	2	6	119915	119920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421601
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1776	NC_010159	TGT	2	6	119991	119996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421601
1777	NC_010159	GTT	2	6	120019	120024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421601
1778	NC_010159	TGG	2	6	120045	120050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421601
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1780	NC_010159	TGC	2	6	120189	120194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421601
1781	NC_010159	ATC	2	6	120369	120374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421601
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1783	NC_010159	AAC	2	6	120702	120707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421601
1784	NC_010159	CAT	2	6	120750	120755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421601
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1788	NC_010159	CAA	2	6	120988	120993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420661
1789	NC_010159	GCA	2	6	121167	121172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420661
1790	NC_010159	ATCAC	2	10	121218	121227	40 %	20 %	0 %	40 %	162420661
1791	NC_010159	CCGT	2	8	121410	121417	0 %	25 %	25 %	50 %	162420661
1792	NC_010159	TTC	2	6	121439	121444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420661
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1798	NC_010159	ATT	2	6	122036	122041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420661
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1850	NC_010159	TCAA	2	8	125473	125480	50 %	25 %	0 %	25 %	162420666
1851	NC_010159	CTG	2	6	125641	125646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420666
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1856	NC_010159	GTGCGG	2	12	126163	126174	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	162420666
1857	NC_010159	TAC	2	6	126218	126223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420666
1858	NC_010159	GCA	2	6	126236	126241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420666
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1861	NC_010159	TCAATA	2	12	126598	126609	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	162420666
1862	NC_010159	CAA	2	6	126738	126743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420666
1863	NC_010159	TACC	2	8	126791	126798	25 %	25 %	0 %	50 %	162420666
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1865	NC_010159	GGT	2	6	126861	126866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420666
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1985	NC_010159	CAT	2	6	140178	140183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418587
1986	NC_010159	TGA	2	6	140202	140207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418587
1987	NC_010159	GCT	2	6	140221	140226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418587
1988	NC_010159	TGAT	2	8	140232	140239	25 %	50 %	25 %	0 %	162418587
1989	NC_010159	TGA	2	6	140343	140348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418587
1990	NC_010159	TCAG	2	8	140355	140362	25 %	25 %	25 %	25 %	162418587
1991	NC_010159	CTG	3	9	140384	140392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418587
1992	NC_010159	G	6	6	140443	140448	0 %	0 %	100 %	0 %	162418587
1993	NC_010159	CGA	2	6	140631	140636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418314
1994	NC_010159	CCGCC	2	10	140654	140663	0 %	0 %	20 %	80 %	162418314
1995	NC_010159	GGC	2	6	140759	140764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418314
1996	NC_010159	GCA	2	6	140790	140795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418314
1997	NC_010159	GAGT	2	8	140824	140831	25 %	25 %	50 %	0 %	162418314
1998	NC_010159	A	6	6	140933	140938	100 %	0 %	0 %	0 %	162419754
1999	NC_010159	CTG	2	6	140986	140991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419754
2000	NC_010159	TTTGG	2	10	140998	141007	0 %	60 %	40 %	0 %	162419754

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