MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010159	CAT	2	6	38248	38253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419107
502	NC_010159	TTA	2	6	38333	38338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419107
503	NC_010159	ATT	2	6	38369	38374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419107
504	NC_010159	TGG	2	6	38451	38456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419107
505	NC_010159	CTGG	2	8	38497	38504	0 %	25 %	50 %	25 %	162419107
506	NC_010159	GTG	2	6	38594	38599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419107
507	NC_010159	TTA	2	6	38786	38791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419107
508	NC_010159	CAC	2	6	38854	38859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419107
509	NC_010159	TGG	2	6	39105	39110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420883
510	NC_010159	GTG	2	6	39168	39173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420883
511	NC_010159	AAG	2	6	39183	39188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420883
512	NC_010159	TTG	2	6	39210	39215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420883
513	NC_010159	GTG	2	6	39231	39236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420883
514	NC_010159	GCA	2	6	39260	39265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420883
515	NC_010159	TCTG	2	8	39437	39444	0 %	50 %	25 %	25 %	162420449
516	NC_010159	TTTGA	2	10	39462	39471	20 %	60 %	20 %	0 %	162420449
517	NC_010159	GTG	2	6	39483	39488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420449
518	NC_010159	TGC	2	6	39519	39524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420449
519	NC_010159	GAA	2	6	39615	39620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420449
520	NC_010159	CTT	2	6	39629	39634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420449
521	NC_010159	CTGA	2	8	39636	39643	25 %	25 %	25 %	25 %	162420449
522	NC_010159	TCA	2	6	39661	39666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420449
523	NC_010159	ATG	2	6	39667	39672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420449
524	NC_010159	G	6	6	39680	39685	0 %	0 %	100 %	0 %	162420449
525	NC_010159	CGT	2	6	39705	39710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420449
526	NC_010159	CTG	3	9	39758	39766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420449
527	NC_010159	TGAG	2	8	39887	39894	25 %	25 %	50 %	0 %	162420449
528	NC_010159	T	6	6	39951	39956	0 %	100 %	0 %	0 %	162420449
529	NC_010159	CTG	2	6	39981	39986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420449
530	NC_010159	CAGC	2	8	40056	40063	25 %	0 %	25 %	50 %	162420449
531	NC_010159	ACCTT	2	10	40174	40183	20 %	40 %	0 %	40 %	162420449
532	NC_010159	GA	3	6	40217	40222	50 %	0 %	50 %	0 %	162420449
533	NC_010159	ACA	2	6	40322	40327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420449
534	NC_010159	CG	3	6	40331	40336	0 %	0 %	50 %	50 %	162420449
535	NC_010159	CAC	2	6	40340	40345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420449
536	NC_010159	AAG	2	6	40348	40353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420449
537	NC_010159	GTC	2	6	40505	40510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420449
538	NC_010159	CGAAC	2	10	40523	40532	40 %	0 %	20 %	40 %	162420449
539	NC_010159	GCTCCT	2	12	40538	40549	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	162420449
540	NC_010159	GA	4	8	40558	40565	50 %	0 %	50 %	0 %	162420449
541	NC_010159	GAAT	2	8	40568	40575	50 %	25 %	25 %	0 %	162420449
542	NC_010159	GCGA	2	8	40623	40630	25 %	0 %	50 %	25 %	162420449
543	NC_010159	CAG	2	6	40715	40720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420449
544	NC_010159	GGC	2	6	40738	40743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420449
545	NC_010159	ATT	2	6	41184	41189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421692
546	NC_010159	ATG	2	6	41256	41261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421692
547	NC_010159	CAT	2	6	41270	41275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421692
548	NC_010159	TA	3	6	41322	41327	50 %	50 %	0 %	0 %	162421692
549	NC_010159	CAA	2	6	41383	41388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421692
550	NC_010159	AGG	2	6	41436	41441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162421692
551	NC_010159	GTG	2	6	41453	41458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421692
552	NC_010159	GC	3	6	41463	41468	0 %	0 %	50 %	50 %	162421692
553	NC_010159	T	7	7	41485	41491	0 %	100 %	0 %	0 %	162421692
554	NC_010159	TTTG	2	8	41504	41511	0 %	75 %	25 %	0 %	162421692
555	NC_010159	GA	3	6	41517	41522	50 %	0 %	50 %	0 %	162421692
556	NC_010159	CGA	2	6	41577	41582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421692
557	NC_010159	GAT	2	6	41585	41590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421692
558	NC_010159	GCA	2	6	41623	41628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421692
559	NC_010159	A	6	6	41658	41663	100 %	0 %	0 %	0 %	162421692
560	NC_010159	ACC	2	6	41705	41710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421692
561	NC_010159	TGC	2	6	41808	41813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421692
562	NC_010159	ATT	2	6	41837	41842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421692
563	NC_010159	GGC	2	6	41883	41888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421692
564	NC_010159	TGAGT	2	10	41902	41911	20 %	40 %	40 %	0 %	162421692
565	NC_010159	TGC	2	6	42027	42032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421692
566	NC_010159	TAAT	2	8	42058	42065	50 %	50 %	0 %	0 %	162421692
567	NC_010159	CTG	2	6	42207	42212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421773
568	NC_010159	TGAT	2	8	42242	42249	25 %	50 %	25 %	0 %	162421773
569	NC_010159	TTG	2	6	42250	42255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421773
570	NC_010159	AG	3	6	42278	42283	50 %	0 %	50 %	0 %	162421773
571	NC_010159	GGGT	2	8	42291	42298	0 %	25 %	75 %	0 %	162421773
572	NC_010159	A	6	6	42392	42397	100 %	0 %	0 %	0 %	162421773
573	NC_010159	CTG	2	6	42520	42525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421773
574	NC_010159	TTA	2	6	42569	42574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421773
575	NC_010159	TGC	2	6	42651	42656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421773
576	NC_010159	CTG	2	6	42657	42662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421773
577	NC_010159	TGTT	2	8	42769	42776	0 %	75 %	25 %	0 %	162421773
578	NC_010159	TAA	2	6	42984	42989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421773
579	NC_010159	CAT	2	6	43017	43022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421773
580	NC_010159	T	6	6	43055	43060	0 %	100 %	0 %	0 %	162421773
581	NC_010159	CAT	2	6	43074	43079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421773
582	NC_010159	CAGCC	2	10	43083	43092	20 %	0 %	20 %	60 %	162421773
583	NC_010159	ATCA	2	8	43111	43118	50 %	25 %	0 %	25 %	162421773
584	NC_010159	ATT	2	6	43159	43164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421773
585	NC_010159	TCT	2	6	43172	43177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421773
586	NC_010159	GTT	2	6	43187	43192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421773
587	NC_010159	CAG	2	6	43242	43247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421773
588	NC_010159	GGTCAG	2	12	43300	43311	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	162421773
589	NC_010159	C	6	6	43447	43452	0 %	0 %	0 %	100 %	162421773
590	NC_010159	CTGG	2	8	43480	43487	0 %	25 %	50 %	25 %	162421773
591	NC_010159	T	6	6	43493	43498	0 %	100 %	0 %	0 %	162421773
592	NC_010159	TCAG	2	8	43628	43635	25 %	25 %	25 %	25 %	162421773
593	NC_010159	CTG	2	6	43663	43668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421773
594	NC_010159	GAT	2	6	43746	43751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421773
595	NC_010159	AG	4	8	43763	43770	50 %	0 %	50 %	0 %	162421773
596	NC_010159	AGCC	2	8	43805	43812	25 %	0 %	25 %	50 %	162421773
597	NC_010159	AGCAC	2	10	43842	43851	40 %	0 %	20 %	40 %	162421773
598	NC_010159	CAG	2	6	43867	43872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421773
599	NC_010159	AGC	2	6	43883	43888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421773
600	NC_010159	TAAGT	2	10	44077	44086	40 %	40 %	20 %	0 %	162418696
601	NC_010159	AGA	2	6	44119	44124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418696
602	NC_010159	GCT	2	6	44169	44174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418696
603	NC_010159	TGC	2	6	44324	44329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418696
604	NC_010159	CAG	2	6	44343	44348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418696
605	NC_010159	ATG	2	6	44363	44368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418696
606	NC_010159	ATT	2	6	44372	44377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418696
607	NC_010159	CAA	2	6	44382	44387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418696
608	NC_010159	ATT	2	6	44431	44436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418696
609	NC_010159	AT	3	6	44528	44533	50 %	50 %	0 %	0 %	162418696
610	NC_010159	GGC	2	6	44706	44711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418696
611	NC_010159	TAA	3	9	44842	44850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418696
612	NC_010159	ACC	3	9	44893	44901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418696
613	NC_010159	ATC	2	6	44942	44947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418696
614	NC_010159	ATA	2	6	44975	44980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418696
615	NC_010159	GCA	2	6	44994	44999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418696
616	NC_010159	GCC	2	6	45053	45058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418696
617	NC_010159	ATC	2	6	45059	45064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418696
618	NC_010159	T	6	6	45086	45091	0 %	100 %	0 %	0 %	162418696
619	NC_010159	C	7	7	45100	45106	0 %	0 %	0 %	100 %	162418696
620	NC_010159	TAA	2	6	45228	45233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418696
621	NC_010159	TCT	2	6	45245	45250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418696
622	NC_010159	CAA	2	6	45300	45305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418696
623	NC_010159	CGGT	2	8	45355	45362	0 %	25 %	50 %	25 %	162418696
624	NC_010159	GGT	2	6	45369	45374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418696
625	NC_010159	GGT	2	6	45799	45804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418297
626	NC_010159	TGG	2	6	45809	45814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418297
627	NC_010159	ATG	2	6	45820	45825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418297
628	NC_010159	AGA	2	6	45836	45841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418297
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